Genetic diversity pattern in Populus nigra populations of two major river systems in Turkey
Türkiye'deki iki temel nehir sistemindeki Populus nigra populasyonlarının genetik çeşitlilik yapısı
- Tez No: 559928
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEKİ KAYA
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Avrupa karakavağı (Populus nigra L.), Türkiye'de sosyal, ekonomik ve ekolojik açıdan önemli bir ağaç türüdür. Her ne kadar, büyük alanlarda yapılan kavak plantasyonları ekonominin ihtiyaçlarını karşılasa da, türün doğal genetik kaynakları antropojenik etkiler ve doğal biyolojik olaylar nedeniyle büyük ölçüde zarar görmüştür. Mevcut popülasyonların genetik çeşitlilik yapısını değerlendirmek için, Türkiye'deki iki büyük nehirde (Kızılırmak ve Göksu) doğal olarak yayılış gösteren 124 Avrupa kara kavak ağacı örneklenip, 20 nükleer mikrosatellite DNA lokusu kullanılarak taranmıştır. Doğal melezleme olasılığını saptamak için, 10 referans Populus deltoides L. ağacı altı mikrosatellit lokusu ile çalışılmıştır. Melez olasılığı analiz sonuçları, iki nehir sisteminden örneklenen bireylerin çoğunluğunun saf P. nigra olduğunu göstermiştir. Göksu nehrinden dört ağaç ve Kızılırmak nehri popülasyonlarından bir ağaç tanısal ve bilgilendirici alellerle yapılan yüksek olasılık hesaplarına göre F2 melezi olarak belirlenmiştir. Çalışılan popülasyonlarda azalan beklenen genetik çeşitlilik (Ortalama He = 0.55) ve heterozigotluk fazlalığı tespit edilmiştir (Ortalama Ho = 0.80). Tüm popülasyonların, düşük miktarda allelik çeşitliliğe ve heterozigot fazlalığına neden olan yakın bir darboğaz olayından geçtiği görülmektedir. Kızılırmak nehri popülasyonları, Göksu nehri popülasyonundan önemli oranda farklılaşmamıştır (FST=0.06). Kızılırmak nehrinin dört popülasyonu arasında nehir içindeki vejetative materyal (Polen, tohum, çelik) transferinin yüksek olmasından dolayı çok az genetik farklılaşma görülmektedir (FST=0.03). İnsan etkisi, darboğaz ve doğal melezleme olayları gibi biyolojik etmenlerde azalmış genetik çeşitliliğe ve yoğun genetik materyal transferi ise lokal gen kaynaklarının kirlenmesine neden olmuştur. Daha fazla genetik bozulmayı önlemek ve türün genetik kaynaklarını korumak için etkili koruma ve ıslah stratejilerinin biran evvel geliştirilmesi gerekmektedir. Bu çalışma bu tür stratejilerin geliştirilmesi için gerekli genetik bilgiyi sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
European black poplar (Populus nigra L.) is an important tree species in terms of social, economic and ecological interest in Turkey. Although, poplar plantations in large areas meet the needs of the economy, the natural genetic resources of the species have been highly degraded due to anthropogenic effects and natural biological events. To assess genetic diversity structure of natural populations, 124 naturally distributed European black poplar trees from two major rivers (Kızılırmak and Göksu) in Turkey were sampled and screened by using 20 nuclear microsatellite DNA loci. To detect the possibility of natural hybridization, 10 reference Populus deltoides L. trees were also studied with six microsatellite loci. The results from hybrid detection analysis indicated that the majority of individuals from two river systems was found as pure P. nigra. Four trees in Göksu and one tree in Kızılırmak river populations were determined as F2 hybrids according to with high probability calculations with diagnostic and informative alleles. A reduced level of expected genetic diversity (Mean He= 0.55) and the excess of heterozygosity (Mean Ho= 0.80) were detected in the studied populations. The results suggested that all populations experienced a recent bottleneck event which reduced allelic diversity caused to excess of heterozygosity. Kızılırmak river populations were not differentiated significantly from Göksu river population (FST =0.06). There was little differentiation among four populations of Kızılrımak River (FST =0.03) due to high level of vegetative material circulation within the river system. Human impact, biological events such as, bottleneck and natural hybridization events caused to eroded genetic diversity and extensive genetic material circulation from P. deltoides polluted local genetic resources. To prevent further genetic degradation and to protect genetic resources of the species, the efficient conservation and breeding strategies should be implemented as soon as possible. This study provides the necessary genetic information to develop such strategies.
Benzer Tezler
- Genetic diversity of European black poplar (Populus nigra) populations from Turkey assessed by microsatellite DNA markers
Türkiye'deki Avrupa kara kavak populasyonlarının (Populus nigra) genetik çeşitliliğinin mikrosatellit DNA markörleri ile değerlendirilmesi
ASİYE ÇİFTÇİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEKİ KAYA
- Pattern and magnitude of genetic diversity in pinus nigra subspecies pallasina populations from Kazdağı
Kazdağı'ndan örneklenen karaçamı (Pinus nigra subspecies pallasrana) populasyonlarında genetik çeşitliliğin boyutu ve yapılanması
BURCU ÇENGEL
Yüksek Lisans
İngilizce
1998
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEKİ KAYA
- Pattern of genetic diversity in Turkey oak (Quercus cerris L.) populations
Türk meşesi (Quercus cerris L.) populasyonlarında genetik çeşitliliğin yapılaşması
YELİZ TÜMBİLEN ÖZER
- Assessment of genetic diversity in yellow rust disease resistant wheat (Triticum aestivum L.) genepool and gene expression analyses
Sarı pas hastalığına dayanıklı ekmeklik buğday (Triticum aestivum L.) gen havuzunda genetik çeşitliliğin belirlenmesi ve gen anlatım analizleri
TÜLİN TAŞCIOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyomühendislikMarmara ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHU ALTINKUT UNCUOĞLU
DR. ÖZGE KARAKAŞ METİN
- Determination of genetic diversity in Salix caprea populations from the Coruh river watershed
Çoruh havzasında doğal yayılış gösteren Salix caprea populasyonlarının genetik çeşitliliğinin belirlenmesi
YASİN TOKDEMİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEKİ KAYA