Alzheimer ve demans hastalığı için bitki ekstraktlarından yeni aday ilaç molekülü eldesi
New candidate drug molecule from plant extracts for Alzheimer and dementia
- Tez No: 665305
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ VİLDAN ENİSOĞLU ATALAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Frontotemporal demans, Makromoleküller, Mekanik kenetleme yöntemi, Modeller-moleküler, Semantik demans, Frontotemporal demantia, Macromolecules, Mechanical bond method, Models-molecular, Semantic dementia
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Üsküdar Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Demans, hafıza, konuşma, dil becerileri, yürütücü ve görsel-uzamsal işlev, psikoloji dahil olmak üzere iki veya daha fazla alanda, günlük hayatımızdaki temel aktiviteleri yerine getirebilme kabiliyetinin kaybına sebep olan klinik bir sendromdur. Alzheimer hastalığı, demansın en yaygın sebebi olarak görülür. Günümüzde Alzheimer ve demans hastalıkları için kesin bir tedavi ve ilaç bulunamamıştır. Öncelikle; Asetilkolinesteraz inhibitörlü 3 adet Alzheimer hastalığı tedavisinde kullanılan ilaç molekülü; Donepezil, Rivastigmin, Takrin, 3 adet Demans hastalığı tedavisinde kullanılan ilaç molekülü; Donepezil, Rivastigmin, Galantamin molekülleri bulundu. Ardından Dr.Duke sitesinden Anti-Alzheimer ve Anti-Demans bitki aktif molekküllerinin araştırıldı ve Alzheimer hastalığı için 19 adet bitki aktif molekülü ve Demans hastalığı için 13 adet bitki aktif molekülü bulundu. Bulunan 32 adet Bitki moleküllerinin konformer taramaları için Spartan'14 programında Molecular Mechanics/MMFF metodu kullanıldı. Ardından Semi-Empirical/PM6 metodu ile optimize edilen moleküllerin enerji, logP, polarizability, hacim, dipol momenti ve ağırlık parametreleri elde edildi ve tablo yapıldı. Konforme edilen moleküllerin en kararlı molekül optimizesi Semi-Empirical/PM6 metodu ile bulundu. Ardından; Asetilkolinesteraz inhibitörüne ait X-Ray kristal yapısı, 2 Å altında çözünürlük ve Homo Sapiens niteliklerine uygun 1DX4 kodlu yapı seçildi, X,Y,Z bağlanma koordinatları belirlendi ve kaydedildi. Son olarak docking işlemleri gerekli prosesler uygulanarak yapıldıktan sonra elde ettiğimiz veriler tablolar ve şekiller halinde gösterildi. Sonuç olarak Alzheimer hastalığı için 5 adet yeni aday ilaç molekülü bulundu; Beta Turmerone, Glabridin, Huperzine-A, Huperzine-B, Physostigmine. Demans hastalığı için 3 adet yeni aday ilaç molekülü bulundu; Glabridin, Isorhynchophylline, Rhynchophylline.
Özet (Çeviri)
Dementia is a clinical syndrome that causes the loss of the ability to perform basic activities in our daily life in two or more areas, including memory, speech, language skills, executive and visual-spatial function, psychology. Alzheimer's disease is seen as the most common cause of dementia. Currently, there is no definitive treatment or medicine for Alzheimer's and dementia diseases. Firstly; Acetylcholinesterase inhibitor 3 drug molecules used in the treatment of Alzheimer's disease; Donepezil, Rivastigmine, Tacrin, 3 drug molecules used in the treatment of dementia; Donepezil, Rivastigmine, Galantamine molecules were found. Afterwards, Anti-Alzheimer 's and antidementia active molecules were searched on Dr. Duke site and 19 plant active molecules for Alzheimer's disease and 13 plant active molecules for Dementia were found. For conformer screening of 32 plant molecules found, Molecular Mechanics / MMFF method was used in Spartan'14 program. Then, energy, logP, polarizability, volume, dipole moment and weight parameters of molecules optimized by Semi-Empirical/ PM6 method were obtained and a table was made. The most stable molecule optimization of the comfortable molecules was found with the Semi-Empirical/PM6 method. Next; X-Ray crystal structure of the acetylcholinesterase inhibitor, resolution below 2 Å and the 1DX4 coded structure suitable for the characteristics of Homo Sapiens was selected, the X, Y, Z binding coordinates were determined and recorded. Finally, after the docking operations were carried out by applying the necessary processes, the data we obtained were shown in tables and figures. As a result, 5 new candidate drug molecules for Alzheimer's disease were found; Beta Turmerone, Glabridin, Huperzine-A, Huperzine-B, Physostigmine. 3 new candidate drug molecules were found for dementia; Glabridin, Isorhynchophylline, Rhynchophylline.
Benzer Tezler
- Salvia multicaulis Vahl (Lamiaceae) uçucu yağının skopolamine ile oluşturulan Alzheimer tipi demans rat modelindeki etkileri üzerine çalışmalar: Davranışsal yaklaşımlar
Studies on the effects of Alzheimer type demans rat model created with essential oil, Salvia multicaulis Vahl (Lamiaceae), by skopolamine: Behavioral approaches
ATİLLA AYGÜN
- Leucojum aestivum L.'den tirozin dekarboksilaz (TYDC) geninin izolasyonu ve klonlanması
Isolation and cloning of the tyrosine decarboxylase (TYDC) gene from Leucojum aestivum L.
ÖZLEM BALTA
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
GenetikTrakya ÜniversitesiBiyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEMRA HASANÇEBİ
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMEL ORDU
- Meyan kökü (glycyrrhiza glabra) ekstrelerinin ve bazı aktif bileşenlerinin asetilkolinesteraz ve bütirilkolinesteraz aktiviteleri üzerine etkileri
Effects of licorice root (glycyrrhiza glabra) extracts and some active ingredients on acetylcholinesterase and butyrylcholinesterase activities
DUYGU AKTAŞ
- Alzheimer tipi demans ve parkinson hastalığı demansının klinik ve nöropsikiyatrik profillerinin karşılaştırılması
The clinic and neuropsychiatric profile comparison of alzheimer TYPE dementia and parkinson disease dementia
SERHAN KARAKILIÇ
- Türkiye'de ve dünya genelinde yaygın olan Alzheimer hastalığı için bir projeksiyon çalışması
A projection study for Alzheimer's disease, which is common in Turkey and worldwide
NİLAY DURSUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoistatistikKarabük ÜniversitesiBiyoenformatik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK KARADAVUT
