Geri Dön

Molecular study and PCR-RFLP analysis of Klebsiella pneumoniae isolated from Iraqi patients

Iraklı hastalardan izole edilen Klebsiella pneumoniae'nin moleküler çalışması ve PCR-RFLP analizi

PDF İndir

  1. Tez No: 779240
  2. Yazar: ZAINAB ALI CHALLOOB KINANI
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SONGÜL ŞAHİN, DR. ÖĞR. ÜYESİ ILHAM ABDULHADİ KHALAF AL-RUBAYE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Dizi analizi, Klebsiella pneumoniae, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Sequence analysis, Klebsiella pneumoniae, Polymerase chain reaction
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışma, idrar yolu enfeksiyonu olan hastalardan K. pneumoniae izolatlarının izolasyonu ve tanımlanmasına odaklanmıştır. Bağdat'taki üç hastaneden 62 izolatı (32 kadın, 30 erkek) K. pneumoniae klinik orta akım idrar örnekleri toplanmıştır. Bakterilerin teşhisi kültür, gram boyama, biyokimyasal testler ve VITEK2 ile yapıldı. Hipermukoviskozite suşlarını tespit etmek için bir dizi testi yapıldı. Sonuç, 4 (%6.45) izolat HV +ve idi. 20 antibiyotik kullanılarak duyarlılık testi yapıldı. izolatlar şunlara daha dirençliydi: Ticarcillin 60 (%96.77), Piperasilin 55 (%88.70), Aztreonam 54 (%87.09), Ceftazidime54 (%87.09), Cefepime53 (%85.48), Trimetoprim /Sulfamethoxazole 44 (%70.96), Ceftriaxone 48 (%77,41). 16SrRNA ve magA genlerinin spesifik primerler tarafından tespiti için bir PCR kullanıldı. Sonuçlar (%100), 6 (%9.68), 16SrRNA ve magA için pozitifti. MagA tespiti 4 (%6.45) HV+ve olduğunu gösterdi. Kısmi 16SrRNA'nın spesifik primerler tarafından amplifikasyonu için bir PCR kullanıldı. Ürünlere RFLP-PCR tekniği uygulandı. Alu1 ve Pst1 kısıtlama enzimleri kullanıldı. Kaydedilen sonuçlar (%100) Alu1 için pozitifti. Ve iki tür farklı bölünme paterni ortaya çıktı: İzolatların 40'ında (%64.52) A1. İzolatların 22'sinde (%35.48) ise A2 bulundu. İzolatların 2'si (%3,23) pst1 pozitif ve izolatların %96,77'si pst1 negatif

Özet (Çeviri)

This study focused on the isolation and identification of K. pneumoniae isolates from patients with urinary tract infections. 62 isolates (32 women, 30 men) of K. pneumoniae clinical specimens of mid-stream urine were collected from three hospitals in Baghdad. The diagnosis of bacteria was done by culture, gram stain, biochemical tests, and VITEK2. A string test was done to detect the hypermucoviscosity strains. The result was, 4 (6.45%) isolates were HV +ve. A sensitivity test was done by using 20 antibiotics. the isolates were more resistant to: Ticarcillin 60 (96.77%), Piperacillin 55 (88.70%), Aztreonam 54 (87.09%), Ceftazidime54 (87.09%), Cefepime53 (85.48%), Trimethoprim/Sulfamethoxazole 44 (70.96%), Ceftriaxone 48 (77.41%). A PCR was used for the detection of 16SrRNA and magA genes by specific primers. The results (100%), 6 (9.68%), were positive for 16SrRNA and magA. The magA detection showed 4 (6.45%) were HV+ve. A PCR was used for the amplification of partial 16SrRNA by the primers specific. The RFLP-PCR technique was done for the products. Alu1 and Pst1 restriction enzymes were used. The results recorded (100%) were positive for Alu1. And two types of distinct patterns of cleavages appeared: A1 in 40 (64.52%) of isolates. And A2 in 22 (35.48%) of the isolates. 2 (3.23%) of isolates were pst1 positive and 96.77% of isolates were pst1 negative

Benzer Tezler

  1. Tez No

    268171

    Klinik örneklerden izole edilen K. pneumoniae suşlarında genişlemiş spektrumlu beta laktamaz enzim varlığının PCR-RFLP yöntemi ile araştırılması

    Investigation of extended spectrum beta lactamase enzyme with PCR-RFLP in K. pneumoniae strains isolated from clinical samples

    EBRU YILMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    MikrobiyolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜVEN URAZ

  2. Tez No

    272466

    Balıklarda ve sularda mikobakterilerin PCR-RFLP ile incelenmesi

    Detection of mycobacteria infish and water by PCR-RFLP analysis

    BÜLENT BAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. K. SERDAR DİKER

  3. Tez No

    185629

    Kompleman bileşen C4A ve C4B genlerindeki rodgers ve chido belirleyicilerin PCR, DNA sekans ve rflp teknikleri ile analizi

    PCR, DNA sequence and rflp analysis of the rodger and chido determinants of the complement component C4A and C4B genes

    BURCU AKIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. REYHAN ÖNER

  4. Tez No

    90338

    Sağlıklı kişilerde ve lenfoproliferatif bozukluğu olan kanserli hastalarda HHV-6 virusunun IFA yöntemi ile antikor dağılımı ve PCR-RFLP yöntemi ile varyant analizi

    The Antibody prevalence of HHV-6 virus in healthy individuals and in lymphoproliferative disorders patients by IFA and variant analysis by PCR-RFLP method

    GÜLNUR TARHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    MikrobiyolojiGazi Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. SEMRA KUŞTİMUR

  5. Tez No

    164682

    Spinal misküler atrofi hastalarında SMN geni ekzon 7 ve 8`in moleküler analizi

    Molecular analysis of exon 7 and 8 of SMN gene spinal muscular atrophy patients

    SABRİYE KOCATÜRK SEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Tıbbi BiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. HALİL KASAP

Geri Dön