Meme kanserinde uzun kodlamayan RNA FAM83H-as1'in proliferasyon üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of long non coding RNA FASM83H-AS1 on proliferation in breast cancer
- Tez No: 639617
- Danışmanlar: PROF. DR. VEYSEL KENAN ÇELİK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Genler-tümör baskılayıcı, Meme hastalıkları, Meme neoplazmları, Neoplazmlar, Onkogenler, RNA, Genes-suppressor-tumor, Breast diseases, Breast neoplasms, Neoplasms, Oncogenes, RNA
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Meme kanseri, insidans ve prognoz açısından farklılık gösteren, farklı alt tipleri kapsayan, dünyada ve ülkemizde kadınlar arasında en fazla rastlanılan ve en sık ölümle sonuçlanan heterojen bir hastalıktır. İnsan genom projesinin tamamlanmasının ardından, insan DNA'sının çoğunun protein kodlayan mesajcı RNA (mRNA) yerine kodlamayan RNA'lara (ncRNA) transkribe olduğu ortaya çıkmıştır. Kodlamayan RNA sınıfı olan uzun kodlamayan RNA'ların (lncRNA) işlevinin deşifre edilmesi, son yıllarda ortaya çıkan yeni bir araştırma alanıdır. LncRNA'lar kanser de dahil olmak üzere çeşitli patolojik hastalıklarda rol oynadığı bulunmuştur. LncRNA'lar hedef gen ekspresyonunu çeşitli mekanizmalar veya biyolojik moleküllerle etkileyebilmektedir. Bu nedenle, çalışmamızda meme kanserinde yüksek düzeyde eksprese edilen lncRNA FAM83H-AS1'in tümör süpresör genler ve onkogenler üzerinde etkilerinin olup olmadığını araştırmayı amaçladık. Çalışmamızda meme kanseri hücre hattı MCF-7 kullanıldı. Dizayn edilen FAM83H-AS1-siRNA havuzunun transfekte edildiği hücreler (Grup 2) ile negatif kontrol siRNA'sının (Grup1) transfekte edildiği hücrelerden cDNA sentezlendi. Onkogenler ve tümör süpresör genler ile ilişkili proliferasyon genlerinin ifade edilme profilleri real-time PCR ile belirlendi. Proliferasyon ile ilişkili genlerin ifade edilme düzeyleri belirlendikten sonra, iki grup arasında bu genlerin ekspresyon düzeyleri arasındaki farklar belirlendi. Ayrıca MCF-7 hücre hattında her iki grup için 72 saatlik inkübasyonun ardından XTT hücre canlılığı analizleri yapıldı. Tümör süpresör genler olan BAX, FOXD3, MLH1, RUNX3 ve SERPINB5'in, grup 1'e göre kıyaslandığında grup 2'de ekspresyonları anlamlı olarak arttı (p<0,05). MYCN ve REL onkogenlerinin grup 1'e göre kıyaslandığında grup 2'de ekspresyonları anlamlı olarak azaldı (p<0,05). Sonuç olarak, lncRNA FAM83H-AS1 tümör süpresör ve onkogenlerin ekspresyon düzeylerini etkileyerek, proliferasyonu arttırdığı meme kanserinin oluşumunda ve ilerlemesinde etkili olduğu söylenebilir.
Özet (Çeviri)
Breast cancer, is a heterogeneous disease which is the most common cause of death among women in our country and in the World, that shows the index of incidence and prognosis, with different subtypes, Upon completion of the human genome project, it turns out that most of the human DNA is transcribed into non-coding RNAs (ncRNA) instead of the protein-encoding messenger RNA (mRNA). Revealing the function of long non-coding RNAs (lncRNA), the class of non-coding RNAs, is a recently emerging area of research. It was found that, LncRNAs play a role in a variety of pathological diseases, including cancer. LncRNAs can affect target gene expression by several mechanisms or biological molecules. Therefore, in our study, it was aimed to investigate whether the lncRNA FAM83H-AS1, which is highly expressed in breast cancer, has effects on tumor supressor genes and oncogenes or not. The breast cancer cell line MCF-7 was used in our study. cDNA was synthesized from the designed siRNA-FAM83H-AS1 transfected cells (Group 2) and transfected cells of the negative control siRNA (Group1) . The expression of proliferation genes, which are related with oncogenes and tumor supressor genes, was determined by real-time PCR. After determining the expression levels of proliferation related genes, the differences of expression levels between two groups were compared. Furthermore, XTT cell viability test was performed for both groups on MCF-7 cell line. Expression of tumor supressor genes BAX, FOXD3, MLH1, RUNX3 and SERPINB5 were significantly increased in group 2 when compared to group 1 (p <0.05). When MYCN and REL oncogenes were compared to group 1, their expressions in group 2 decreased significantly (p <0.05). As a result, it can be concluded that the lncRNA FAM83H-AS1 is effective in formation and progression of breast cancer by affecting the expression levels of oncogenes and tumor supressor genes.
Benzer Tezler
- Uzun kodlamayan RNA ZEB2NAT‟ın MCF7 ve MDA-MB-231 meme kanseri hücre hatlarında EMT, metastaz ve apoptoz üzerinden etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of long noncoding RNA ZEB2NAT via EMT, metastasis and apoptosis in MCF7 and MDA-MB-231 breast cancer cell lines
CANAN EROĞLU
Doktora
Türkçe
2019
Tıbbi BiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERCAN KURAR
- Identification of long non-coding RNAs overcoming tamoxifen resistance in estrogen receptor alpha positive breast cancer
Östrojen reseptörü alfa pozitif meme kanserinde tamoksifen direncini kıran uzun kodlanmayan RNA'ların belirlenmesi
HİLAL BAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Genetikİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. ÖZGÜR ŞAHİN
- Roles of chromosome 1Q in breast cancer
Kromozom 1Q'nun meme kanserindeki rolü
GAMZE TURAN
Doktora
İngilizce
2025
Moleküler TıpKoç ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÖZDE KORKMAZ
- Malat1 ve B-MYB genlerin farklı kanser hücre hatlarında gen ekspresyonların ve apoptozisin araştırılması
Investigation of gene expressi̇on and apoptosis in different cancer cell lines of malat1 and B-MYB genes
HASAN DAĞLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyokimyaKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN KILINÇ
- Üçlü negatif sporadik meme kanserinde eksozomal uzun kodlanmayan rna'ların biyobelirteç olarak araştırılması
Investigation of exosomal long non-coding rnas as biomarkers in triple negative sporadic breast cancer
HAZAL SEZGİNER GÜLER
Doktora
Türkçe
2025
GenetikTrakya ÜniversitesiBiyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAKAN GÜRKAN
DOÇ. DR. SİNEM YALÇINTEPE