Geri Dön

Characterization of a novel IRE1 substrate PACT and interacting miRNAs

IRE1 kinaz substratı PACT'ın ve bağlandığı miRNA'ların karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 739363
  2. Yazar: ASLI EKİN DOĞAN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EBRU ERBAY
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Adipoz doku, Endoplazmik retikulum stresi, Fosforilasyon, Mikro RNA, Organeller, Adipose tissue, Endoplasmic reticulum stress, Phosphorylation, Micro RNA, Organelles
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

RNA bağlayıcı protein, çift sarmallı RNA'ya bağlı protein kinaz aktivatörü A (PACT), RNA kaynaklı susturma kompleksinin (RISC), çekirdeklenmesi için membranöz bir platform sağlayarak merkezi bir rol oynayan Endoplazmik Retikuluma (ER) tutturur ve mikroRNA (miR) aracılı translasyonel baskıda rol alır. Önceki çalışmalar, ER stresin PACT fosforilasyonuna yol açarken aynı anda birçok miR'in ifadesinde değişikliklere neden olduğunu göstermiştir. Bu tez bulguları, PACT'ın hem ER stress altında hem de bazal koşullarda ER bağlantılı Inositol gerektiren enzim-1 (IRE1), (çift endoribonükleaz (RNaz) ve kinaz) tarafından fosforile edildiğini gösterir. ER stresin aktive ettiği IRE1 RNaz fonksiyonu, katlanmamış protein tepkisini (UPR) tetiklerken, fizyolojik koşullarda bazal IRE1 kinaz aktivitesinin işlevi veya hedefleri bilinmemektedir. Bu tezin bulguları fosforile edilmiş PACT'ın, mitokondriyal biyogenezin (mitobiyogenez) kilit düzenleyicilerinin ekspresyonunu baskılayan olgun miR-181c seviyelerini düzenlediğini göstermektedir. IRE1 ile fosforilasyon, PACT aracılı mitobiyogenez ve mitokondriyel oksijen kullanımının baskılanması için gereklidir. Farelerde kısmi PACT eksikliği, hücre kültüründe olduğu kadar in vivo olarak da kahverengi adipoz doku aktivasyonu sırasında daha güçlü mitobiyogeneze yol açar. Ayrıca, kardiyopulmoner baypas kaynaklı iskemi/perfüzyon hasarı, insan kalp dokusunda PACT protein ekspresyonunu azaltırken aynı zamanda mitokondriyal biyogenezi indükler. Toplu olarak, bu bulgular PACT-miR181c sinyal ekseninin mitokondriyal biyogenez ve enerjinin önemli bir düzenleyicisi olduğunu göstermektedir.

Özet (Çeviri)

The double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A (PACT) anchors the RNA-induced silencing complex (RISC) to the endoplasmic reticulum (ER)'s membranous platform where RISC nucleation occurs and thus, PACT plays a key role in microRNA (miR)-mediated translational repression. Previous studies have shown that ER stress leads to PACT phosphorylation while simultaneously inducing changes in the expression of many miRs. Here, we demonstrate that PACT is phosphorylated by the ER-resident Inositol-requiring enzyme-1 (IRE1), a bifunctional kinase/endoribonuclease (RNase), both under ER stress and no stress conditions. While the role of IRE1 as a stress-induced RNase driving the unfolded protein response (UPR) is well understood, the function or the target(s) of its kinase activity have remained unexplored. Findings of this thesis show that IRE1-mediated phosphorylation of PACT regulates mature miR-181c levels, which suppresses the expression of key regulators of mitochondrial biogenesis (mitobiogenesis). Phosphorylation by IRE1 causes PACT-mediated suppression of mitobiogenesis and respiration. Partial PACT-deficiency in mice leads to enhanced mitobiogenesis during brown fat activation in cells and mice. Furthermore, cardiopulmonary bypass-induced ischemia/reperfusion injury downregulates PACT protein expression in human hearts while simultaneously inducing mitobiogenesis. Collectively, these findings demonstrate PACT-miR-181c signaling axis is a key regulator of mitochondrial biogenesis and energetics.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    166406

    Characterization of a novel sporulation gene yvgW, in Bacillus subtilis

    Basillus subtilis`te bulunan yeni sporulasyon geni, yvgW`nun karakterizasyonu

    AYÇA GÜLÇİN ÜLGEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2005

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ

  2. Tez No

    338922

    Characterization of a novel R7-specific gene in the drosophila visual system

    Fotoalmaç-7 hücresine spesifik özgün genin sirke sineği görme sisteminde karakterizasyonu

    GÜNER KAÇMAZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    GenetikBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ARZU ÇELİK FUSS

  3. Tez No

    246245

    Characterization of C17orf45 as a novel target of the Wnt/B-catenin pathway

    Wnt/B-katenin yolağının yeni hedef geni olarak C17orf45'in karakterize edilmesi

    TUNCAY ŞEKER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2009

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. AHMET KOMAN

    YRD. DOÇ. NECLA BİRGÜL İYİSON

  4. Tez No

    765705

    Preliminary characterization of a novel mitochondrialmyopathy mouse model

    Yeni bir mitokondriyel miyopati faremodeli'nin ön karakterizasyonu

    MEHMET YILMAZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞÜKRÜ ANIL DOĞAN

  5. Tez No

    199485

    Functional characterization of Loc115098: A novel gene conserved in eukaryotic genomes

    Ökaryotik canlılarda korunmuş olan Loc115098 geninin işlevsel tanımlandırılması

    ESRA KARAKÖSE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    Biyokimyaİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. UYGAR HALİS TAZEBAY

Geri Dön