Kirazda bakteriyel kansere neden olan etmenlerin moleküler tanısı ve mücadelesine yönelik biyolojik yaklaşımlar
Molecular diagnosis of the causal agents of bacterial canker on sweet cherry and biological approaches to their control
- Tez No: 560766
- Danışmanlar: PROF. DR. HATİCE ÖZAKTAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Fitopatoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) ve Pseudomonas syringae pv. morsprunorum (Psm ırk-1/Psm ırk-2)'un neden olduğu "Bakteriyel Kanser ve Zamklanma Hastalığı'', ülkemizde kiraz yetiştiriciliği yapılan alanlarda önemli düzeyde ürün ve verim kayıplarına neden olmaktadır. Bu tez çalışmasında, İzmir ili ve çevresinde kiraz yetiştiriciliği yapılan yerlerde, bakteriyel kanser belirtisi gösteren bitkilerden alınan örneklerden patojen bakteriler izole edilmiştir. Patojenlerin kesin tanısı, LOPAT (Levan, Oksidaz, Pektinolitik aktivite, Arginin dehidrolizasyonu, Tütünde aşırı duyarlılık reaksiyonu), GATTa (Jelatinin hidrolizi, Aesculin hidrolizi, Tyrosinase aktivitesi, Tartaric asit kullanımı) testleri gibi klasik yöntemler ve patojen bakteriler için ayırt edici olan toksin üretiminden sorumlu gen bölgelerine [syringomisin (SyrB), koronatin (cfl) ve yersinibaktin (irp1)] özgü primer setleri kullanılarak yapılan klasik-PCR yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. Tanısı yapılan patojenlere karşı, bakteriyofajlar ve yararlı bakteri (YB)'ler kullanılarak iklim odası koşullarında biyolojik savaş çalışmaları yürütülmüştür. Bakteriyel kanser belirtisi gösteren kiraz bahçelerinden alınan 44 hastalıklı bitki örneğinden 11 patojen bakteri izole edilmiştir. Tanı testleri sonucunda izolatların 10 tanesi Pss olarak tanılanmıştır. YB'ler ve bakteriyofajlar ile mikroçoğaltım kiraz bitkileriyle yapılan iklim odası çalışmalarında, Pss ile inokule edilen kontrol bitkilerinde hastalık şiddeti % 48,1 saptanmıştır. Pss inokulasyonundan 10 gün sonra, YB uygulamalarının % 30'u ve bakteriyofaj uygulamalarının % 66'sı hastalık şiddetini pozitif kontrole göre, % 50'nin üzerinde azaltmıştır.
Özet (Çeviri)
Bacterial canker and gummosis disease were caused by Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) and Pseudomonas syringae pv. morsprunorum (Psm race-1/Psm race-2) results to yield and crop loses significantly on the sweet cherry cultivation areas in our country. In this thesis, pathogen bacteria were isolated from the diseased samples taken from plants showing bacterial cancer symptoms in sweet cherry cultivation areas in Izmir and it's all around. Identifications of the pathogen isolates were performed by classical methods such as LOPAT (Levan production, Oxidase, Pectinolytic activity, Arginine dihydrolase, hypersensitivity on Tobacco), GATTa (Gelatine hydrolysis, Aesculin hydrolysis, Tyrosinase activity, Tartrate utilization) tests and classic-PCR method which were used primer sets designed to gene regions responsible from toxine production [syringomycin (SyrB), coronatine (cfl) and yersiniabactin (irp1)] to discriminate for pathogen bacteria. Biocontrol studies against the identified pathogens were carried out using bacteriophages and beneficial bacteria (BB) under growth chamber conditions. Out of eleven pathogenic bacteria were isolated from 44 infected plant samples taken from cherry orchards showing bacterial canker symptoms. As a result of diagnostic tests, 10 of the isolates were identified as Pss. In plant growth chamber studies with BB and bacteriophages on micropropagated sweet cherry seedlings, disease severity was detected on the control plants inoculated with Pss as 48.1 %. Ten days after patogen inoculation, 30 % of BB treatments and 66 % of bacteriophage treatments reduced disease severity more than 50 % with respect to that of positive control.
Benzer Tezler
- Tekirdağ'da kiraz dal kanseri hastalığına neden olan bakteriyel etmenlerin izolasyonu, tanısı ve yaygınlığı
Prevalence, isolation and identification of bacterial canker pathogens on sweet cherry trees in Tekirdag prevalence, isolation and identification of bacterial canker pathogens on sweet cherry trees in tekirdag prevalence, isolation and identification of bacterial canker pathogens on sweet cherry trees in tekirdag prevalence, isolation and identification of bacterial canker pathogens on sweet cherry trees in tekirdag prevalence, isolation and identification of bacterial canker pathogens on sweet cherry trees in tekirdag
MERVE BÜLBÜL
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
ZiraatNamık Kemal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA MİRİK
- Sert çekirdeklilerde bakteriyel kansere neden olan Pseudomonas syringae pathovarlarının klasik ve moleküler yöntemlerle tanısı
Classical and molecular diagnosis of Pseudomonas syringae pathovars causing bacterial canker on stone fruits
DAMLA ERTİMURTAŞ
- Морфо-культуральная и молекулярная характеристика возбудителя бактериального рака (Pseudomonas syringae pv. syringae) косточковых плодовых культур кыргызстана
Kırgızistan'da sert çekirdekli meyve ağaçlarında bakteriyel kanser hastalığı pseudomonas syringae pv. syringae'nin morfo-kültülrel ve moleküler özellikleri
MAKSATAY AVAZOVA
Yüksek Lisans
Kırgızca
2019
ZiraatKırgızistan-Türkiye Manas ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. SAYKAL BOBUŞOVA
- Amasya ili kiraz ağaçlarındaki epifitik ve patojenik bakteriyel etmenlerin belirlenmesi
Determination of epiphytic and pathogenic bacterial agents in cherry trees in Amasya province
ENİSE ERKEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN MURAT AKSOY
- Hasat sonrası UV-C uygulamalarının bazı sert çekirdekli meyve türlerinde muhafaza süresince meyve kalitesine etkileri
Effects of postharvest UV-C treatment on fruit quality in some stone fruits species
SEVİL ÜNAL
Doktora
Türkçe
2021
ZiraatSelçuk ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FERHAN KÜÇÜKBASMACI SABIR