Geri Dön

DNA dizisi tabanlı olarak Raphidascaris acus'un moleküler tanımlaması

Molecular characterization of raphidascaris acus (bloch, 1779) (Raphidascarididae) based on DNA sequences

PDF İndir

  1. Tez No: 564515
  2. Yazar: MİNE KESKİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Parazitoloji, Parasitology
  6. Anahtar Kelimeler: Biyoloji, DNA, Dizinleme, Biology, DNA, Indexing
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu araştırmada, müze materyali olarak etil alkol ortamında korunan Raphidascaris acus türünün (Nematoda, Ascarididae) 5.8S gen dizisi üzerinden moleküler tanımlaması yapılmıştır. 5.8S rRNA gen bölgesi dizi verileri, anatomik ve morfolojik yapılarına göre tanımlaması yapılan R. acus türünün taksonomik konumunu doğrulamıştır. Bu süreçte, özel olarak tasarlanan AcusF ve AcusR primerleri kullanılmıştır. gDNA (5.8S rRNA) geninin 750 bp kısmi belirgin nükleotidleri, her numuneden doğrudan dizilenmiştir. Araştırmada incelenen 12 R.acus örneğine ait 5.8S gen dizilerinde hiçbir nükleotid varyasyonu tespit edilmedi. 5.8S hizalı nükleotid dizileri bakımından, bu araştırmanın Raphidascaris acus izolatları (MK271779-MK271790) ile iki R.acus izolatı (KT633862, KM047505) arasında minimum varyasyon görülmüştür. Buna karşın, AY603537 R.acus izolatı ile %4.11 farklılık bulunmuştur. R.acus izolatlarımız, dört Raphidascaris türü ile (JN102362.1 Raphidascaris longispicula, FJ009682.1 Raphidascaris trichiuri, JF809816.1 Raphidascaris lophii, KR232377.1 Raphidascaris macrouri) %13.03-14.97, GQ215514.1 Eustrongylides sp. dış grubu ile %26 farklılık göstermiştir. Ayrıca bu çalışma sonuçları ile etanolde fikse edilen ve uzun süre etanolde korunan R.acus gDNA'larının hasar görmediğini ve rutin olarak çoğaltılabildiği gösterilmiştir.

Özet (Çeviri)

In this study, the molecular identification of the Raphidascaris acus species (Nematoda, Ascarididae), which is protected as a material in the ethyl alcohol environment, was carried out on the 5.8S gene sequence. The 5.8S rRNA gene region sequence data confirmed the taxonomic position of the R. acus species, which was identified according to their anatomical and morphological structures. In this process, specifically designed AcusF and AcusR primers were used. 750 bp partial certain nucleotides of the gDNA (5.8S rRNA) gene was sequenced directly from each sample. No nucleotide variations were detected in the 5.8S gene sequences of the 12 R.acus samples examined in the study. In terms of the 5.8S aligned nucleotide sequences, the minimum nucleotide variations were detected between the present Raphidascaris acus isolates (MK271779-MK271790) and the two R.acus isolates (KT633862, KM047505).On the other hand, AY603537 R.acus isolate showed 4.11% difference. Our R.acus isolates differed by three Raphidascaris species (JN102362.1 Raphidascaris longispicula, FJ009682.1 Raphidascaris trichiuri, JF809816.1 Raphidascaris lophii, KR232377.1 Raphidascaris macrouri) 13.03-14.97%, GQ215514.1 Eustrongylides sp. external group 26%. In addition, the present data showed that R.acus gDNAs fixed in ethanol and preserved in ethanol for a long time were not damaged and routinely reproduced.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    564531

    DNA dizisi tabanlı olarak Ligula intestinalis L.'in moleküler tanımlaması

    Molecular characterization of Ligula intestinalis L. based on DNA sequences

    ELİF İSLAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK

  2. Tez No

    812222

    Eğirdir gölü'nden Sander lucioperca'daki Eustrongylides excisus larvalarının (NEMATODA) DNA dizisi tabanlı olarak moleküler tanımlaması

    DNA sequence based molecular identification of Eustrongylides excisus larvae (NEMATODA) in Sander lucioperca from Lake Eğirdir

    KEVSER ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK

  3. Tez No

    830338

    DNA hidrojel tabanlı aptasensör platformu ile kloramfenikol ve aflatoksin M1 tespiti

    DNA hydrogel based aptasensor platform for the detection of chloramphenicol and aflatoxin M1

    GÜLNUR CAMIZCI ARAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiKaramanoğlu Mehmetbey Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CEREN BAYRAÇ

  4. Tez No

    427678

    Altın nanopartikül ve altın nanopartikül/indirgenmiş grafen oksit kompozit yapılarının ilaç salım sistemi olarak kanser tedavisinde kullanımı

    Gold nanoparticles and gold nanoparticle/reduced graphene oxide composite structures as drug delivery system for cancer treatment

    ABBAS JAFARIZAD

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    OnkolojiAtatürk Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DUYGU EKİNCİ

  5. Tez No

    363684

    Optimization and use of DNA sequencing by capillary electrophoresis for comparative yeast genotype analysis

    Kapiler elektroforezine dayalı DNA dizileme yönteminin optimizasyonu ve mayada karşılaştırmalı genotip analizi için kullanılması

    CİHAN ERDİNÇ GÜLSEV

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR

Geri Dön