Geri Dön

Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında YTHDF1 ve YTHDF3 RNA metilasyon gen düzeylerinin araştırılması

Investigation of YTHDF1 and YTHDF3 rna methylation gene levels in crimean congo hemorrhagic fever patients

PDF İndir

  1. Tez No: 686294
  2. Yazar: RIDVAN AVCI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SERDAL ARSLAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Genetik, Medical Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Genler, Hemorajik ateş-Kırım, Metilasyon, RNA, RNA virüs enfeksiyonları, RNA virüsleri, RNA-viral, Retrovirüsler, İnfluenza virüs, Genes, Hemorrhagic fever-Crimean, Methylation, RNA, RNA virus infections, RNA viruses, RNA-viral, Retroviridae, Influenza virus
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Tıp Bilimleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Kırım Kongo Kanamalı Ateşi (KKKA) hastalığına neden olan, Kırım Kongo kanamalı ateş virüsü (KKKAV), Nairoviridae ailesi içinde Orthonairovirus cinsine ait bir RNA virüsüdür. KKKA %5-30 ölüm oranı ile seyreden ciddi bir viral hastalıktır. N6-metiladenozin (m6A) mRNA'da stabilite, splaysing ve translasyonda görev alan bir RNA modifikasyonudur. m6A modifikasyonu; yazıcılar, siliciler ve okuyucular olmak üzere 3 kısımdan oluşmaktadır. Okuyucu ailesine ait olan YTHDF1 ve YTHDF3 genleri metilli mRNA'ya bağlanarak bu mRNA'nın stabilitesini, ifadesini ve translasyonunu düzenlemekle görevlidir. Ayrıca YTHDF3 geni YTHDF1 geni ile kompleks oluşturarak translasyon verimliliğini arttırmaktadır. YTHDF3, diğer okuyucu proteinler ile etkileşime girerek mRNA yıkılmasına aracılık edebilir. Bu çalışma KKKA hastalığı ile adı geçen YTHDF1 ve YTHDF3 RNA genlerinin ekspresyon seviyelerinin incelendiği ilk çalışmadır. Çalışmamızda 40'ı kontrol, 60'ı KKKA hastası olmak üzere 100 adet kan örneği kullanıldı ve bu kan örneklerinden Total RNA izolasyonu yapıldı. Daha sonra SYBR Green temelli qPCR gerçekleştirilerek YTHDF1 ve YTHDF3 RNA genlerinin ekspresyon düzeyleri belirlendi. Bu çalışmada YTHDF1 ve YTHDF3 ifade düzeyleri hasta-kontrol, ölen-kontrol ve şiddetli-hafif grupları arasında karşılaştırılmıştır. YTHDF1 ve YTHDF3'ün ifadesi istatistiksel olarak anlamlı olmamakla birlikte hasta ve kontrol grubu arasında YTHDF1 1,21 (p=0,56), YTHDF3 2,99 kat azalmıştır (p=0,18). Ölenler ve kontrol grubu karşılaştırıldığında ölenlerde YTHDF1'in 1,29 (p=0,84) ve YTHDF3'ün 1,41 kat azaldığı (p=0,67) gözlenmiştir. Hastalığı hafif geçirenlere göre hastalığı şiddetli geçirenlerde YTHDF1 1,14 (p=0,35), YTHDF3 ise 1,46 kat azalmıştır (p=0,30). Sonuç olarak KKKA hastalığında YTHDF1 ve YTHDF3 ifadesinin azalması hastalığın seyrinde etkili olabilir.

Özet (Çeviri)

Crimean Congo Hemorrhagic Fever (CCHF) is an RNA virus belonging to the Orthonairovirus genus in the Nairoviridae family. CCHF is a serious viral disease with a mortality rate of 5-30%. N6-methyladenosine (m6A) is an RNA modification involved in stability, splicing and translation of mRNA. m6A modification; It consists of 3 parts: writers, ereasers and readers. The YTHDF1 and YTHDF3 genes belonging to the reader family are responsible for regulating the stability, expression and translation of this mRNA by binding to methylated mRNA. In addition, the YTHDF3 gene increases the translation efficiency by forming a complex with the YTHDF1 gene. YTHDF3 can mediate mRNA degradation by interacting with other reader proteins. This study is the first to examine the expression levels of YTHDF1 and YTHDF3 RNA genes mentioned with CCHF disease. In our study, 100 blood samples, 40 of which were controls and 60 of whom were CCHF patients, were used and Total RNA was isolated from these blood samples. Then, expression levels of YTHDF1 and YTHDF3 RNA genes were determined by performing SYBR Green-based qPCR. In this study, YTHDF1 and YTHDF3 expression levels were compared between patient-control, deceased-control, and severe-mild groups. Although the expression of YTHDF1 and YTHDF3 was not statistically significant, YTHDF1 decreased 1.21 (p=0.56) and YTHDF3 2.99-fold (p=0.18) between the patient and control groups. When the deceased and the control group were compared, it was observed that YTHDF1 decreased by 1.29 (p=0.84) and YTHDF3 decreased by 1.41 times (p=0.67) in the deceased. Compared to those with mild disease, YTHDF1 was decreased by 1.14 (p=0.35) and YTHDF3 was decreased by 1.46 times (p=0.30) in those with severe disease. In conclusion, decreased expression of YTHDF1 and YTHDF3 in CCHF disease may be effective in the course of the disease.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    303331

    Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında serum nitrik oksit düzeylerinin klinik ve prognoz ile ilişkisi

    Serum nıtrıc oxyde levels ın patıents wıth crımean an congo hemorrhagıc fever assocıated wıth clınıcal and prognosis

    CEZMİ KARACA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZÜLAL ÖZKURT

  2. Tez No

    390259

    Kırım-Kongo Kanamalı Ateşi hastalarında kemokin reseptör 5(CCR5) geni delta32 mutasyonunun analizi

    Chemokine receptor 5 gene analysis of delta32 mutation in patients with Crimean-Congo Haemorrhagic Fever

    DUYGU EKİNCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Tıbbi BiyolojiGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYDIN RÜSTEMOĞLU

  3. Tez No

    468789

    Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında hulc ve 7SL RNA ifade düzeylerinin araştırılması

    Evaluation of hulc and 7SL RNA expression levels in patients with crimean congo hemorrhagic fever

    BURCU BAYYURT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Tıbbi BiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERDAL ARSLAN

  4. Tez No

    512307

    Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında mir-126-3p ve mir-142-5p ifade düzeylerinin araştırılması

    Investigation of mir-126-3p and mir-142-5p expression levels in patients with crimean congo hemorrhagic fever

    NAZIM ESERYEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Tıbbi BiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERDAL ARSLAN

  5. Tez No

    523766

    Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında DROSHA, dicer ve exportin-5 protein düzeylerinin belirlenmesi

    Determination of drosha, dicer and export-5 protein levels in patients with crimean congo hemorrhagic fever

    ZEHRA DOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyokimyaSivas Cumhuriyet Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVTAP BAKIR

Geri Dön