Cold tolerance related mi RNA expression patterns in cultivated and wild tomato genotypes
Bazı yabani ve kültür domates genotiplerinde soğuk toleransı ile ilgili miRNA ifade analizleri
- Tez No: 745531
- Danışmanlar: PROF. DR. HÜLYA İLBİ, DOÇ. DR. AYLİN KABAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Fizyolojik özellikler, Gen ifadesi, Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR), Mikro RNA, Soğuk stresi, Physiological properties, Gene expression, Reverse transcription polimerase chain reaction, Micro RNA, Cold stress
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Bitki Islahı Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kültür domatesi (Solanum lycopersicum L.), dünyada genetik ve moleküler ıslah çalışmalarında hedef bitki olarak kullanılan popüler sebzelerden biridir. Domates, tropik kökenli olduğu için soğuk stresine karşı hassastır. Soğuk stresi, bitkinin büyüme ve gelişmesine kolayca zarar verebilmektedir. Bu çalışmada, Solanum habrochaites (LA 1777) ve Solanum pimpinellifolium (LA 1579) yabani genotipleri ile Solanum lycopersicum cv. Anit F1 ve Solanum lycopersicum cv. Lice kültür çeşitlerinde, soğuk stresinin miRNA ifadeleri üzerine etkileri araştırılmıştır. Bu genotiplere ait genç bitkiler, 4°C'de 4, 6 ve 8 saat soğuk stresine maruz bırakıldıktan sonra miRNA 167, miRNA 169, miRNA 172, miRNA 393 ve miRNA 397'nin ekspresyon düzeyleri, Real-time PCR ile değerlendirilerek, bu miRNA'ların soğuk toleransı ile bağlantılı genlerin ekspresyonunu kontrol etmekten sorumlu olup olmadıkları araştırılmıştır. Ayrıca bu bitkilerde bazı morfo-fizyolojik özellikler de gözlenmiştir. S. habrochaites (LA 1777), S. pimpinellifolium (LA 1579) ve S. lycopersicum cv. Anit F1 genotiplerinde farklı soğuk stres seviyelerinde miRNA 167, 169 ve 172 ve 397'de önemli artış belirlenmiştir, Buna karşın, S. lycopersicum cv.Lice genotipinde bu miRNA'ların ifade düzeyinde artış belirlenmemiştir. Ayrıca bu çalışmada yaprak yaş ve kuru ağırlığı, kök yaş ve kuru ağırlığı, yaprak alan indeksi, klorofil içeriği ve çiçeklenme günündeki değişimler S. lycopersicum cv.Lice'de soğuk stresine bağlı olarak istatistiki önemde değişiklik göstermiştir. S. pimpinellifolium (LA 1579) genotipinde soğukla ilişkili miRNA ekspresyonu seviyeleri ve değerlendirilen morfo-fizyolojik parametrelerdeki önemli farklılıklar, bu genotipin soğuk stresine tolerant olabilceğini, buna karşın S. lycopersicum cv.Lice genotipinin soğuk stresine duyarlı olabileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
The cultivated tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the popular vegetables in the world that has been used as a target plant in genetic and molecular breeding studies. As this plant originated from the tropics, it is susceptible to chilling stress. Chilling stress can easily damage its growth and development. In the present study, The expression level of miRNA 167, miRNA 169, miRNA 172, miRNA 393, and miRNA 397 in wild genotypes of Solanum habrochaites (LA 1777) and Solanum pimpinellifolium (LA 1579) and cultivated genotypes of Solanum lycopersicum cv. Anit F1 and Solanum lycopersicum cv. Lice were assessed at 4, 6, and 8 hours after chilling treatment (4°C) via Real-time quantitative PCR to determine if these miRNAs are responsible for controlling the expression of the genes associated with chilling tolerance. Also, some morpho-physiological traits were observed in these plants. Significant upregulation of miRNA 167, 169 and 172, and 397 were observed at different levels of chilling stress in the tolerant genotypes of S. habrochaites (LA 1777) and S. lycopersicum cv. Anit F1. and also, in S. pimpinellifolium (LA 1579) while this level of up-regulation was not seen in S. lycopersicum cv. Lice. Also, the changes in the fresh and dry weight of leaf and root, specific leaf weight, leaf area index, the chlorophyll content, and flowering day measured in this study were significant in S. lycopersicum cv. Lice compared to the other genotypes. The observed levels of cold-related miRNA expression in S. pimpinellifolium (LA 1579) and significant differences in the evaluated morpho-physiological parameters indicated the tolerance of S. pimpinellifolium (LA 1579) and susceptibility of S. lycopersicum cv. Lice to chilling stress.
Benzer Tezler
- Identification of abiotic stress related mirnas in thellungiella halophila ecotypes
Thellungiella halophila ekotiplerinde abiyotik stresle ilişkili mirna'ların belirlenmesi
FERHUNDE AYSİN
Doktora
İngilizce
2015
BotanikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
- Doğal, tarihi kültürel açıdan turizm potansiyelini değerlendirme modeli: Ayvalık örneği
The tourism model for evaluation of natural, historical and cultural potential: A case of Ayvalık
İSMAİL HAKAN KOLCU
Yüksek Lisans
Türkçe
1993
Şehircilik ve Bölge Planlamaİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF. DR. VEDİA DÖKMECİ
- Köpeklerde campylobacter prevalansı ve tür dağılımı
The Prevalence and distribution of campylobacter sp. in dogs
ÜMİT CENK KAHRAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2001
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN YARDIMCI
- Diploid ve suni tetraploid adi otlak ayrığı (Agropyron cristatum (L.) Gaertn.)'da mitoz kromozomlarının yapısı ve mayoz bölünmenin tohum oluşumu ile ilgisi
The Structure of mitotic chromosomes and seed setting which relates of meiotic division in diploid and artificial tetraploid crested wheatgrass (Agropyron Cristatum (L.) Gaertn.)
AYŞE NİHAL GÖMÜRGEN
- Boru tesisatlarında ısıl gerilme analizi
Thermal stress analysis of the piping systems
SEMA AVCI
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMakine Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CEM PARMAKSIZOĞLU