Kolorektal kanserle ilişkili olabilecek FADS1, BDNF ve NPY gen polimorfizmlerinin incelenmesi
Investigation of FADS1, BDNF and NPY gene polymophisms that may be related to colorectal cancer
- Tez No: 755749
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞAKİR ÜMİT ZEYBEK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Kolon hastalıkları, Kolon neoplazmları, Kolorektal neoplazmlar, Neoplazmlar, Nöropeptidler, Polimorfizm-genetik, Sinir büyüme faktörleri, Yağ asitleri, Colonic diseases, Colonic neoplasms, Colorectal neoplasms, Neoplasms, Neuropeptides, Polymorphism-genetic, Nerve growth factors, Fatty acids
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolorektal kanser, akciğer ve meme/prostat kanserlerinden sonra dünyada en yaygın görülen üçüncü kanser türüdür ayrıca kansere bağlı ölümlerde en çok görülenler arasında ikinci sıradadır. Hastalık süreci boyunca hem fizyolojik hem de morfolojik zorluklara maruz kalmalarından dolayı kolorektal kanserli hastaların % 50'sinin metastazdan öldüğü tahmin edilmektedir. Literatürde en çok karaciğer metastazı yaptığı bilinse de moleküler mekanizmaları hakkında hala tam olarak bir bilgi bulunmamaktadır. Kolorektal kansere yatkınlık ve bunun genetik ile ilişkisi araştırıldığında birçok genin sorumlu olduğu ortaya çıkmıştır. Çalışmamızda oluşturulan iki gruptan 84 örnek bulunduran kolorektal kanserli hasta grubu ve 81 örnek bulunduran sağlıklı kontrol grubu numunelerinde FADS1, BDNF ve NPY genlerinin polimorfizm açısından ilişkisinin incelenmesi hedeflenmiştir. Hasta ve kontrol gruplarındaki gen polimorfizmi, DNA izolasyonu ve PCR yöntemiyle yapılmış olup, sonuçlarımız SPSS ile değerlendirilmiştir. Araştırma sonucunda; BDNF geninin genotip dağılımı hasta grubunda %5,1 GG, %89,7 GA, %5,1 AA ve kontrol grubunda %3,9 GG, %93,5 GA, %2,6 AA bulunmuştur. Yapılan istatistik göre gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık görülememiştir. (p>0,05) NPY geninin genotip dağılımı hasta grubunda %3,8 AA, %93,8 AG, %2,5 GG ve kontrol grubunda %7,8 AA, %84,4 AG, %7,8 GG olarak saptanmıştır. Yapılan istatistiki analiz sonucuna göre gruplar arasında istatistiksel olarak bir anlam görülmemektedir. (p>0,05) FADS1 geninin genotip dağılımı ise hasta grubunda %7,8 TT, %90,6 GT, %1,6 GG ve kontrol grubunda %3,9 TT, %78,9 GT, %17,1 GG şeklinde belirlenmiştir. Hasta ve kontrol grubunun karşılaştırılması gerçekleştrildiğinde GG genotipi bakımından (p<0,003) anlamlı farklılık olduğu gözlenmiştir. Çalışmamızda incelenen FADS1, BDNF ve NPY genlerinin kolorektal kanser ile ilişkili literatürde polimorfizm çalışması bulunmadığından bu projenin verileri literatüre katkı sağlayan öncü veri olma özelliği göstermektedir. Çalışılan genlerden FADS1 geninin, varlığının koruyucu özellikte olabileceği ifade edilebilir. İstatistiksel olarak anlamlı olan bu genin ve ilgili genotipinin kolorektal kanser ile ilişkisi bulunmasına rağmen detaylı ve net sonuçlara ulaşabilmek için daha fazla sayıda örnekle detaylı çalışmaların yapılması önerilmektedir.
Özet (Çeviri)
Colorectal cancer is the third most common type of cancer in the world after lung and breast/prostate cancers, and it is the second most common cancer-related death. It is estimated that 50% of patients with colorectal cancer die from metastasis because they are exposed to both physiological and morphological challenges throughout the disease process. Although it is known in the literature that it mostly causes liver metastases, there is still no complete information about its molecular mechanisms. When the susceptibility to colorectal cancer and its relationship with genetics were investigated, many genes were found to be responsible. It was aimed to examine the relationship of FADS1, BDNF and NPY genes in terms of polymorphism in the colorectal cancer patient group with 84 samples and the healthy control group with 81 samples from the two groups formed in our study. Gene polymorphism, DNA isolation and Real-Time PCR method were performed in the patient and control groups, and our results were evaluated with SPSS. As a result of the research; the genotype distribution of the BDNF gene was 5.1% GG, 89.7% GA, 5.1% AA in the patient group and 3.9% GG, 93.5% GA, 2.6% AA in the control group. According to the statistical results, no statistically significant difference was found between the two groups. (p>0.05) The genotype distribution of the NPY gene was 3.8% AA, 93.8% AG, 2.5% GG in the patient group and 7.8% AA, 84.4% AG, 7.8% GG in the control group was detected. According to the results of the statistical analysis, there is no statistically significant difference between the two groups. (p>0.05) The genotype distribution of the FADS1 gene was 7.8% TT, 90.6% GT, 1.6% GG in the patient group and 3.9% TT, 78.9% GT, 17.1% in the control group. It is designated as GG. When the patient and control groups were compared, it was observed that there was a significant difference (p<0.003) in terms of GG genotype. Since there is no polymorphism study of the FADS1, BDNF and NPY genes examined in our study related to colorectal cancer in the literature, the data of this project show the feature of being a pioneering data that contributes to the literature. It can be stated that the presence of the FADS1 gene, one of the studied genes, may be protective. Although this statistically significant gene and its related genotype are associated with colorectal cancer, it is recommended to conduct different studies with more samples in order to reach detailed and clear results.
Benzer Tezler
- Determination of possible marker miRNA candidates in human colon cancer with bioinformatic analysis methods and investigation of target genes in colon cancer cell lines
Biyoinformatik analiz yöntemleriyle insan kolon kanserinde olası belirteç miRNA adaylarının belirlenmesi ve hedef genlerin kolon kanseri hücre hatlarında araştırılması
SARAH AHMED TULFAH
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM YILDIRIM
DR. ÖĞR. ÜYESİ PELİN TELKOPARAN AKILLILAR
- Variant detection in inflammatory diseases
İnflamatuvar hastalıklarda varyant belirlenmesi
GİZEM ALKURT
Doktora
İngilizce
2024
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Yeni nesil dizileme yöntemiyle solid tümör örneklerinde kanserle ilişkili genlere ait patojenik varyantların belirlenmesi ve hastalıkla olan ilişkisinin araştırılması
Identification of pathogenic variants in cancer-associated genes and investigation of their relationship with the disease in solid tumor samples using Next-Generation Sequencing(NGS) method
CANSU ÖĞE
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
GenetikKocaeli ÜniversitesiTıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NACİ ÇİNE
- Kolorektal adenomların malign transformasyonunda tümör mikroçevresinin ve mikroçevre ile ilişkili faktörlerden CD204, MFAP5 ve TİP 11 kollajen ekspresyonunun önemi
The importance of the tumor microenvironment and the microenvironment-related factors CD204, MFAP5 and TYPE 11 collagen expression in the malign transformation of colorectal adenomas
EVRİM EREL AKTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
PatolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSNİYE ESRA PAŞAOĞLU
- Kolorektal kanserli hastalarda serum d vitamini düzeyi ile D vitamini reseptör polimorfizmi ilişkisinin değerlendirilmesi
Evaluation of the relationship between serum vitamin D levels, vitamin D receptor polymorphisms and colorectal cancer
EMİNE YASSIBAŞ
Doktora
Türkçe
2016
OnkolojiHacettepe ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA GÜLHAN SAMUR