Transcriptomic analysis of the effect of DR4/5 death receptor activation on the differentiation of primary human monocytes to M1 macrophages
Ölüm reseptörü aktivasyonunun primer insan monositlerinin M1 makrofajlarına dönüşmesine etkisinin transkriptomik analizi
- Tez No: 775911
- Danışmanlar: DOÇ. DR. DUYGU SAĞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Allerji ve İmmünoloji, Biyoloji, Biyoistatistik, Allergy and Immunology, Biology, Biostatistics
- Anahtar Kelimeler: TRAIL, ölüm reseptörleri, monosit, makrofaj, Makrofajlar, Monositler, Tümör ilişkili apoptozu indükleyen ligand, Monocytes, macrophages, TRAIL, death receptorsDR4/5, Tumor related apoptosis inducing ligand
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
TNF ile ilişkili apoptoz indükleyici ligand (TRAIL), TNF ailesinin bir üyesidir ve apoptozu veya sağ kalım yolaklarını aktive eder. TRAIL'ın normal hücreleri etkilemeden kötü huylu hücrelerde apoptozu indükleme yeteneği, TRAIL'ın kanser tedavisinde kullanılmasının önünü açmıştır. Makrofajlar hem inflamasyona yanıt verirler hem de doku homeostazının korunmasında rol oynarlar. Dolaşımdaki monositler dokuda makrofajlara (M0) dönüşürler ve bu makrofajlar uyaranlara bağlı olarak M1 (proinflamatuar) ya da M2 (antiinflamatuar) makrofajlara polarize olurlar. TRAIL'ın kanser üzerindeki etkisi bilindiği halde monositler/makrofajlar üzerindeki etkisi tam olarak aydınlatılmamıştır. Bu çalışmada, TRAIL sinyalinin primer insan monositlerinin M0 ve M1 makrofajlarına farklılaşması üzerindeki transkripsiyonel etkisi araştırılmaktadır. İnsan primer monositlerinin bir kısmı yedi gün boyunca sadece M-CSF ile inkübe edilirken diğer kısım M-CSF ve TRAIL ile inkübe edilmiştir. Yedinci günün sonunda, makrofajların bir kısmı M1 makrofajlarına polarize edilirken bir kısmı da polarize edilmedi. TRAIL ile uyarılan makrofajların gen düzeyindeki ifade değişikliklerini incelemek için RNA dizilimi yöntemi kullanıldı. Bu analizin sonucunda değişiklik gösteren genlerin doğrulanması qPCR yöntemi ile yapıldı. CXCL11 ve TNF sitokinlerinin konsantrasyonu ELISA yöntemi ile ölçüldü. Makrofaj farklılaşması sırasında TRAIL stimülasyonu, M0 makrofajlarında CXCL9 ve TNF ifadesini arttırırken, CXCL8 ve CXCL5 ifadesini azalttı. Bunun yanı sıra, M1 makrofajlarında HGF ve PACERR ifadesini azaltırken, TNF'nın mRNA ve protein seviyesini arttırmıştır. CXCL11'in gen ifadesinde düşüş gözlemlenirken protein seviyesi artmıştır. Özetle, sonuçlarımız makrofaj farklılaşması sırasında TRAIL-DR4/5 sinyal aktivasyonunun monositleri M1 makrofajlarına farklılaşmaya yönlendirdiğini göstermektedir. Çalışmamız TRAIL'ı yeni bir modülatör olarak tanımlayarak monosit-makrofaj farklılaşma mekanizmasına yeni bir ışık tutmaktadır.
Özet (Çeviri)
TNF-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) is a member of the TNF family and induces either apoptosis or survival. Inducing apoptosis selectively in malignant cells without affecting normal cells makes TRAIL a promising agent for cancer therapy. Macrophages play key roles in both innate immune response and tissue homeostasis. Monocytes differentiate into unpolarized macrophages (M0) which are polarized into M1 (pro-inflammatory) or M2 (anti-inflammatory) macrophages depending on the stimuli. The effect of TRAIL on monocytes/macrophages is poorly understood. In this study, the transcriptional effect of TRAIL signaling on the differentiation of primary human monocytes to M0 and M1 macrophages is investigated. Primary human monocytes were either treated or untreated during differentiation into macrophages then the cells were either polarized to M1 macrophages or kept as unpolarized. To uncover the transcriptional differences in the TRAIL-treated macrophage group, RNA-sequencing was employed and differentially expressed genes were validated by qPCR. In addition, the level of CXCL11 and TNF in the cell supernatant was analyzed by ELISA. TRAIL stimulation during macrophage differentiation increased the expression of CXCL9 and TNF, whereas it decreased the expression of CXCL8 and CXCL5 in M0 macrophages. Moreover, the expression of HGF and PACERR was decreased in M1 macrophages, whilst both mRNA and protein levels of TNF and the protein level of CXCL11 were enhanced. In summary, our results show that TRAIL-DR4/5 signaling activation during macrophage differentiation drives monocytes to differentiate into M1-like macrophages. Our study sheds new light on mechanisms of monocyte-to-macrophage differentiation by defining TRAIL as a new modulator.
Benzer Tezler
- Transcriptomic analysis of the effect of trail on human macrophages in inducing T and NK cell activation and recruitment
İnsan makrofajlarında Trail'in T ve NK hücre aktivasyonu ve göçünü indüklemedeki etkisinin transkriptomik analizi
TALİHA İNAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DUYGU SAĞ
- Transcrıptomıc analysıs of the molecular mechanısm of traıl-medıated m1 polarızatıon ın human macrophages
İnsan makrofajlarında traıl kaynaklı m1 polarizasyonunun moleküler mekanizmasının transkriptomik analizi
SERHAT SONGÖREN
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
GenetikDokuz Eylül ÜniversitesiGenom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DUYGU SAĞ
- Saccharomyces cerevısıae TOR1 mutantlarında hücre döngüsünün transkriptomik analizi
Transcriptomic analysis of the cell cycle in Saccharomyces cerevisiae TOR1 mutants
İLKNUR NEZAHAT ÇILDIR
Doktora
Türkçe
2023
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TÜLAY TURGUT GENÇ
- Bor toksisitesine yanıt olarak bor toleranslı Triticum urartu genotipinin transkriptomik analizi
Transcriptomic analysis of the boron tolerant Triticum urartu genotype in response to boron toxicity
GÜL SEMA UYAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatSelçuk ÜniversitesiToprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MOHD KAMRAN KHAN
- Mısır (Zea mays L.) fidelerinde sistein teşvikli kadmiyum toleransının transkriptomik analizleri
Transcriptomic analysis of the cysteine-induced cadmium tolerance in maize (Zea mays L.) seedlings
YELİZ OPAK ÇOBAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA YILDIZ
DOÇ. DR. HAKAN TERZİ