İndüklenmiş pluripotent kök hücre eldesinde çinkonun rolü
The role of zinc in obtaining induced pluripotency STEM cells
- Tez No: 752770
- Danışmanlar: PROF. DR. KAMİL CAN AKÇALI, PROF. DR. BELMA TURAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Epigenetik, Epigenez-genetik, Eritrositler, Kök hücreler, Transkripsiyon-genetik, Çinko, Epigenetic, Epigenesis-genetic, Erythrocytes, Stem cells, Transcription-genetic, Zinc
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kök Hücre ve Yenileyici Tıp Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
İndüklenmiş pluripotent kök hücreler, somatik hücrelerde Oct4, Sox2, Klf4, c-Myc transkripsiyon faktörlerinin ifadesinin viral veya viral olmayan yöntemlerle arttırılması ile elde edilirler. Somatik hücreler epigenetik düzeyde yeniden programlanırlar ve farklılaşmış hücrelerde bulunan epigenetik düzenlenmeler silinir. iPK hücreleri embriyonik kök hücrelerle benzer epigenetik düzenlenmelere sahiptirler. Bu epigenetik düzenlenmeleri hücrelere kendini yenileme ve birçok hücre soyuna farklılaşma özelliği kazandırmaktadır. Daha verimli oluşan iPK hücrelerinin embriyonik kök hücrelere daha benzer epigenetik belirteçlere sahip olması beklenmektedir. Epigenetik düzenlemeler hücre içinde histon modifikasyonlarını düzenleyen proteinler tarafından gerçekleştirilir. Bu proteinlerden çoğunda çinko parmak motifleri bulunmaktadır. Hücre içinde birçok biyokimyasal olayda önemli rolleri olan çinko aynı zamanda bu proteinler sayesinde epigenetik regülasyonları da etkileyebilmektedir. Bu sebeplerden epigenetik regülasyonların kontrolünde hedef genlerimiz çinko taşıyıcıları olacaktır. Çinko homeostazını da etkileyen çinko taşıyıcılarının ifadeleri ve hücre içi çinko değerleri de viral yolla elde edilen iPK hücre ve somatik hücre grupları arasında karşılaştırılacaktır. Çinko taşıyıcılarının iPK hücre grupları ve somatik hücre grupları arasındaki ifade faklılıkların araştırılması, bu gruplarlar arasındaki iPK eldesindeki epigenetik düzenlemelerin olası çinko homeostazı ile bağlantısını ortaya koymayı amaçlamaktadır.
Özet (Çeviri)
Induced pluripotent stem cells are obtained by increasing the expression of Oct4, Sox2, Klf4, c-Myc transcription factors in somatic cells by viral or non-viral methods. Somatic cells are reprogrammed at the epigenetic level and epigenetic arrangements found in differentiated cells are deleted. iPS cells have similar epigenetic arrangements with embryonic stem cells. These epigenetic arrangements give cells the ability to regenerate and differentiate many cell lines. The more efficiently formed iPS cells are expected to have epigenetic markers more similar to embryonic stem cells. Epigenetic regulations are carried out by proteins that regulate histone modifications within the cell. Most of these proteins have zinc finger motifs. Zinc, which has an important role in many biochemical events in the cell, can also affect epigenetic regulations thanks to these proteins. For these reasons, our target genes will be zinc carriers in the control of epigenetic regulations. Expressions of zinc transporters and intracellular zinc values, which also affect zinc homeostasis, will also be compared between iPS cell that are generated by viral methods and somatic cell groups. Investigation of the expression differences of zinc transporters between iPS cell groups and somatic cell groups aims to reveal the link between the epigenetic modifications in iPS acquisition between these groups and possible zinc homeostasis.
Benzer Tezler
- The genetic landscape of ALS/MND in Turkey and alsin protein-related motor neuron pathology in ipsc-derived cortical neurons
Türkiye'de ALS/MNH'nin genetik yapısı ve alsin proteini-ilişkili motor nöron patolojisinin ipkh-kaynaklı kortikal nöronlarda araştırılması
ELİF BAYRAKTAR
- İndüklenmiş pluripotent kök hücre tabanlı multiple skleroz modelinde oligodendrositlere özgü fenotiplerin araştırılması
Investigation of oligodendrocytes-specific phenotypes in induced pluripotent stem cell-based multiple sclerosis model
BURCU KURT VATANDAŞLAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Fizyolojiİstanbul Medipol ÜniversitesiSinir Bilim Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
YRD. DOÇ. DR. BİLAL ERSEN KERMAN
- İndüklenmiş pluripotent kök hücre kaynaklı kornea organoid modellerinin geliştirilmesi
Başlık çevirisi yok
NEVİN ERSOY
Doktora
Türkçe
2020
Histoloji ve EmbriyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSNÜ ALPER BAĞRIYANIK
- Increasing differentiation efficiency of human induced pluripotent stem cell derived lacrimal gland organoids
İnsan indüklenmiş pluripotent kök hücre kaynaklı lakrimal bez organoidlerinin farklılaşma verimliliğinin arttırılması
SUDE UYULGAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SİNAN GÜVEN
- Metabolomics analysis of human induced pluripotent stem cell derived lacrimal glands
İnsan indüklenmiş pluripotent kök hücre kaynaklı lakrimal bez organoidlerinin metabolomik analizi
VEDAT SARI
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiGenom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SİNAN GÜVEN
DOÇ. DR. DUYGU SAĞ