Ticari ve halk elinde beslenen tavuklarda enterik laktobasillerin dağılımı ve makrolide-lincosamide-streptogramin (MLS) antibiyotiklere direnç profillerinin araştırılması
Distribution of enteric lactobacilli in backyard and commercial poultry and investigation of their makrolide-lincosamide-streptogramin (MLS) antibiotics resistance profiles
- Tez No: 652148
- Danışmanlar: PROF. SERKAN İKİZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Tavuk, Laktobasillus, MLS direnci, Antibiyotikler, Lactobacillus, Mikrobiyal duyarlılık testleri, Tavuklar, İlaçlara direnç, Chicken, Lactobacillus, Antibiotics, Microbial sensitivity tests, Chickens, Drug resistance
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada; ticari ve halk elinde beslenen tavuklardan alınan kloakal sıvaplardan Laktobasil türlerinin izolasyon ve identifikasyonu ile dağılımının belirlenmesi, izolatların Makrolid- Linkosamid-Streptogramin (MLS) grup antibiyotiklere ait MİK değerlerinin ve dirençten sorumlu belirli genlerin PCR ile saptanması amaçlandı. 12 farklı çiftlikten tesadüfi örnekleme ile toplamda 60 adet kloakal sürüntü örneğinden 174 Lactobacillus izolatı elde edildi. Bu izolatların 48'i halk elinde beslenen, 57'si yumurtacı ve 69'u broyler yetiştiricilik şekillerine aitti. Sırasıyla halk elinde beslenen, yumurtacı ve broyler yetiştiricilik olmak üzere 10, 12, 9 farklı Lactobacillus türü UltrafleXtreme MALDI TOF mass spectrometer cihazıyla identifiye edildi. Farklı Laktobasil türü izolat sayısı bakımından yetiştiricilik şekilleri arasında fark önemli bulunmuştur (p<0,05). Broth mikrodilüsyon metoduyla gerçekleştirilen antibiyotik duyarlılık test sonuçlarına göre; eritromisin, klindamisin, linkomisin, tylosin ile virjinamisin antibiyotiklerine direnç oranları sırasıyla halk elinde beslenen %62,5, %72,9, %43,8, %18,8, %37,5, yumurtacı %47,4, %78,9, %77,2, %40,4, %54,4 ve broylerde %87, %92,8, %91,3, %87, %73,9 olarak saptandı. Test edilen tüm antibiyotikler için yetiştiricilik şekilleri arasında fark önemli bulunmuştur (p<0,05). Günümüzde Laktobasil türleri için antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesinde standart metod bulunmayışına bağlı olarak fenotipik test, bakteriyel suşların antibiyotik direnç belirleyicilerinin varlığı yönünden tarandığı moleküler yöntemle (PZR) kombine edildi. Bu bağlamda dirençten sorumlu gen varlığı [erm(B)-erm(C)] değerlendirmesinde ise oranlar; halk elinde beslenen, yumurtacı ve broiler yetiştiricilikte sırasıyla; %27,1-%37,5, %70,2-%71,9, %76,8-%55,1 olarak bulundu. Erm(A) direnç geni varlığına sadece broiler tavuğa ait 1 Lactobacillus vaginalis izolatında rastlanmıştır. Sonuç olarak; hem ticari hem halk elinde beslenen tavukların mikrobiyomunda, önemli üyelerden olan Laktobasillerde yaygın antibiyotik direnç varlığına rastlanması antimikrobiyallerin kullanımının kontrollü ve sınırlı olması gerekliliğini ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
In this study; it was aimed to determine the distribution and isolation of Lactobacillus species from cloacal swabs taken from commercial and backyard chickens, and to determine the MIC values of the isolates belonging to Macrolide-Lincosamide-Streptogramin (MLS) group antibiotics and specific genes responsible for resistance by PCR. A total of 174 Lactobacillus isolates were obtained from 60 cloacal swab samples by random sampling from 12 different farms. 48 of these isolates were from backyard chickens, 57 of them belonged to laying hens and 69 of broilers. 10, 12, 9 different Lactobacillus species were identified with UltrafleXtreme MALDI TOF mass spectrometer from backyard chickens, laying hens and broilers, respectively. The difference between the breeding methods was found to be significant in terms of the number of different Lactobacillus species (p<0,05). According to the antibiotic sensitivity test results performed with the broth microdilution method; resistance rates to erythromycin, clindamycin, lincomycin, tylosin and virginamycin antibiotics were 62.5%, 72.9%, 43.8%, 18.8%, 37.5% in backyard chickens, %47,4, %78,9, %77,2, %40,4, %54,4 in laying hens and 87%, 92.8%, 91.3%, 87%, 73.9% in broilers, respectively. For all antibiotics tested, the difference in breeding method was found to be significant (p<0,05). Due to the lack of a standard method for determining antibiotic susceptibility for Lactobacillus species, the phenotypic test was combined with the molecular method (PCR) in which bacterial strains were screened for the presence of antibiotic resistance determinants. In this context, in the evaluation of the gene responsible for resistance, the rates are; 27.1%-37.5%, 70.2%-71.9%, 76,8%-55,1% in backyard chickens, laying hens and broilers, respectively. The presence of the erm (A) resistance gene was found only in 1 Lactobacillus vaginalis isolate from broiler chicken. As a result; the presence of widespread antibiotic resistance in the microbiome of both commercial and backyard chickens, one of its important members, Lactobacilli, reveals the need for controlled and limited use of antimicrobials.
Benzer Tezler
- Türkiye ekonomisinde kamu iktisadi teşebbüslerinin önemi ve kamu iktisadi teşebbüslerinin özelleştirilmesi
Başlık çevirisi yok
DENİZ ÖZUSLU
- Tokat ilinde halk elindeki sığırcılık işletmelerinde BoHV-1 enfeksiyonunun seroprevalansı
Seroprevalence of BoHV-1 infection in public-owned cattle enterprises in Tokat provience
MURAT DOĞRU
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiVeterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FIRAT DOĞAN
- Kuzu ve oğlakların ağız bölgesinde orf virus (Ektima) nedeniyle meydana gelen dudak lezyonlarının moleküler ve virolojik yönden araştırılması ve papilend™ krem ile tedavi sürecinin incelenmesi
Investigation of molecular and virological of lip lesions caused by orf virus (Ecthyma) in mouth side of lamb and goat kids and examination of the papilend™ cream treatment process
GÜLER BERAT KAYA
Doktora
Türkçe
2022
Veteriner HekimliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiViroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET KALE
- İstanbul'daki atlarda Theileria equi ve Babesia caballi'nin yayılışı ve moleküler karakterizasyonu
Prevalence and molecular characterization of Theileria equi and Babesia caballi in horses in İstanbul
FATMA NUR DAL
Doktora
Türkçe
2023
Veteriner Hekimliğiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaParazitoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYNUR GÜLANBER
PROF. DR. MUSTAFA NECATİ MUZ
- Bursa`da vakıfların sosyo-ekonomik işlevleri (1544-1588 ve 1749-1795 yılları arası vakıf muhasebe kayıtları ışığında)
The social-economic activities of the pious foundations established in Bursa (in the light of the account registers of the waqfs between the years 1544-1588 and 1749-1795)
CAFER ÇİFTÇİ