Likit biyopsilerin oral premalign ve malign lezyonlarda tanı amaçlı kullanımı
Diagnostic use of liquid biopies in oral premalign and malign lesions
- Tez No: 779791
- Danışmanlar: PROF. DR. LEYLA AÇIK, PROF. DR. SİBEL ELİF GÜLTEKİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Diş Hekimliği, Patoloji, Dentistry, Pathology
- Anahtar Kelimeler: Ağız neoplazmları, Likit biyopsi, Mikro RNA, Mouth neoplasms, Liquid biopsies, Micro RNA
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Oral Skuamöz Hücreli Karsinom (OSHK) genetik (delesyon, insersiyon, mutasyon), epigenetik (mikroRNAlardaki düzensizlikler) ve çevresel faktörlere (HPV, sigara, alkol, UV) bağlı olarak gelişen, gen-çevre etkileşimini gösteren en iyi kanser türlerinden biridir. Dünyadaki yıllık baş-boyun kanserinin %30'unu, ağız kanserlerinin %90'ını oluşturmaktadır ve 5 yıllık sağ kalım oranı %35-50'dir. Oral potansiyel malign lezyon (OPML) da tıpkı OSHK gibi gen-çevre etkileşimden etkilenen kanser öncüsü lezyonların genel adıdır. Çalışma materyalimizi oluşturan kan ve tükürük; minimal invaziv, temini kolay, takibi mümkün kılan biyolojik sıvılardır. Bu hasta gruplarında gerek tanı ve tedavi gerekse prognoz değerlendirmesi için kullanılabilecek biyobelirteçlerin kan ve tükürük gibi likit biyopsi örneklerinde tespit edilmesi oldukça önemlidir. Bu tez çalışmasının amacı; OSHK hastaları (n=14), OPML (n=14) hastaları ve sağlıklı mukozaya (n=14) sahip kontrol grubu arasında miR-21, miR-208a-3p ve PDCD4'ün tükürük ve kan da ifade seviyelerinde ölçülmesi, OSHK ve OPML açısından biyobelirteçlerin araştırılmasıdır. miRNA ve PDCD4 ifade seviyeleri kantitatif PCR ile incelenmiştir. miRNA ve PDCD4 ifade seviyeleri sırasıyla U6 ve ActB ile normalize edilerek; OSHK hastaları, OPML hastaları ile sağlıklı kontroller karşılaştırılmıştır. Çalışmamız OSHK hastaları ve OPML hastalarının kan ve tükürük örneklerinde miR-208a-3p ve PDCD4 geninin araştırıldığı ilk çalışmadır. Verilerimize göre OSHK hastalarının kan ve tükürük örneklerinde kontrollere göre miR-21 seviyesi daha yüksek bulunurken (p<0,05), PDCD4 geni ise düşük ifade edilmiştir (p<0,05). OPML hastalarında miR-21 seviyesi OSHK hastalarındaki gibi kontrollerden daha yüksek saptanmış ve PDCD4 ifadesi de düşük çıkmıştır (p<0,05). OSHK ve OPML hastalarından elde edilen kan ve tükürük örneklerinde ise miR-208a-3p'nin ifade edilmediği gözlenmiştir. OPML hastalarında miR-21 ve PDCD4 seviyelerinin OPML hastalarında OSHK gelişimi açısından değerlendirilerek takip edilmesinin faydalı olacağı düşünülmektedir. Hastadan temin edilecek kan veya tükürük örneğiyle çalışan bu biyobelirteçlere spesifik tanı kitlerinin geliştirilmesi hastalığın takibi açısından oldukça önemlidir.
Özet (Çeviri)
Oral Squamous Cell Carcinoma (OSCC) is one of the best cancer types showing gene-environment interaction, which develops due to genetic (deletion, insertion, mutation), epigenetic (irregularities in microRNAs) and environmental factors (HPV, smoking, alcohol, UV). It constitutes 30% of annual head and neck cancers and 90% of oral cancers in the world, and the 5-year survival rate is 35-50%. Oral potential malignant lesion (OPML) is the general name of precancerous lesions that are affected by gene-environment interaction, just like OSCC. The blood and saliva that make up our study material; They are minimally invasive, easy to obtain, biological fluids that enable follow-up. It is very important to detect biomarkers that can be used for diagnosis and treatment and prognosis evaluation in these patient groups in liquid biopsy samples such as blood and saliva. The aim of this thesis study; Measurement of miR-21, miR-208a-3p and PDCD4 in saliva and blood expression levels among OSCC patients (n=14), OPML (n=14) patients, and healthy mucosa (n=14) control group, OSCC and the search for biomarkers in terms of OPML. miRNA and PDCD4 expression levels were examined by quantitative PCR. miRNA and PDCD4 expression levels were U6 and ActB; OSCC patients, OPML patients and healthy controls were compared.in blood and saliva samples of OSCC patients and OPML patients PDCD4 genes. According to our data, the blood and saliva samples of OSCC patients had higher miR-21 levels than controls (p<0.05), PDCD4 gene was expressed low (p<0.05). MiR-21 level was found to be higher in OPML patients than in controls, as in OSCC patients, and PDCD4 expression was also low (p<0.05). It was observed that miR-208a-3p was not expressed in blood and saliva samples obtained from OSCC and OPML patients. miR-21 and PDCD4. It is thought that it would be beneficial to evaluate. The development of specific diagnostic kits for these biomarkers that work with blood or saliva samples to be obtained from the patient is very important for the follow-up of the disease.
Benzer Tezler
- Bazal hücreli karsinoma tedavisinde kriyocerrahinin etkinliği
The Efficacy of the cryosurgery on basal cell carcinoma
EMEL ÇALIKOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1998
DermatolojiAnkara ÜniversitesiDermatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CENGİZHAN ERDEM
- The role of oxidative stress factors in the pathophysiology of Ocular Rosacea, analysis of tears and other materials
Oküler Rosacea patofizyolojisinde oksidatif stres faktörlerinin rolü, gözyaşı ve diğer materyallerin analizi
NİLÜFER YEŞİLIRMAK
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaGazi ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NESLİHAN BUKAN
PROF. DR. JEAN-LOUIS BOURGES
- Development of a mems-based microfluidic electrochemical biosensor for the detection of circulating tumor DNA
Dolaşimdaki tümör DNA tespiti için mems tabanli mikroakişkan elektrokimyasal biyosensör geliştirilmesi
ZEYNEP ÇAĞLAYAN ARSLAN
Doktora
İngilizce
2025
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiElektrik ve Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK KÜLAH
- Akciğer kanserlerinde likid biyopsinin prognostik ve prediktif rolü
Prognostic and predictive role of liquid biopsy in lung cancers
TUNCAY GÖKSEL
- Kanserde biyobelirteç tespitine yönelik somatik ve germ-line tüm genom dizileme, transkriptom profilleme ve karşılaştırmalı biyoinformatik analizleri
Whole genome and transcriptome profilling for cancer biomarker detection via comparison of somatic versus germ/line variants and its bioinformatic analysis
İBRAHİM BOGA