Electrochemical detection of oxaliplatin induced DNA damage in G-quadruplex structures
G-quadruplex DNA yapılarında oxalıplatinin yarattığı dna hasarının elektrokimyasal tespiti
- Tez No: 742598
- Danışmanlar: PROF. DR. LEVENT KAMİL TOPPARE, DOÇ. DR. ÖZGÜL PERSİL ÇETİNKOL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: DNA hasarı, Diferensiyel puls voltametrisi, Elektroanalitik yöntemler, Oksaliplatin, DNA damage, Differential pulse voltammetry, Electroanalytical methods, Oxaliplatin
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Oksaliplatin kemoterapide kullanılan bir antikanser ajandır. Platin bazlı bir kemoterapötik ajan olan Oksaliplatin'in genelde adenin (A) veya guanin (G) bazlarının N7 bölgelerinde zincir içi ve arası çapraz bağlar oluşturarak DNA hasarını indüklediği bilinmektedir. Bu nedenle, yüksek dozda Oxaliplatin farklı yan etkilerin ortaya çıkmasına sebep olmaktadır. Bu yan etkilerin altında yatan moleküler mekanizmaları ve Oksaliplatin'e karşı gelişen ilaç direncini anlayabilmek için, Oksaliplatin'in ve neden olduğu hasarın hızlı bir şekilde kalitatif ve kantitatif olarak belirlenmesine ihtiyaç vardır. Elektrokimyasal yöntemler, duyarlılıkları, basitlikleri ve düşük maliyetleri nedeniyle tercih edilen tespit platformları arasında yer almaktadırlar. Bu çalışmada, altın nanoparçacık (Au-NP) ile modifiye edilmiş grafit elektrot üzerinde diferansiyel puls voltametrisi kullanılarak Oxaliplatin'in neden olduğu DNA hasarının tespiti için bir elektroanalitik platform geliştirilmiştir. Hazırlanan elektrotların yüzey karakterizasyonu, taramalı elektron mikroskobu ile gerçekleştirilmiştir. Oksaliplatin derişiminin artmasıyla guanin oksidasyon sinyalinin şiddetinin azalması, Oksaliplatinin DNA bazlarına bağlanmasının bir göstergesi olarak alınmış ve dinamik aralığı 1.0 μM ila 10.0 μM olan algılama platformunun geliştirilmesinde kullanılmıştır. Bu koşullar altında, Oksaliplatin kaynaklı DNA hasarının 1.0 μM Oksaliplatinin varlığında rahatça tespit edilebildiği belirlenmiştir.. Sonuç olarak, elde edilen verilerin gelecekteki çalışmalar için DNA-Oksaliplatin araştırmalarına yeni bir bakış açısı sunması öngörülmektedir.
Özet (Çeviri)
Oxaliplatin is an anticancer agent used in chemotherapy. As a platinum-based chemotherapeutic agent, it is known to induce DNA damage by generating intra- and inter-strand crosslinking mainly at N7 sites of adenine (A) or guanine (G) bases. Thus, a high dosage of Oxaliplatin results in different side effects. In order to understand the molecular mechanisms underlying these side effects and the drug resistance developing against Oxaliplatin, there is a need for rapid qualitative and quantitative determination of Oxaliplatin and the damage caused by it. Electrochemical based methods are one of the sensing platforms that can be preferred due to their sensitivity, simplicity and low cost. In this study, an electroanalytical platform for the detection of DNA damage caused by Oxaliplatin was constructed via using differential pulse voltammetry on gold nanoparticle (Au-NP)-modified graphite electrode. The surface characterization of the prepared electrodes was performed by scanning electron microscopy. The decrease in the intensity of the guanine oxidation signal with increasing Oxaliplatin concentration was taken as an indication of the binding of Oxaliplatin to DNA bases and used in the development of the detection platform with the dynamic range of 1.0 μM to 10.0 μM. The Oxaliplatin induced damage could be detected as low as at 1.0 μM Oxaliplatin concentration under the optimized conditions. These results in here are expected to offer new insights into the investigations of DNA-Oxaliplatin interactions in the future studies.
Benzer Tezler
- Okzaliplatinin elektrokimyasal özellikleri ve miktar tayini
Electrochemical behaviors and determination of oxaliplatin
MEHMET ASLAN
- Electrochemical detection of dna using poly(vinylferrocenium) modified electrodes
Poli(vinilferrosenyum) modifiye elektrotlar kullanılarak elektrokimyasal dna tayini
FİLİZ KURALAY
Doktora
İngilizce
2009
KimyaHacettepe ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERDAR ABACI
PROF. DR. HALUK ÖZYÖRÜK
- Electrochemical detection of miR21 in breast cancer cell lysates using conducting polymer polypyrrole, redox indicator meldola's blue and pencil graphite electrode
Meme kanser hücre hatlarındaki miR21'in iletken polimer polipirol, redoks indikator meldola mavisi ve kalem grafit electrot kullanarak elektrokimyasal tespiti
MERVE KAPLAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyolojiGediz ÜniversitesiNanoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET EMİN ŞENGÜN ÖZSÖZ
- Electrochemical detection of dopamine by using ferrocene labeled electrodes
Dopaminin ferrosen kaplı elektrot kullanarak elektrokimyasal tespiti
HÜSEYİN ŞAHİN
- Electrochemical detection of dopamine in the presence of excess ascorbic acid using glassy carbon electrodes modified with conducting polymers
İletken polimerler ile modifiye edilmiş camsı karbon elektrotlar kullanarak aşırı askorbik asit varlığında dopaminin elektrokimyasal tespiti
SAMET ŞANLI
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Polimer Bilim ve TeknolojisiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiPolimer Bilim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET MUHTAR ÖNAL
PROF. DR. MÜRVET VOLKAN
