Borik asitin NFKB sinyali iletim yolağına etkisinin NFKB-GFP belirteç sistemi entegre edilmiş transgenic HEK293 hücre hattı kullanılarak çalışılması
Study of the effect of boric acid on the NFKB signal transduction pathway using the transgenic HEK293 cell line integrated with the NFKB-GFP marker system
- Tez No: 748462
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET KOÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Genetik, Medical Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Biyobelirteçler, Borik asit, Hücre dizisi, Nükleer faktör-kappa B, Sinyal nakli, Toksisite, İnflamasyon, Biomarkers, Boric acid, Cell line, Nuclear factor-kappa B, Signal transduction, Toxicity, Inflammation
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İnönü Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Araştırma, insan sağlığı üzerine birçok metabolik ve biyokimyasal etkisi olduğu bilinen borik asitin, inflamatuar yanıtların anahtar düzenleyicisi olan NF-κB yolağını regüle edebilme potansiyelini belirlemek amacıyla yapılmıştır. Materyal ve Metot: Bu araştırmada NF-κB-GFP belirteç sistemi entegre edilmiş transgenik HEK293 hücreleri model olarak kullanılmıştır. Bu doğrultuda, çalışma için uygun TNFα ve borik asit miktarları tespit edilmiştir. Ardından TNFα ile uyarılmış ve aktifleşmiş NF-κB sinyal iletim yolağına, kontrol grubuna kıyasla borik asitin etkisi incelenmiştir. Borik asitin NF-κB yolağını regüle edebilme kapasitesi akış sitometrik analizlerle belirlenmiştir. TNFα ve borik asit uygulanmış hücrelerin GFP yoğunluğunun ortalaması ve standart sapması, üç bağımsız biyolojik deneyden hesaplanmıştır. İstatistiksel testler için iki örneklem konum t-testi kullanılmıştır. Bulgular: Bu çalışmada kullanılan HEK293 hücrelerinin genomuna entegre GFP kaseti bulunduğundan, akış sitometrik analizlerle kontrol grubunda bir miktar GFP ekspresyonu gözlemlenmiştir. Belirli dozlarda TNFα verildiğinde, hücrelerde kontrol grubuna kıyasla 6-8 kat daha yoğun GFP ekspresyonu belirlenirken (p<0.0001), sadece borik asit uygulandığında, hücrelerde kontrol grubuna kıyasla eşit veya daha az yoğunlukta GFP ekspresyonu gözlemlenmiştir (p<0.05). TNFα ve farklı dozlarda borik asit birlikte verildiğinde ise, TNFα grubuna kıyasla GFP yoğunluğunun azaldığı gözlemlenmiştir (p<0.05). Sonuç: Analizler sonucunda, HEK293 hücrelerine tek başına borik asitin muamelesi kontrole kıyasla etkili bir fark oluşturmamışken, TNFα ile aktive edilen yolakta borik asit muamelesinin NF-κB aktivasyonunu azaltıcı yönde etkisi olduğu ortaya konmuştur.
Özet (Çeviri)
Aim: The research was carried out to determine the potential of boric acid, which is known to have many metabolic and biochemical effects on human health, to regulate the NF-kB pathway, which is a key regulator of inflammatory responses. Material and Method: In this study, transgenic HEK293 cells with integrated NF-κB-GFP marker system were used as a model. In this direction, suitable amounts of TNFα and boric acid were determined for the study. Then, the effect of boric acid on TNFα stimulated and activated NF-kB signal transduction pathway compared to the control group was investigated. The capacity of boric acid to regulate the NF-kB pathway was determined by flow cytometric analysis. The mean and standard deviation of the GFP density of TNFα and boric acid-treated cells were calculated from three independent biological experiments. Two-sample position t-test was used for statistical tests. Results: Since the HEK293 cells used in this study had a GFP cassette integrated into their genome, some GFP expression was observed in the control group by flow cytometric analysis. When given specific doses of TNFα, 6-8 times more intense GFP expression was determined in the cells compared to the control group (p<0.0001), while when only boric acid was applied, equal or less intense GFP expression was observed in the cells compared to the control group (p<0.05). When TNFα and different doses of boric acid were given together, it was observed that the GFP density decreased compared to the TNFα group (p<0.05). Conclusion: As a result of the analysis, it was revealed that boric acid treatment in HEK293 cells alone did not make an effective difference compared to the control, while boric acid treatment had a decreasing effect on NF-kB activation in the pathway activated by TNFα.
Benzer Tezler
- Formaldehit kullanılarak deneysel oksidatif stres oluşturulan A549 akciğer epitel hücrelerine farklı dozlarda uygulanan bor'un koruyucu etkinliğinin biyokimyasal ve moleküler biyoloji teknikleri ile araştırılması
The investigation of protective effect of boron on formaldehyde-induced experimental oxidative stress in A549 lung epithelial cells by using biochemical and molecular biology techniques
DAMLA ARSLAN ACARÖZ
Doktora
Türkçe
2017
Veteriner HekimliğiAfyon Kocatepe ÜniversitesiVeteriner Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NALAN BAYŞU SÖZBİLİR
- Siyatik sinir hasarında borik asit (Sodyum tetraborat) ve mezenkimal kök hücre (MKH) uygulamalarının sinir doku iyileşmesi üzerine etkisi
The effect of boric acid (Sodium tetraborate) and mesenchymal stem cell (MSC) applications on nerve tissue healing in sciatic nerve damage
MUHAMMED AKTOPRAK
- Borik asitin kristalizasyonu üzerine safsızlıkların etkisi
Effects of impurities on the crystallization of boric acid
CAHİT KARAKAYA
- Borik asitin kristal büyüme kinetiğinin tek kristal hücresinde incelenmesi
Crystal growth kinetics of boric acid in a single crystal cell
TUĞRUL KELEŞ
- Borik asitin yeni doğan sıçan beyin hücre kültürlerinde glutamatla oluşturulan nörotoksisiteye etkisi
The effect of boric acid on glutamate induced neurotoxicity on newborn rat brain cell cultures
ABDULLAH CANER GÜVEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Eczacılık ve FarmakolojiAtatürk ÜniversitesiFarmakoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET HACIMÜFTÜOĞLU