İnsan kanser hücre hatlarında peroksizom proliferatör ile etkinleşen reseptör gamma genindeki pro12ala polimorfizminin araştırılması
Investigation of pro12ala polymorphism in the peroxisome proliferator-activated receptor-gamma gene in cancer cell lines
- Tez No: 614801
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ HANDE KOÇAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi, Hücre dizisi, Neoplazmlar, Peroksizomlar, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Polimorfizm-genetik, Gene expression, Cell line, Neoplasms, Peroxisome, Polymerase chain reaction, Polymorphism-genetic
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Demiroğlu Bilim Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tek Nükleotit polimorfizmleri (SNP), DNA dizisinde tek bir nükleotitte meydana gelen değişikliklerdir. SNP'ler gemomda en sık görülen genetik varyasyonlar olup gen ifadesini ve fonksiyonunu etkileyebildikleri bilinmektedir. Peroksizom Proliferatör ile Etkileşen Reseptör Gamma (PPARγ) geninin 12. kodonunun 34. nükleotidinde meydana gelen C->G dönüşümü ile oluşan prolin amino asitinin alanin amino asitine değişimi sonucunda Pro12Ala polimorfizmi oluşmaktadır. Son zamanlarda yapılan birçok çalışma Pro12Ala polimorfizminin obezite, diyabet, bazı kanser türleri gibi birçok hastalık ile ilişkili olabileceğini göstermiştir. Hücresel düzeyde ise kanser ile Pro12Ala polimorfizmi ilişkisini inceleyen bir çalışmaya rastlanmamıştır. Bu çalışmada kanser hücre hatları ile normal hücre hatlarında Restriksiyon Parça Uzunluk Polimorfizmi (RFLP) yöntemi ile Pro12Ala polimorfizmi incelenmiş ve Pro12Ala polimorfizminin PPARγ mRNA ekspresyonu üzerindeki etkisi Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (GZ-PZR) yöntemi ile araştırılmıştır. Araştırma sonucunda, taranan 13 hücre hattı içerisinde sadece AGS ve Caki-1 hücre hatlarında Pro12Ala polimorfizmi tespit edildi. Bu hücre hatlarının PPARγ mRNA ifadesinin, Pro12Ala polimorfizmi bulunmayan MCF10A, SK-BR-3, MDA-MB-453, MDA-MB-458 hücre hatlarına kıyasla daha düşük olduğu bulundu.
Özet (Çeviri)
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the variations in single nucleotide in the DNA sequence. They are the most common genetic variations in genome. It is known that SNPs may have effects on gene expression and function. The Pro12Ala polymorphism is the change of proline amino acid to alanine amino acid by the conversion of cytosin(C) to guanine (G) at 34th nucleotide of the 12th codon in the Peroxisome Proliferator Receptor Gamma (PPARγ) gene. Several recent studies have shown that Pro12Ala polymorphism may be associated with many diseases, such as obesity, diabetes, and some types of cancer. At the cellular level, there were no studies investigating the relationship between cancer and Pro12Ala polymorphism. In this study, Pro12Ala polymorphism in PPARγ gene was investigated in cancer cell lines and normal cell lines via using restriction fragment length polymorphism (RFLP) method and the effect of Pro12Ala polymorphism on PPARγ mRNA expression was investigated via using Real Time Polymerase Chain Reaction method. In conclusion; amongst 13 cell lines that are screened, Pro12Ala polymorphism was detected in only AGS and Caki-1 cell lines. PPARγ mRNA expression of these cell lines was found to be lower than PPARγ mRNA expression of cell lines without Pro12Ala polymorphism such as MCF10A, SK-BR-3, MDA-MB-453, MDA-MB-458 cell lines.
Benzer Tezler
- Investigating the oncogenic function of brain specific cyp4x1 gene in glioblastoma cancer cells using RNA-i mediated gene repression strategy
Glioblastom kanser hücrelerinde beyine özgü cyp4x1 geninin onkojenik fonksiyonunun RNA-i aracılı gen susturma stratejisiyle incelenmesi
ÖZLEM DURUKAN
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. ORHAN ADALI
PROF. ŞEVKİ ARSLAN
- İnsan akciğer kanser LC-3 hücre hatlarında TRPM5 iyon kanalının otofajik hücre ölümündeki rolünün araştırılması
The study of TRPM5 ion channel in the line of autofacial cell in lung cancer cell lines
SİYAMİ AYDIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Göğüs Kalp ve Damar CerrahisiFırat ÜniversitesiGöğüs Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AKIN ERASLAN BALCI
- Ficus carica ekstraktının insan kolon kanser hücre hatlarında proliferasyon ve invazyon üzerine etkileri
Effects of ficus carica extraction on proliferation and invasion in human colon cancer cell lines
ZEYNEP DENLİ
Doktora
Türkçe
2018
BiyokimyaSelçuk ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSAMETTİN VATANSEV
- İnsan oral skuamöz kanser hücre hatlarında fotodinamik tedavi araştırılması
Investigation of photodynamic therapy in human oral squamous cancer cell lines
MERVE ÇİFTÇİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Kulak Burun ve BoğazSivas Cumhuriyet ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MANSUR DOĞAN
- Sülfonamid türevi bileşiklerin insan kolorektal kanser hücre hatlarında sitotoksik ve apoptotik etkilerinin belirlenmesi
Determination of cytotoxic and apoptotic effects of sulfonamide derivative compounds on human colorectal cancer cell lines
BERNA KOCAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiAmasya ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TUBA YILDIRIM