Geri Dön

The primary cilia of the gastrointestinal tract in homeostasis and disease at the single-cell level

Homeostaz ve hastalıkta tek hücre düzeyinde gastrointestinal sistemin primer silyaları

PDF İndir

  1. Tez No: 686798
  2. Yazar: DENİZ ESEN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ BAHAR DEĞİRMENCİ UZUN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Gastrointestinal sistem, kök hücrelerin bölünerek fonksiyonel ve morfolojik olarak farklı hücre tiplerine dönüşmesiyle düzenli olarak yenilenir. Hücre kaderi, Wnt, Hedgehog ve Bmp gibi birkaç önemli sinyal yolağı aracılığıyla belirlenir. Ancak kök hücre karakteri ve farklılaşma işaretlerinin koordinasyonu için bu sinyal moleküllerinin hücreler arasında nasıl iletildiği halen bir sırdır. Primer silyalar, bu sinyal yolakları için birçok reseptör barındıran anten benzeri küçük organellerdir. Bu çalışmada, umuna açılmış tek hücreli RNA dizileme verileri yeniden analiz edilerek primer silya ekspresyonunun bağırsak mezenkiminde ve karaciğerde heterojen olduğu gösterilmektedir. Primer silyaların varlığı bilinen belirteçleri kullanılarak immünfloresan tekniği ile fare kalın bağırsağının stroma ve kas hücrelerinde doğrulanmaktadır. Acot7 primer silyalarla ilişkili işaretleyici olarak ortaya çıkmaktadır ve myenterik gangliyonlarda eksprese edildiği tespit edilmiştir. Ülseratif koliti modellemek için DSS verilen farelerde, epitel kaybı nedeniyle kript yapılarının kapladığı alan küçüldükçe primer silyaların daha bol olduğu gözlemlenmiştir. Acot7 eksprese eden gangliyal hücreler daha sık ortaya çıkmış ve morfolojik farklılıklar sergilemiştir. Ek olarak, 16 hafta boyunca yüksek yağlı diyetle beslenen farelerde, kolon kriptlerinde kısalma ve primer silyalarda bir artış görülmüştür. Bu çalışma, homeostaz sırasında gastrointestinal sistemde primer silyaların bulunduğunu, ayrıca bunların iltihaplanma ve diyete dayalı adaptasyonlara katıldığını göstermektedir.

Özet (Çeviri)

The gastrointestinal tract is regularly renewed by stem cells which divide and differentiate into functionally and morphologically distinct cell types. Several key pathways, such as Wnt, Hedgehog and Bmp, regulate the cell fate. However, it remains a mystery how the associated signaling molecules are relayed between cells to coordinate stemness and differentiation cues. Primary cilia are small antenna-like organelles that harbors many receptors for these pathways. Here public single-cell RNA sequencing data is re-analyzed to show that primary cilia expression is heterogeneous in the intestinal mesenchyme and liver. Presence of primary cilia is also validated using immunofluorescence in the stroma and muscle cells of the mouse colon, using known markers of the primary cilia. Acot7 is identified as a primary cilium associated marker and found to be expressed in myenteric ganglia. In mice challenged with DSS to model ulcerative colitis, primary cilia are observed more abundant as the area covered by crypt structures become reduced due to the loss of epithelium. Acot7 expressing ganglial cells were observed more frequently and displayed morphological differences. Additionally, mice fed a high-fat diet over 16 weeks had shortening of the colon crypts and an increase in the primary cilia. This work suggests that primary cilia exist in the gastrointestinal tract during homeostasis and participate in inflammation and diet-based adaptations.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    709561

    Characterization of enteric nervous system response to disease conditions in intestine

    Enterik sinir sisteminin bağırsakta hastalık durumlarına cevabının karakterizasyonu

    NAGİHAN GİZAY GÖNÜLLÜ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ BAHAR DEĞİRMENCİ UZUN

  2. Tez No

    1018132

    Regulation of β-cell function through the primary cilium

    Primer silya aracılığıyla β-hücre fonksiyonunun düzenlenmesi

    TUĞÇE CEREN İNCEDAL NILSSON

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyolojiUppsala Unıversıtet

    Medikal Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OLOF IDEVALL-HAGREN

  3. Tez No

    703450

    Dissecting the function and regulation of the dual specificity kinase DYRK at the centriolar satellites and primary cilium

    Sentriyolar satelit ve primer silyum konseptinde ikili spesifik kinaz DYRK'nin fonksiyonel ve düzenleyici rolünün araştırılması

    EBRU TOPÇU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyolojiKoç Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ELİF NUR FIRAT KARALAR

  4. Tez No

    852722

    Primer siliyer diskinezili çocuklarda akciğerin yapısal ve fonksiyonel durumu ile hastaların yaşam kaliteleri arasındaki ilişki

    The relationship between patients' quality of life and structural and functional status of the lung of childrenwith primary ciliary dyskinesia

    NESİBE HATUN SARIHAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SANİYE GİRİT

  5. Tez No

    989939

    Primer siliyer diskinezi tanılı hastaların tanı ve izlemindeki klinik ve laboratuvar verilerinin retrospektif olarak incelenmesi

    Retrospective examination of clinical and laboratory data at the diagnosis and follow-up of primary ciliary dyskinesia patients

    ASLI KUZU KUŞAKLI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Göğüs HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAYRİYE UĞUR ÖZÇELİK

Geri Dön