Investigation of novel recessive causative genes and gene/allele frequency for CMT disease in Turkey
Çekinik CMT hastalığı için yeni genlerin araştırılması ve Türkiye'de CMT yapıcı gen/alel sıklığı incelemesi
- Tez No: 693086
- Danışmanlar: PROF. DR. ESRA BATTALOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kalıtsal periferik nöropatiler, periferik sinir sistemini etkileyen genetik bir hastalıklar grubudur. En yaygın türü, klinik ve genetik çeşitliliği sebebiyle ilginç bir araştırma odağı oluşturan Charcot-Marie-Tooth (CMT) hastalığıdır. CMT ile ilişkilendirilmiş 90'dan fazla gen ve gen bölgesi otozomal baskın, otozomal çekinik, X'e bağlı ve mitokondriyal olarak kalıtılabilmektedir. Genetik tarama testlerinin gelişmişliğine rağmen, dünya çapında tüm CMT hastalarının yaklaşık %35'i moleküler tanı alamamaktadır. Otozomal çekinik CMT'de (OÇCMT) genetik tanı başarısı, çok sayıda nadir genin varlığı nedeniyle daha da düşüktür. Bu tanısal boşluk, henüz tanımlanmamış hastalık yapıcı genlerin varlığına ve Mendel-dışı kalıtım olasılığına işaret etmektedir. OÇCMT'ye sebep olan yeni gen/aleller tanımlamak ve bilinen hastalık yapıcı genlerin ülkemizdeki sıklığını belirlemek amacıyla, ebeveynleri akraba evliliği yapmış, erken başlangıçlı polinöropati ile ek klinik bulguları bulunan 56 CMT hastasını genetik açıdan analiz ettik. Tüm hastalarda GDAP1 geni taramasını takiben, tüm ekzom dizileme ve homozigotluk haritalaması yöntemlerini kullanarak 22 tekrarlayan, 13 yeni alel belirledik ve %62,5 oranında potansiyel genetik tanı oranı yakaladık. Ek olarak, FXN genini CMT ve Friedreich ataksi arasındaki spektrumda yer alan yeni bir hastalık, ATP8B3 genini OÇCMT2 ve SEPT11 genini aksonal polinöropatiyle seyreden serebellar ataksi için hastalık yapıcı aday genler olarak belirledik. Bu çalışma, Türkiye OÇCMT popülasyonunun genetik çerçevesini çizmekte ve yeni hastalık yapıcı mekanizmaları aydınlatmaya yardımcı olabilecek genler rapor etmektedir. Ayrıca, benzer genetik arka plana sahip toplumlara ozgü genetik tanı stratejileri için bir referans ortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
Inherited peripheral neuropathies are a group of genetic disorders of the peripheral nervous system. The most common type is called Charcot-Marie-Tooth (CMT) disease that constitutes an interesting research focus due to its clinical and genetic heterogeneity. Mutations in more than 90 genes and loci are associated with CMT that presents with autosomal dominant (AD), autosomal recessive (AR), X-linked, or mitochondrial inheritance. Despite the advances in genetic testing, approximately 35% of all CMT cases worldwide remain without a molecular diagnosis. The diagnostic rate is even lower for ARCMT due to the presence of many individually rare genes. This diagnostic gap points to the presence of yet unidenti ed causative genes, as well as potential non-Mendelian features of the disease. In order to identify novel genes/alleles causing ARCMT and determine the frequency for known genes in Turkey, we have analyzed 56 consanguineous families diagnosed with CMT who present with early onset polyneuropathy with additional symptoms. Through the screening of patients for GDAP1 mutations, and subsequent whole-exome sequencing and homozygosity mapping, we have identi fied 22 recurrent and 13 novel alleles in known CMT genes achieving a potential diagnosis rate of 62,5%. Moreover, we identi fied FXN as a candidate gene for a novel disease in the spectrum between CMT and Friedreich's ataxia, ATP8B3 for ARCMT2, and SEPT11 for AR-cerebellar ataxia with axonal neuropathy. This study paints the genetic landscape of the Turkish ARCMT population, reports candidate genes that might enlighten new disease mechanisms, and can serve as a reference for diagnosis strategies speci c to populations with similar genetic backgrounds.
Benzer Tezler
- Ulaş Sağlık Ocağı merkezinde nüfusun bazı niteliklerine ve konutların durumuna ilişkin bir çalışma
An Investigation carried out at the Ulaş Public Health Centre concerning some characteristics of the population and housing conditions in the district of Ulaş
EROL ŞANLI
Doktora
Türkçe
1985
Halk SağlığıCumhuriyet ÜniversitesiHalk Sağlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERVET ÖZGÜR
- Antakya tarihi ticaret merkezi mekansal yapı değişim ve gelişim sürecinin kent ticaret merkezi planlamasına etkinliği
The Effectiveness of spatial structural chance and development period of the historical trade center of Antakya in the urban trade planning
NEVİN TURGUT
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Şehircilik ve Bölge PlanlamaGazi ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NURCAN UYDAŞ
- İzmir'de bazı yolların kapatılarak yaya bölgeleri oluşturma da kent peyzajını geliştirme açısından yeniden planlanması üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
BAHAR TÜRKYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Şehircilik ve Bölge PlanlamaEge ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
- Pik demiri ve karbon çeliğinin sulu çözeltiler içindeki korozyon hızının tayini
Determination of the rate of corrosion of the cast iran and carbon steel in the aqueous solutions
EMİNE NAZAN ÜNAL
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Kimya MühendisliğiGazi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAYRİ YALÇIN
- Sivas yöresinde akraba evliliği yapan ve yapmayan çiftlerde dermatoglifik benzerlikler
Similarities of dermataoglyphies among individval of married relatives and married couples not related to each other in Sivas region
Y. SELMA SÜNGÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
1984
Tıbbi BiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. İLHAN SEZGİN