Kuzularda büyüme özellikleri için klasik ve bayesyen yöntemlerle genetik parametre tahminleri
Estimation of genetic parameters for growth trait in lamb by using classical and bayesian methods
- Tez No: 534335
- Danışmanlar: PROF. DR. SİNAN BAŞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, Klasik (Frekansçı, Berkeley) yaklaşım ve Bayesyen yaklaşım kullanılarak, büyüme özelliklerinden olan doğum ağırlığı (DA), sütten kesim ağırlığı (SKA) ve doğum ile sütten kesim dönemi arasındaki günlük canlı ağırlık artışına (GCAA) ait genetik parametre tahminlemesi yapılmıştır. Araştırmada kullanılan veri ve pedigri bilgisi TAGEM tarafından yürütülen Halk Elinde Küçükbaş Hayvan Islahı Ülkesel Projesi çerçevesinde Damızlık Koyun Keçi Yetiştiricileri Birliği'ne kayıtlı işletmelerde 2012-2016 yılları arasında doğan ve geleneksel şartlarda yetiştirilen, 80 baba ve 1917 anadan olan 4971 bireyden elde edilmiştir. Üzerinde durulan özelliklerle (DA, SKA, GCAA) ilgisi olduğu düşünülen yıl (mevsim), cinsiyet, ana yaşı ve işletme büyüklüğünün etkileri istatistiksel olarak çok önemli bulunmuştur (p<0.01). DA, SKA ve GCAA'na ait en küçük kareler ortalamaları sırasıyla 3.45±0.02 kg, 17.93±0.05 kg ve 0.236±0.001 g'dır. Parametre tahminleri, eklemeli genetik varyans, hata varyansı, fenotipik varyans, kalıtım derecesi, üzerinde durulan özellikler arasındaki kovaryans, maternal genetik etki, permanent maternal genetik etki değerleri farklı kombinasyon içeren tek özellikli altı birey modeli kullanılarak yorumlanmıştır. Araştırmada üzerinde durulan özelliklere ait varyans unsurları, kalıtım dereceleri MTDFREML ve R programındaki MCMCglmm paketi yardımıyla hesaplanmıştır. Klasik yaklaşımda her bir özellik için en uygun model Akaike Bilgi Kriteri (AIC) ve -2LogL değerlerine göre seçilirken, Bayesçi yaklaşımda Deviance Bilgi Kriteri (DIC) değerine göre seçilmiştir. Buna göre, DA'na ait kalıtım derecesi orta düzeyde (0.20) bulunmuşken, SKA ve GCAA'na ait kalıtım derecesi tahminleri benzer ve yüksek düzeydedir (0.35). Tüm modellerde, maternal etkiye ait genetik varyansın düşük olduğu görülmüştür. Genetik parametre tahminleri için her iki yaklaşımda da en sade modelin en uygun model olduğu ve maternal etkiye ait varyansların hesaplanabilmesi için veri yapısının elverişli olmadığı kanısına ulaşılmıştır.
Özet (Çeviri)
This study was conducted to estimate genetic parameters of birth weight (BW), weaning weight (WW) and average daily gain pre-weaning (ADG), which are growth traits in Classical (Frequentist, Berkeley) approach and in Bayesian approach. Data and pedigree information used in this research were obtained from breeders that in Sheep and Goat Breeders' Associations of Turkey which were borned between 2012-2016 years on 4971 lams which were raised traditional conditions descended from 80 sires and 1917 dams. The effects of season, sex, dam age and flock size factors that were thought to be effect to mention traits (BW, WW, ADG) were found very important statistically (p<0.01). The least squares means of BW, WW and ADG were obtained as 3.45±0.02 kg, 17.93±0.05 kg and 0.236±0.001 g, respectively. For this aim, additive genetic variance, error variance, phenotypic variance, heritability, covariance between traits, maternal genetic effect and permanent maternal genetic effect were interpreted using six univariate animal models including different combination. Variance components and heritability of these traits were calculated by using MTDFREML and MCMCglmm package in R software. For each trait, the most appropriate model was chosen based on Akaike Information Criteria (AIC) and -2LogL values in the classical approach and was chosen based on Deviance Information Criterion (DIC) value in the Bayesian approach. Heritability of BW was found moderate (0.20), heritabilities of WW and ADG were estimated similar and high (0.35). It has been seen that for all models, the genetic variance associated with maternal effect was lower. The most suitable model is the basic model for the approaches. It has been concluded that the data structure was not suitable for the estimation of maternal effects.
Benzer Tezler
- Erken puberte tanısıyla izlenen çocukların değerlendirmesi
Diagnostic evaluation of children WHO were followed up DUE to precocious puberty
ERDEM TOPACIK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BÜLENT HACIHAMDİOĞLU
DOÇ. DR. SERDAR CÖMERT
- Kent meydanı: Kamusal-estetik çerçevede eleştirel bir değerlendirme
Urban square: A critical approach within the concepts of“public”and "aesthetics
NEVBAHAR ATALAY
- Puberte prekoks tanılı hastaların klinik özellikleri ve tedavi sonu bulgularının retrospektif olarak değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of clinikal properties and post-treatment findings of precocious puberty patients
ÜLKÜ GÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıUludağ ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER FARUK TARIM
- Manisa yöresinde demir eksikliği anemi prevalansı ve demir eksikliği anemisinde tarama testi olarak rutin hemogram, RDW ve ferritinin kullanımı
The prevalance of iron deficieny anemia in Manisa and using of hemogram, RDW and ferritin for searcing of iron deficiency anemia
VİLDAN ÜRK TAŞYENEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıCelal Bayar ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ALİ ONAĞ