Geri Dön

Kocaeli'de yaygınlık gösteren sivrisinek (Dıptera: culıcıdae) türlerinin filogenetik analizi

Phylogenetic analysis of mosquito (Diptera: culicidae) species common in kocaeli

PDF İndir

  1. Tez No: 629778
  2. Yazar: SERKAN DEDE
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. FİKRİYE POLAT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kocaeli Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada, Kocaeli yöresinden toplanan sivrisinek örneklerinin filogenetik analiz yöntemiyle tür bazında tayin edilmesi amaçlandı. Bunun için Haziran 2017-Eylül 2018 tarihleri arasında toplanan 54 sivrisinek örneğinin DNA'ları izole edildi. Ardından mitokondrial Sitokrom Oksidaz Altünite I (COI) barkod geni, Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile amplifiye edilip DNA dizi analizleri yapıldı. Filogenetik analizler GeneBank'tan alınan dizilerle birlikte değerlendirilerek gerçekleştirildi ve türler arası ilişkiler belirlendi. COI barkod geni ile Aedes, Anopheles ve Culiseta cinsine ait sivrisinekler, tür bazında yüksek benzerlik oranları ile tespit edilirken Culex pipiens kompleksi türlerin ayrımı sağlanamadı. Yalnızca Culex torrentium yüksek benzerlik oranı ile tespit edilebildi. Culex pipiens kompleksi türlerin ayırımını yapmak için ikinci aşamada Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) gen bölgesi kullanıldı. Ancak ITS2 barkod geni de Culex türlerinde COI gibi yüksek ayırım gücüne sahip değildi. Çalışılan gen bölgelerine ait tüm diziler MEGA X programına yüklenerek modelleme yöntemleri ve mesafeleri belirlendi. Bootstrap 1000'de filogenetik ağaçları oluşturuldu. Sonuç olarak, Kocaeli ilinde yapılan bu çalışmada Aedes geniculatus (n=10), Aedes albopictus (n=7), Anopheles funestus (n=1), Anopheles plumbeus (n=1), Culiseta longiareolata (n=1), Culex torrentium (n=1) ve Culex pipiens kompleksi (n=33) sivrisinekler tespit edildi.

Özet (Çeviri)

In this study, it was aimed to determine the species level of mosquito samples from a region of Kocaeli using phylogenetic analysis method. For this, DNAs of 54 mosquito samples collected between June 2017 and September 2018 were isolated. Then Mitochondrial Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) barcode gene was amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique and sequenced. Phylogenetic analyses were evaluated together with the sequences obtained from GenBank and relationships between species were determined. Mosquitoes belonging to the genus of Aedes, Anopheles and Culiseta were detected to be having high similarity rates on the basis of COI barcode gene, whereas the species of Culex pipiens complex were not distinguished. Only Culex torrentium was detected with a high similarity rate. For the second step, Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) gene region was used to detect the species of Culex pipiens complex. However, similar with COI, ITS2 barcode gene did not have high separation power in Culex species. After all sequences of the gene regions were loaded into MEGA X program, their modeling methods and distances were determined. Phylogenetic trees were created in Bootstrap 1000. In conclusion, in this study conducted in Kocaeli, mosquitoes were detected as follows: Aedes geniculatus (n = 10), Aedes albopictus (n = 7), Anopheles funestus (n = 1), Anopheles plumbeus (n = 1), Culiseta longiareolata (n = 1), Culex torrentium (n = 1) and Culex pipiens complex (n = 33).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    901254

    The spatio-temporal dynamics of aerosols in the Marmara region and impact of land cover/use on atmospheric environment

    Marmara bölgesindeki aerosollerin mekansal-zamansal dinamiksel ve arazi örtüsü/kullaniminın atmosferik ortam üzerindeki̇ etkisi

    PARIA ETTEHADI OSGOUEI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Mühendislik Bilimleriİstanbul Teknik Üniversitesi

    İletişim Sistemleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞİNASİ KAYA

  2. Tez No

    558337

    Processing and interpretation of boomer-sourced high-resolution shallow seismic data acquired in Lake Sapanca, Turkey

    Sapanca Gölü'ne ait boomer kaynaklı yüksek çözünürlüklü sığ sismik verilerin işlenmesi ve yorumlanması

    GÖKÇE İREGÖR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Jeofizik Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Jeofizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜLYA KURT

  3. Tez No

    656552

    Ana liman seçim kriterleri ve Türkiye'de ana liman seçimine yönelik bir uygulama

    Hub port selection criteria: An application for hub port selection in Turkey

    SAMET BARAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    DenizcilikDokuz Eylül Üniversitesi

    Deniz İşletmeleri Yönetimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMÜR YAŞAR SAATÇIOĞLU

  4. Tez No

    771983

    Kocaeli iline ait farklı bölgelerdeki konutların fiyatlarına etki eden faktörler

    In different regions of kocaeli province affecting your housingfactors

    MERYEM KESKİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Mimarlıkİstanbul Sabahattin Zaim Üniversitesi

    Mimarlık Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEYNEP KEREM ÖZTÜRK

  5. Tez No

    457576

    Melanositik lezyonların ayırıcı tanısında immünhistokimyasal belirteçlerin kullanılması

    Using immunohistochemical markers in the differential diagnosis of melanocytic lesions

    TUĞBA ÖZTÜRK KÖSKENLİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    PatolojiKocaeli Üniversitesi

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ÇİĞDEM VURAL

Geri Dön