Prostat kanserinin tanısında kullanılmak üzere prostat kanser antijen 3 temelli non invaziv kit geliştirilmesi
Development of non-invasive kit for use in diagnosis of prostate cancer based on prostate cancer antigen 3
- Tez No: 539888
- Danışmanlar: PROF. DR. SEVİL YÜCEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Genetik, Bioengineering, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Prostat kanseri, erkeklerde en sık görülen kanser türlerinden biridir. Prostat kanserinin tanısı için hastaya uygulanan biyopsinin zahmetli ve rahatsız edici olmasından dolayı teşhis için biyobelirteçler kullanılmaktadır. Serum örneğinde Prostat Spesifik Antijen (PSA) tespiti prostat kanserinin tanısında en sık kullanılan invaziv olmayan bir yöntemdir. Fakat söz konusu yöntem hassaslık ve özgünlük açısından zayıf kalmaktadır. Bu araştırmanın amacı, prostat kanseri tanısında serum PSA seviyesine alternatif olarak idrarda Prostat Kanser Antijen 3 (PCA3) mRNA'yı tespit etmek için hassaslık ve özgünlük değerleri yüksek yeni bir kit geliştirmektir. Kartal Eğitim ve Araştırma Hastanesi'ne başvurmuş yaşları 55-70 arasında olan 82 vakanın rektal muayenelerinden sonra serum PSA değerleri ölçülmüş ve ardından biyopsi ile prostat kanseri varlığı araştırılmıştır. Çalışmaya alınan kişilerden 64'ü prostat kanseri ve 18'i sağlıklı bireylerdir. Bu vakalardan toplanan idrar örneklerinde PCA3 ekspresyon (mRNA) düzeyi, Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonuna (RT-PZR) dayanan geliştirdiğimiz kit ile tespit edildi. Ardından bu PCA3 seviyeleri PSA ve biyopsi sonuçları ile karşılaştırıldı. PCA3 mRNA seviyeleri ile altın standart olan biyopsi sonuçları karşılaştırıldığında testin hassaslığı %63, özgünlüğü %100, pozitif öngörüsel değeri (PPV) %100 ve negatif öngörüsel değeri (NPV) %43 olarak bulunmuştur. Analiz bulguları neticesinde, biyopsi sonucunda prostat kanseri teşhisi konan hasta grubunda PCA3 ekspresyonu görülme sıklığı %63 iken (n=40) sağlıklı grupta hiç gözlenmemiştir. Hasta grubu ile sağlıklı grup arasında PSA değeri ortalamalarının istatistiksel düzeyde anlamlı olarak farklılık gösterdiği belirlenmiştir (p<.001). Buna göre hasta grubunda PSA seviyesinin, sağlıklı gruba kıyasla daha yüksek olduğu bulunmuştur. Negatif öngörüsel değer, test ile sağlıklı olduğu belirlenen bireylerin gerçekten sağlıklı olma yüzdesini ifade eder. Dolayısıyla bu çalışmada PCA3 seviyesine göre sağlıklı tespit edilen 42 bireyden 18 bireyin gerçekten sağlıklı olup olmadığı biyopsisi alınmadan anlaşılamamaktadır. Geliştirdiğimiz PCA3 tespit kiti, prostat kanserini tek başına tespit etmede yeteri kadar hassas bulunamamıştır. Fakat bu kitin sonuçlarının, PSA ve biyopsi sonuçları ile birlikte değerlendirilmesi anlamlı görülmüştür.
Özet (Çeviri)
Prostate cancer is one of the most prevalent cancers seen in men. Biomarkers are used for diagnosis because of the fact that biopsy applied to patient for the diagnosis of prostate cancer is laborious and uncomfortable. Detection of Prostate Specific Antigen (PSA) in serum sample is the most commonly used a non-invasive method. However, this method is weak in terms of sensitivity and specificity. Aim of this study is to develop a novel kit with high sensitivity and specificity for the detection of Prostate Cancer Antigen 3 (PCA3) mRNA in urine as an alternative for the serum PSA level used in the diagnosis of prostate cancer. Following rectal examinations of 82 subjects aged 55 to 70 years who were applied to Kartal Training and Research Hospital the serum PSA levels were quantified and then presence of prostate cancer was evaluated by biopsy. Among the subjects attended to study 64 were prostate cancer and 18 were healthy. PCA3 expression (mRNA) level in urine samples collected from the subjects were detected by our developed kit based on Real Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). Then, the PCA3 levels were compared with the results of PSA and biopsy. When PCA3 mRNA levels were compared with results of biopsy that is gold standard sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (PPV) of the test were found 63%, 100%, 100% and 43% respectively. As a result of analysis findings, while PCA3 expression incidence was 63% (n=40) in patient group who diagnosed as prostate cancer by biopsy results it was not observed in healthy group. It was determined that the PSA level averages between patient group and healthy group were significantly different statistically (p<.001). PSA level of patient group was found higher as compared to healthy group accordingly. Negative predictive value refers to the percentage of being healthy indeed in subjects who are determined healthy by the test. Therefore, it could not be understand that whether 18 of 42 subjects who were recorded healthy according to PCA3 level in this study were really healthy or not without the biopsy. Our developed PCA3 detection kit was not found sensitive sufficiently to detect prostate cancer alone. But evaluation of kit's results with the results of PSA and biopsy together was seen significant.
Benzer Tezler
- Transüretral rezeksiyon materyallerinde prostat adenokarsinom ile benign tanı alan diğer olgularda p16, p21, p53 ve p57 ekspresyonunun incelenmesi
Examination of p16, p21, p53 and p57 expression in other patients with benign diagnosis and prostate adenocarcinoma in transuretral resection materials
MUHAMMET SAFA AYAZOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
PatolojiRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLNAME FINDIK GÜVENDİ
- Prostat kanserli hastalarda telomeraz aktivitesinin araştırılması
Investigation of telomerase activity in prostate cancer patients
LEVENT ZORBEK
Doktora
Türkçe
2012
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE MERGEN
PROF. DR. MÜBECCEL DURUSOY
- Radikal prostatektomi öncesi PSA hızının ameliyat sonrası nüksü öngörmedeki yeri
The role of PSA velocity before radical prostatectomy in predicting postoperative recurrence
SAİD ELHAJ
- Prostat kanseri ve BPH (Benign prostat hiperplazisi) hastalarında idrarda tüm genom ekspresyon araştırması
Whole genome expression analysis in urine samples of prostate cancer and BPH (Benign Prostate Hyperplasia) patients
TAHA REŞİD ÖZDEMİR
- Metastatik kastrasyona dirençli prostat kanserinde kemohormonal tedaviye direncin belirlemesinde SOX2 ve AGR2 biyobelirteçlerinin kullanılabilirliğinin araştırması
Investigation of the usability of SOX2 and AGR2 biomarkers in determining resistance to chemohormonal therapy in prostate cancer resistant to metastatic castration
MAHSA BAYRAMI