Klebsiella pneumoniae izolatlarının antibiyotik duyarlılık profillerinin kapsül genotipleriyle ilişkisinin araştırılması
Investigation of the relation of antibiotic susceptibility profiles of klebsiella pneumoniae i̇solates with capsule genotypes
- Tez No: 724476
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ TOĞRUL NAĞIYEV
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Antibiyotikler, Beta laktamazlar, Genotip, Klebsiella pneumoniae, Mikrobiyal duyarlılık testleri, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Antibiotics, Beta lactamases, Genotype, Klebsiella pneumoniae, Microbial sensitivity tests, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Klebsiella pneumoniae'nin enfeksiyon etkeni olarak sık görülmesinde en önemli sebeplerden biri bakteriyi fagositozdan ve serum bakterisidal proteinlerden koruyan majör virülans faktörü olan kapsül yapısıdır. Bir diğer sebep de bakterinin β-laktam antibiyotiklerine karşı ürettiği β-laktamaz enzimleridir. Çalışmamızda çeşitli klinik örneklerden izole edilen K. pneumoniae izolatlarının kapsül genotipleriyle antibiyotik duyarlılık profilleri arasındaki muhtemel ilişki araştırıldı. Bu amaçla; klinik örneklerden izole edilen Klebsiella pneumoniae izolatlarında spesifik primerler kullanılarak Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) yöntemi ile kapsül genotipleri (K1, K2, K5, K20, K54, K57) belirlenlendi. Antibiyotik duyarlılıkları fenotipik olarak disk difüzyon, moleküler olarak da PCR yöntemi ile Geniş Spektrumlu β-laktamaz (GSBL) (CTX-M1, CTX-M2, CTX-M9, CTX-M 8/25, KPC, NDM-1, OXA-48 like) genlerinin varlığı araştırıldı. Çalışmamıza Anabilim Dalımızda daha önce yürütülen çalışmada kapsül genotipleri belirlenmiş olan karbapeneme dirençli 27 K. pneumoniae izolatı ve kapsül genotipleri belirlenecek olan çeşitli klinik örneklerden izole edilen 180 K. pneumoniae izolatı dahil edildi. Çalışmamıza dahil ettiğimiz karbapeneme dirençli 27 K. pneumoniae izolatından 1 izolatın K1, 5 izolatın K2, 15 izolatın K5, 4 izolatın K20, 1 izolatın K54, 1 izolatın da K57 kapsül genotipine ait olduğu doğrulanırken, 180 K. pneumoniae izolatından 7'sinde K2, 3'ünde K20, 1'inde ise K1 kapsül genotipileri belirlendi. CTX-M1 geni kapsüler genotip K20'ye ait 3 izolatta tespit edildi. NDM-1 geni kapsüler genotip K5'e ait 3 izolatta ve K2'ye ait 1 izolatta belirlendi. OXA-48 like geni 24 izolatta kapsüler genotipler arasında heterojen dağılım gösterdi. CTX-M2, CTX-M9, CTX-M 8/25, KPC direnç genleri hiçbir izolatta tespit edilmedi. CTX-M1 genin K20 kapsül genotipiyle ilişkisi, AMC, TPZ, FOX, ETP antibiyotiklerinin K5 kapsül genotipiyle direnç ilişkisi, AMC, TPZ, IPM, TE, SXT antibiyotiklerinin K20 kapsül genotipleriyle duyarlılık ilişkisi, istatistiksel olarak anlamlı bulundu. Sonuç olarak, kapsül genotipleriyle GSBL direnç genleri arasındaki muhtemel ilişkinin bölgesel ve çok sayıdaki izolatın dahil edileceği çalışmalarla daha iyi aydınlatılacağını ve bu çalışmaların ilerdeki aşı çalışmalarına da ışık tutacağını düşünmekteyiz.
Özet (Çeviri)
One of the most important reasons for the frequent selection of Klebsiella pneumoniae is the factor that phagocytizes the bacteria and is the major virulence factor from serum bactericidal proteins. Another reason is β-lactamase enzymes for β-lactam immunity of bacteria. In our study, the possible relationship between the capsule genotypes and antibiotic susceptibility profiles of K. pneumoniae isolates isolated from various clinical specimens was investigated. To this end; Capsule genotypes (K1, K2, K5, K20, K54, K57) were determined by Polymerase Chain Reaction (PCR) method using specific primers in K. pneumoniae isolates isolated from clinical specimens. Antibiotic susceptibility phenotypically by disc diffusion and molecularly by PCR method for β-lactamase (ESBL) (CTX-M1, CTX-M2, CTX-M9, CTX-M 8/25, KPC, NDM-1, OXA-48) like) genes were investigated. In our study, 27 carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates whose capsule genotypes were determined in a previous study in our department and 180 K. pneumoniae isolates isolated from various clinical samples whose capsule genotypes were to be determined were included in our study. Carbapenem resistant 27 K. pneumoniae from which we included in our study 1 isolate isolate K1, 5 isolate K2, 15 isolate K5, 4 isolate K20, 1 isolate K54, 1 isolate K57 while confirming that the capsule genotype belongs. In 180 K. pneumoniae isolates, 7 isolates K2, 3 isolates K20, 1 isolate K1 capsules genotype were detected. The CTX-M1 gene was detected in 3 isolates belonging to the capsular genotype K20. The NDM - 1 gene was identified in 3 isolates belonging to the capsular genotype K5 and 1 isolate belonging to K2. The OXA-48 like gene showed heterogeneous distribution among capsular genotypes in 24 isolates. CTX-M2, CTX-M9, CTX-M 8/25, KPC resistance genes were not detected in any isolate. Relationship of CTX-M1 gene with K20 capsule genotype, resistance relationship of AMC, TPZ, FOX, ETP antibiotics with K5 capsule genotype, sensitivity relationship of AMC, TPZ, IPM, TE, SXT antibiotics with K20 capsule genotypes were found to be statistically significant. As a result, we believe that the possible relationship between capsule genotypes and GSBL resistance genes will be better illuminated by studies that will include a regional and large number of isolates, and these studies will also shed light on future vaccine studies.
Benzer Tezler
- Hastanemizde escherichia coli ve klebsiella pneumoniae bakterilerinde karbapenem direnç durumu
The resistance status of carbapenem on escherichia coli and klebsiella pheumoniae bacteria in our hospital
RESUL EKREM AKBULUT
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
MikrobiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ZAHİR BAKICI
- Kars yöresinde insanlarda üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen escherichia coli ve klebsiella pneumoniae suşlarında CTX-m, tem ve SHV tipi genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz aktivitesinin otomatize ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of CTX-M, tem and SHV TYPE extended spectrum beta-lactamase activity by automated and molecular methods in escherichia coli and klebsiella pneumoniae strains isolated from urinary track infections in humans in Kars Region, Turkey
SİBEL DENİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MikrobiyolojiKafkas ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİH BÜYÜK
- Klebsiella pneumoniae suşlarında antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi ve karbapenemaz direnç allellerinin araştırılması
Determination of antibiotic resistance profiles and investigation of carbapenemase resistance alleles in Klebsiella pneumaniae strains
ESİN KARAMAN
Doktora
Türkçe
2024
BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH ŞABAN BERİŞ
- Sığır mastitisi ve çevresel kaynaklı klebsiella pneumoniae suşlarının virulans faktörlerinin belirlenmesi
Determination of virulence factors of bovine mastitis and environmentally originated klebsiella pneumoniae strains
MEVLÜT ATALAY
Doktora
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiSelçuk ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UÇKUN SAİT UÇAN
- Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürü örneklerinden izole edilen mikroorganizmaların identifikasyonu, antibiyotik duyarlılıkları ve ESBL direnç durumunun araştırılması
Identification, antibiotic susceptibility and investigation of ESBL resistance of microorganisms isolated from blood culture samples of inpatients in intensive care units
OSMAN ORUÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASHABİL AYGAN