Geri Dön

Yoğun bakım ünitesinde gelişen kandidemilerin klinik ve moleküler yöntemlerle erken saptanması

Early diagnosis of candidemia in intensive care unit by clinical and molecular methods

PDF İndir

  1. Tez No: 663535
  2. Yazar: KHALIS MUSTAFAYEV
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GÖKHAN AYGÜN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Kandidemi, Real-Time PCR, ITS bölgesi, D1/D2 bölgesi, Erken teşhis, Kandida, Kandidiyaz, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Teşhis, Teşhis testleri, Yoğun bakım, Yoğun bakım üniteleri, Candidemia, Real-Time PCR, ITS region, D1/D2 region, Early diagnosis, Candida, Candidiasis, Polymerase chain reaction, Diagnosis, Diagnostic tests, Intensive care, Intensive care units
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada Cerrahpaşa Tıp Fakültesi (CTF) yoğun bakım ünitelerinde (YBÜ) takip edilen kandidemi riski yüksek olan kritik hastalarda erken tanı için risk faktörlerinin belirlenerek özgün Candida skorunun oluşturulması ve deneysel modelleme ile tam kandan çalışılabilen moleküler bir yöntem olan Candida Real-Time PCR testinin geliştirilmesi amaçlandı. Çalışma üç aşamalı olarak dizayn edildi. Birinci aşamada YBÜ'de saptanan kandidemi olgularında risk faktörleri tanımlaması (Retrospektif Vaka-Kontrol çalışması), ikinci aşamada vaka kontrol çalışması verileri ile CTF Candida skor formu oluşturulması ve bu formun klinik etkinliğinin araştırılması (Prospektif kesitsel çalışma), üçüncü aşamadaysa tam kan örneklerinde PCR tabanlı bir hızlı tanı testi oluşturulması (Deneysel çalışma) planlandı. Ocak 2017 - Aralık 2018 tarihleri arasında CTF'de takip edilen 100 YBÜ hastası (50 vaka / 50 kontrol) kayıtlardan geriye dönük olarak incelendi. İntraabdominal infeksiyon (p = 0,001), son üç ayda hastanede yatış öyküsü (p = 0,006), bir haftadan uzun antibiyotik kullanımı (p = 0,005) ve Candida skoru (p <0,05) kandidemi için en önemli risk faktörleri olarak bulundu. CTF Candida skorunun 4 puan ve üzeri sınır değeri kandidemi için anlamlı bir risk oluşturduğu saptandı (p <0,05). Real-time PCR amplikonlarının erime eğrisi analizi ile C. albicans ve C. parapsilosis izolatlarını ayırt etmek için spesifik primer çiftleri ve EvaGreen boyası kullanıldı. ITS, D1/D2 bölgelerinin amplifikasyonu ile elde edilen amplikonun özgüllüğü gösterildi. PCR testimizin in vitro saptama limiti 10 CFU/ml olarak belirlendi. Sonuç olarak, çalışmamızda geliştirilen CTF Candida skoru ve PCR testi, konvansiyonel tanı yöntemleri ile birlikte, klinisyenlere YBÜ gibi kandidemi mortalitesinin yüksek olduğu birimlerde gereksiz antifungal kullanımından kaçınmak ve uygun antifungal tedaviye erken başlamak için rehberlik edebilir. Denenen PCR testinin duyarlılığını arttırmak için geliştirmeye ihtiyaç vardır. Klinik kullanımdaki etkinliğini doğrulamak için daha çok hasta sayısı ve daha fazla örneklem içeren çok merkezli çalışmalar yapılmalıdır.

Özet (Çeviri)

To evaluate the risk factors in critically ill patients who are followed up in intensive care units (ICUs), to create a unique Candida score, and to develop the Candida Real-Time PCR for early diagnosis of candidemia was aimed. The study was designed at three steps. We evaluated the risk factors in ICU patients with invasive candidiasis at the first step. At the second step, we created a unique Candida score and studied its clinical efficacy. Finally, at the third step, a rapid PCR-based test from whole blood samples was performed. One hundred ICU patients (50 case/50 control) followed at Cerrahpasa Medical Faculty between January 2017 and December 2018 reviewed retrospectively from records. Intraabdominal infection (p = 0.001), history of hospitalization in the last three months (p = 0.006), antibiotic use longer than one week (p = 0.005) and Candida score (p <0.05) found to be the most important risk factors for candidemia. The cutoff value of CTF Candida score of 4 points and above could determine a significant risk for candidemia (p<0.05). Specific primer pairs and EvaGreen dye were used to differentiate C. albicans and C. parapsilosis isolates via melting curve analysis of real-time PCR amplicons. The specificity of the amplicon obtained by amplification of the ITS, D1/D2 regions was shown. We found that 10 CFU/ml is the in vitro detection limit for our PCR test. In conclusion, CTF Candida score and PCR test developed in our study (with conventional diagnostic methods) can guide clinicians to avoid unnecessary antifungal use and start appropriate antifungal therapy early. Improvement is needed to increase the sensitivity of the developed PCR test. Multicenter studies with more patient numbers and more samples should be conducted to verify its effectiveness in the clinic.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    157900

    Cerrahpaşa Tıp Fakültesinde izlenen kandidemi olgularının epidemiyolojik klinik, mikrobiyolojik yönleriyle incelenmesi

    Epidemiological, microbiological, clinical examination of the candidemia cases in Cerrahpaşa medical faculty

    AYGÜL DOĞAN ÇELİK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. RECEP ÖZTÜRK

  2. Tez No

    474048

    Süleyman Demirel Üniversitesi Araştırma ve Uygulama Hastanesi'nde izlenen kandidemi olgularının epidemiyolojik özellikleri ve risk faktörlerinin belirlenmesi

    The determination of risk factors and epidemiologic features of candidemia patients admitted in Suleyman Demirel University Research and Practice Hospital

    GÜLEN GÜLOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ONUR KAYA

  3. Tez No

    293615

    Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Merkezi Yoğun Bakım Ünitesi'nde saptanan kan dolaşımı enfeksiyonları ve risk faktörlerinin irdelenmesi

    Evaluation of blood stream infections and risk factors detected in Central Intensive Care Unit of Gaziantep University Medical Faculty

    AYNUR SÜNER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İLKAY KAROĞLAN

  4. Tez No

    314617

    Yoğun bakım ünitesinde gelişen invaziv araç ilişkili enfeksiyonlar

    Infections associated with invasive device which occur in the intensive care

    SERAP TOSMAN BALIK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    HemşirelikMarmara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Hemşireliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SIDIKA OĞUZ

  5. Tez No

    316901

    Yoğun bakım ünitesinde gelişen hastane kökenli pnömoniler, risk faktörleri ve bakteriyolojik etkenler

    Hospital acquired pneumonia in intensive care units,risc factors and bacteriological factors

    EMİNE DOĞANAY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Göğüs HastalıklarıErciyes Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HAKAN BÜYÜKOĞLAN

Geri Dön