Sıcaklık stresinin Arabidopsis thaliana tohumlarının yağ miktarı ve yağ asidi kompozisyonuna etkisinin epigenetik düzeyde incelenmesi
Investigation of the effects of heat stress on the oil content and fatty acid composition of Arabidopsis thaliana seeds at the epigenetic level
- Tez No: 762540
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÇAĞLA SÖNMEZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biyoloji, Genetik, Biotechnology, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Arabidopsis thaliana, Epigenetik, Sıcaklık stresi, Tohum yağları, Yağ asitleri, Arabidopsis thaliana, Epigenetic, Temperature stress, Seed oils, Fatty acids
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Konya Gıda ve Tarım Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bitkiler sıcaklık stresine maruz kalmaları halinde önemli fizyolojik ve morfolojik değişikliklere uğrarlar. Stres koşullarına adaptasyon sağlayabilmek amacıyla genetik ve epigenetik düzeyde birtakım değişiklikler geliştirler. Sıcaklık stresi altında bitkilerin tohum çimlenme oranında, yağ asidi kompozisyonunda artma veya azalma görülür. Bu tez çalışmasında yüksek sıcaklık stresine maruz bırakılan Arabidopsis thaliana bitkilerinin tohumlarındaki yağ miktarı ve yağ asidi kompozisyonlarında, strese maruz bırakılmayan bitkilere nazaran meydana gelen değişikliklerin belirlenmesi hedeflenmiştir. Strese maruz kalan bitkilerin tohumlarında yağ asidi sentezinde görevli genlerin (Fad2, Fad3,Fad6, Fad7, KAS I, KAS II, KAS III, DGAT 1, DGAT 2 ) anlatım düzeylerinin, strese maruz kalmayan bitkilerdeki genlerin anlatım düzeyleriyle karşılaştırılması; DNA metilasyon mutantlarında, histon deasetilaz 6 enzimini kodlayan HDA6 gen mutantında, H2A.Z varyantı mutantında yabani tipe göre sıcaklık stresi sonrası tohum yağ miktarı ve yağ asidi kompozisyonlarının ve yağ asidi sentezinde görevli genlerin anlatım düzeylerinin karşılaştırılması hedeflenmiştir. Yüksek lisans tezi kapsamında A. thaliana bitkilerinde stres koşullarına maruz kaldıklarında tohumlarında, siliklerinde ve bitki boylarında meydana gelen fizyolojik değişiklikler incelenmiş, strese maruz kalan bitkilerde yağ asidi sentezinde görevli genlerin ekspresyon seviyelerindeki farklılıklar karşılaştırılmıştır. Arabidopsis DNA metilasyon mutantlarında, histon deasetilaz 6 enzimini kodlayan HDA6 gen mutantında, H2A.Z varyantı mutantında yabani tipe göre sıcaklık stresi sonrası tohum yağ miktarı ve yağ asidi kompozisyonlarının değiştiği görülmüştür. Bu tez çalışması sıcaklık değişimine bağlı tohum miktarı ve yağ asidi kompozisyonlarında meydana gelen farklıkları ortaya koyması bakımından özgün değere sahiptir. Literatürde, sıcaklık stresinin tohum yağ miktarı ve yağ asidi kompozisyonları üzerindeki etkilerini epigenetik düzenlemeler ile ilişkilendiren bir çalışma mevcut değildir. Bu bakımdan bu tez çalışması özgün değer taşımaktadır.
Özet (Çeviri)
Plants undergo significant physiological and morphological changes when exposed to heat stress. They develop some changes at the genetic and epigenetic levels to adapt to the stress conditions. Under heat stress, an increase or decrease in seed germination rate and fatty acid composition of plants is observed. In this thesis, we aimed to determine the changes in oil content and fatty acid composition of seeds of Arabidopsis thaliana plants exposed to high temperature stress compared to plants not exposed to stress. To compare the expression levels of genes (Fad2, Fad3, Fad6, Fad7, KAS I, KAS II, KAS III, DGAT 1, DGAT 2) in seeds of plants exposed to the stress with the expression levels of genes in plants not exposed to the stress; The objective was to compare the amount of seed oil and fatty acid composition and the expression levels of genes involved in fatty acid synthesis in DNA methylation mutants, in the HDA6 gene mutant encoding the enzyme histone deacetylase 6 enzyme, and in the H2A.Z variant mutant after heat stress compared to wild type. The master's thesis examined the physiological changes in seeds, silique, and plant height of A. thaliana plants under stress conditions and compared the differences in the expression levels of genes involved in fatty acid synthesis from plants subjected to stress. It was found that the amount of seed oil and fatty acid composition changed in Arabidopsis DNA methylation mutants, in the HDA 6 gene mutant encoding the enzyme histone deacetylase 6 enzyme, and in the H2A.Z variant mutant compared with wild type under stress. This study is of unique value because it demonstrates the differences in seed quantity and fatty acid composition due to temperature changes. There is no study in the literature that links the effects of heat stress on seed oil content and fatty acid composition to epigenetic regulation. In this respect, this thesis has original value.
Benzer Tezler
- Arabidopsis thaliana SOS1 ve NHX1 transgeniklerinde tuz ve yüksek sıcaklık streslerine ilişkin markör gen ifade profilleri
Marker gene expression profiles of salt and high temperature stresses in Arabidopsis thaliana SOS1 and NHX1 transgenics
NİHAL KAHRAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NECLA PEHLİVAN GEDİK
- AtNHX1 VE SOS-1 genlerinin eş zamanlı ifadesi ile Arabidopsis Thaliana'da tuz stresi toleransının arttırılması
Increasing salt stress tolerance in Arabidopsis Thaliana BYAtNHX1 AND SOS-1 co-overexpression
NECLA PEHLİVAN
- Bitkisel kaynaklı potansiyel histon deasetilaz düzenleyicilerinin araştırılması
Investigation of plant based potential histone deacetylase regulators
BEKİR AHMET İLGAR
Doktora
Türkçe
2025
Genetikİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NESLİHAN TURGUT KARA
- Arabidopsis thaliana'da yüksek sıcaklık stres toleransında glioksalaz sistemi aracılığıyla sistein ve HSP90 proteinlerinin karşılıklı etkileşiminin araştırılması
Investigation of the interaction of cysteine and HSP90 proteins mediated by glyoxalase in high temperature stress tolerance in Arabidopsis thaliana
SELDA DURMUŞOĞLU
- Arabidopsis thaliana'nın endoplazmik retikulum stresine verdiği yanıtta cle peptidlerinin rolünün araştırılması
An investigation on the role of cle peptides in response to endoplasmic reticulum stress in Arabidopsis thaliana
BERİVAN ÖZLEM GÜMÜŞ