Kırşehir yöresinde stomoxys türlerinin moleküler karakterizasyonu ve filogenetik analizleri
Molecular characterization and phylogenetic analyses of species of stomoxys from Kirşehir province
- Tez No: 774363
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ARİF ÇİLOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Stomoxys calcitrans, Moleküler karakterizasyon, Filogenetik analiz, Kırşehir, Stomoxys calcitrans, Molecular characterization, Phylogenetic analysis, Kırşehir
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, Kırşehir yöresinden toplanan Stomoxys sineklerinin morfolojik tür identifikasyonlarını takiben moleküler karakterizasyonlarının yapılması ve filogenetik yapılanmalarının ortaya konması amaçlanmıştır. Bu amaçla 2019-2020 yılları arasında Kırşehir yöresinde yer alan bir sığır işletmesinden 250 adet sinek örneği toplanmıştır. Yapılan morfolojik tür identifikasyonu sonucunda toplanan sineklerin tümünün Stomoxys calcitrans olduğu belirlenmiştir. Örneklenen türlerden genomik DNA izolasyonu gerçekleştirilmiş ve sonrasında genomik DNA izolatlarının mitokondriyal cytochrome c oxidase subunit I (mt-COI) ve cytochrome b (CytB) gen bölgelerini amplifiye eden primer çiftleriyle PCR analizleri yapılmıştır. Her gen bölgesi için 100 adet izolata ait amplikon spesifik primerlerle sekans analizlerine tabi tutulmuş ve hedef gen bölgeleri dizilimleri elde edilmiştir. Nükleotid dizileri belirlenen izolatların moleküler karakterizasyonları, her iki gen bölgesi için iki farklı haplotipin (ERUStocal1 ve ERUStocal2) varlığını ortaya koymuş ve bu haplotiplerin GenBank veri tabanı kayıtları gerçekleştirilmiştir (MZ285064-7). Elde edilen izolatların Dünya'daki diğer S. calcitrans izolatları ile çoklu hizalamaları yapılarak filogenetik analizleri gerçekleştirilmiştir. ERUStocal1 ve ERUStocal2'nin mt-COI gen bölgesi nükleotid kompozisyonlarına göre A + T içerikleri sırasıyla %72,3 ve %72,0 olarak tespit edilirken, CytB gen bölgesine göre bu oranlar sırasıyla %75,0 ve %75,2 olarak belirlenmiştir. Her iki gen bölgesine göre yapılan filogenetik analizler sonucunda elde edilen izolatların, çoğunluğunu Afrotropikal, Palearktik, Nearktik, Neotropikal ve Okyanusya zoocoğrafik bölgelerinden kaydedilen izolatların bulunduğu ana kümede yer aldığı görülmüştür. Sonuç olarak bu tez çalışması ile Türkiye'de ilk kez S. calcitrans'ın mt-COI ve CytB gen bölgeleri yönünden moleküler karakterizasyonu yapılmış ve filogenetik yapılanmaları ortaya konmuştur.
Özet (Çeviri)
In this study, it was aimed to perform morphological identification, molecular characterization, and phylogenetic analyses of Stomoxys flies collected from Kırşehir Province. For this aim, a total of 250 fly samples were collected from a cattle farm in the Kırşehir region between 2019-2020 years. The collected flies were morphologically identified as Stomoxys calcitrans. The genomic DNA was extracted and then the PCR analyzes were performed using the primer pairs that amplify the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (mt-COI) ve cytochrome b (CytB) gene regions. The amplicons of 100 isolates were sequenced using the specific primers and the sequences of the target gene regions were obtained. The nucleotide sequences of two gene regions revealed two haplotypes (ERUStocal1 and ERUStocal2). The haplotypes have been submitted to the GenBank database (MZ285064-7). The obtained isolates were aligned and the phylogenetic analyses were performed. A+T contents of the mt-COI gene region were calculated as %72.3 and %72.0 for ERUStocal1 and ERUStocal2, respectively. The A+T contents of the CytB gene region were also calculated as %75.0 and %75.2 for ERUStocal1 and ERUStocal2, respectively. The isolates clustered together with the isolates mostly from Afrotropical, Palearctic, Nearctic, Neotropical, and Oceania zoogeographic regions in the phylogenetic trees. In conclusion, the molecular characterization and phylogenetic constructions of mt-COI and CytB gene regions of S. calcitrans were revealed for the first time in Turkey with this study.
Benzer Tezler
- Kırşehir yöresinde bölgesel metamorfik kayaçlardaki 'granat-biyotit' jeotermometresi kullanılarak metamorfizma sıcaklığının belirlenmesi
Determination of temperature of metamorphism by using 'garnet-biotite' geotermometer at regional metamorphic rocks in Kırşehir region
GÜLÇİN TENEKECİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
Jeoloji MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. YAVUZ ERKAN
- Kırşehir (Boztepe) yöresinde doğal olarak yetişen alıç genotiplerinin bazı meyve özelliklerinin belirlenmesi
Determination of some fruit characteristics of hawthorn genotypes naturally growed in Kırşehir (Boztepe) region
GİZEM GÖZTAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELMA BOYACI
- Uzunpınar (Boztepe-Kırşehir) yöresinde metamorfiklere bağlı Zn-Pb cevherleşmesinin jeolojik özellikleri
Geological properties of metamorphic-hosted zinc-lead mineralisation in Uzunpınar (Boztepe, Kırşehir)
EMRE YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Jeoloji MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YURDAL GENÇ
- Orta Anadolu masifinin güney batısında (Kırşehir yöresinde) petrografik ve petrotektonik incelemeler
Başlık çevirisi yok
ÜMİT TOLLUOĞLU
Doktora
Türkçe
1986
Jeoloji MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. YAVUZ ERKAN
- Kırşehir bölgesinde tüketime sunulan fermente sucukların histolojik analizleri
Histological analysis of fermented sausages sold in Kirşehir region
SÜLEYMAN ÖZÇİÇEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Histoloji ve EmbriyolojiSelçuk ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT BOYDAK