Systematic analysis of the relationship between biological clock and cancer development
Biyolojik saat ve kanser gelişimi ilişkisinin sistematik analizi
- Tez No: 573267
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NURİ ÖZTÜRK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Sirkadiyen saat, birçok biyokimyasal ve fizyolojik fonksiyonda günlük ritmi sağlamaktadır ve sirkadiyen saatin bozulması, obezite, diyabet, kalp hastalıkları ve kanser gelişim riskinin artması ile ilişkilendirilmektedir. Her ne kadar, Bmal1'ın karsinogenez üzerindeki rolü üzerine germline, koşullara bağlı ya da doku spesifik knockoutların kullanıldığı çalışmalar bulunsa da; BMAL1 geninin kansere bağlı biyolojik olayları moleküler seviyede nasıl etkilediği iyi anlaşılamamıştır. Diğer sirkadiyen saat gen knockoutların aksine; Bmal1, delesyonu tek başına tam bir ritim kaybına sebep olan tek gendir. Bu nedenle, CRISPR teknolojisi ile, insan meme epitel hücre hatlarında BMAL1 geni knockout edilerek, BMAL1 geninin bu moleküler mekanizmaya katkısının anlaşılması için in vitro bir yaklaşım alınması amaçlanmıştır. Pek çok kanser epitel hücrelerden kökenlendiğinden, fibroblastlar yerine epitel hücreler tercih edilmiştir. Tümörijenik olmayan MCF10A ve invaziv tümorijenik MDA-MB-231 hücrelerinde, BMAL1 geninin iki farklı bölgede hedeflenmesi ile BMAL1 knockoutların elde edilmesinden sonra, hücre hatlarının, tümör gelişiminde belirleyici olaylar olan apoptoz ve invazyon özellikleri analiz edilmiştir. BMAL1 hasarı, her iki hücre hattını da DNA adduct yapısı oluşturan ajan cisplatin ve çift iplik kırığı oluşumunu indükleyen doxorubicine'e duyarlı hale getirirken; MDA-MB-231 hücrelerinin invaziv özelliğini arttırmıştır. Bu sonuçlar, saat genlerinin bozulmasının, ters karsinojenik etkiler verebileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
The circadian clock confers daily rhythmicity on many biochemical and physiological functions and its disruption is associated with increased risks of developing obesity, diabetes, heart disease and cancer. Although, there are studies on the role of Bmal1 in carcinogenesis using germline, conditional or tissue-specific knockouts, how BMAL1 gene affects cancer-related biological events at the molecular level is not well understood. In contrast to other circadian clock gene knockouts, Bmal1 is the only gene whose deletion alone leads to complete loss of rhythmicity. Therefore, it was aimed to taken an in vitro approach to understand the contribution of BMAL1 in this molecular mechanism using human breast epithelial cell lines by knocking out BMAL1 gene with CRISPR technology. Epithelial cells were preferred over fibroblasts as the most of cancers originate from epithelial cells. After obtaining BMAL1 knockouts by targeting the gene at two different sites from non tumorigenic MCF10A and invasive tumorigenic MDA-MB-231 cells, apoptosis and invasion properties of the cell lines were analysed as representative events in tumor development. BMAL1 disruption sensitized both cell lines to a bulky-DNA adduct forming agent (cisplatin) and a double-strand break-inducing agent (doxorubicin), while it enhanced the invasive properties of MDA-MB-231 cells. These results show that the disruption of clock genes may have opposing carcinogenic effects.
Benzer Tezler
- Yorgunluk risk yönetim sistemi kapsamında Türkiye'deki bir hava yolu şirketinde analitik ağ süreci ile risk değerlendirme yaklaşımı uygulaması
A risk assessment approach application with analytic network process in a Turkish aviation company in the context of fatigue risk management system
TUĞBA DEMİREL
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF İLKER TOPCU
- Doğancı ve Nilüfer barajları arasındaki Bursa-Nilüfer çayı kesiminde su kayaç ilişkisinin araştırılması
The Investigation of the water-rock relationship of the area between Doğancı and Nilüfer the dam on the Bursa-Nilüfer stream
FAZİLET ALTINIŞIK
- Geliştirilmiş bir ultrasonik darbeli doppler kan akış ölçme düzeninde hata kaynaklarının analizi
The Analysis of error sources at a developed pulsed doppler blood flowmeter
İNAN GÜLER
Doktora
Türkçe
1990
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. ERTUĞRUL YAZGAN
- COVID-19 pandemisinin Türkiye'deki toplumsal etkilerine sosyolojik bir bakış
A sociological overview of the social impacts of the COVID-19 pandemia in Turkey
DİCLE AKTAŞ
- Türkiye'de endemik olarak bulunan Prangos Lindl. (Umbelliferae) türlerinin moleküler sistematiği ve biyolojik aktiviteleri
Molecular systematics and biological activities of Prangos Lindl.(Umbelliferae) species which are endemic to Turkey
FEYZA ÖKE ALTUNTAŞ
Doktora
Türkçe
2012
BotanikGazi ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAYRİ DUMAN
PROF. DR. BELMA ASLIM