Mide kanseri dokularında hedeflenmemiş metabolomiks teknolojileri yardımıyla alternatif tanı ve yöntemlerin geliştirilmesi
Development of alternative diagnosis and methods with the assistance of metabolomics technologies in stomach cancer tissues
- Tez No: 533784
- Danışmanlar: PROF. DR. YÜCEL KADIOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: Adenokarsinom, Biyobelirteçler-tümör, Kromatografi-sıvı, Kütle spektrometri, Metabolik ağlar, Metabolomikler, Mide neoplazmları, Neoplazmlar, Sinyal nakli, Teşhis, Adenocarcinoma, Biomarkers-tumor, Chromatography-liquid, Mass spectrometry, Metabolic networks, Metabolomics, Stomach neoplasms, Neoplasms, Signal transduction, Diagnosis
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Analitik Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç. Bu çalışmada, kanser kaynaklı ölümlerde ikinci sırada yer alan mide kanserinin tanı ve tedavisinde ayrıca bu kanser türünün mekanizmalarının aydınlatılmasında etkili bir alan olan metabolomiks çalışmaları ile potansiyel biyobelirteçlerin keşfi ve metabolik yolakların karakterize edilmesi amaçlanmaktadır.. Materyal ve Metot. Alınan doku örnekleri sıvı azot içerisinde dondurularak -80 ° C'de saklandı. Ekstraksiyon işlemi için çıkarılan doku örneklerinin tartımı yapıldıktan sonra elektrik homojenizatörde parçalandı. Santrifüj sonrası toplanan süpernatantları vakumlu konsantratörde tamamen kuruyuncaya kadar uçurma işlemi gerçekleştirildi. Doku örnekleri mobil faz içerisinde çözüldükten sonra Q-TOF LC/MS cihazı ile pozitif iyon modunda analiz edildi. Analiz sonuçları çoklu değişkenli veri analiz yöntemleri kullanılarak değerlendirildi. Bulgular: LC/QTOF-MS ile analiz edilen kanserli ve kontrol gruplarının sonuçları karşılaştırıldı ve istatistiksel olarak anlamlı 31 metabolit tanımlandı. Metabolitlerin ilişkili olduğu yolaklar analiz edildiğinde aminoaçil t-RNA biyosentezi, alanine, aspartat, glutamat metabolizması, glisin, serin, treonin metabolizması ve valin, lösin, izolösin biyosentezi ve yağ asidi biyosenteziyle anlamlı derecede ilişkili olduğu görüldü. Sonuç: Tanımlanan 31 tane anlamlı metabolitin tümörlü dokulardaki glutamin seviyesindeki değişiklikler, l-alanin, l-asparajin, l-lösin, l-valin, glisin, l-treonin, gibi amino asitlerin seviyelerindeki değişiklikler, glukoz konsantrasyonunda meydana gelen değişiklikler, miristik asit, palmitik asit, oleik asit gibi yağ metabolizmasında etkili olan değişiklikler ve C16 sfingan seviyesindeki artışın ileri dönemde yapılacak araştırmalara yol göstereceği kanaatindeyiz. Anahtar Kelimeler. Adenokarsinom, biyobelirteç, , metabolomiks, metabolik yolak, omiks teknolojisi, Q-TOF LC/MS
Özet (Çeviri)
AİM:. The aim of this study is to identify the potential biomarkers and metabolic pathways in the diagnosis and treatment of gastric cancer which is the second most common cause of cancer-related deaths. Materials and Methods: Tissue samples were frozen in liquid nitrogen and stored at -80 ° C. After weighing the extracted tissue samples for the extraction process, the electricity was disintegrated in the homogenizer. After centrifugation, the supernatants were collected in the vacuum concentrator until complete drying. Tissue samples were analyzed in the positive ion mode with the Q-TOF LC / MS device after dissolving in the mobile phase. Analysis results were evaluated using multivariate data analysis methods Results: Results of cancer and control groups analyzed by QTOF-LC/MS were compared and 31 metabolites were identified statistically significant. When the pathways associated with metabolites were analyzed, it was seen that aminoacyl t-RNA biosynthesis, alanine, aspartate, glutamate metabolism, glycine, serine, threonine metabolism and valine, leucine, isoleucine biosynthesis and fatty acid biosynthesis were significantly related. Conclusion: Changes in glutamine levels in tumor tissues of 31 significant metabolites identified, changes in levels of amino acids such as 1-alanine, 1-asparagine, 1-leucine, 1-valine, glycine, 1-threonine, changes in glucose concentration, myristic acid, palmitic acid We believe that changes in fat metabolism like oleic acid and increase in C16 sfingan level will lead to further research. Keywords. Adenocarcinoma, biomarker, metabolomics, metabolic pathway, QTOFLC/MS omix technology,
Benzer Tezler
- Adjuvan tedavi alan mide kanseri hastalarında HER-2 ve TOPO II alfa aşırı ekspresyonunun klinikopatolojik bulgular ve sağkalım ile ilişkisi
Overekspression of HER-2 and TOPO II alpha in gastric cancer who received adjuvant therapy: Their relationship with clinicopathologic paremeters and survival outcomes
ESRA ERMİŞ TURAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
GastroenterolojiErciyes ÜniversitesiDahili Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. METİN ÖZKAN
- Mide kanseri dizin hücrelerine uygulanan CAPE'nin biyomarkerler üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of CAPE on the biomarkers which applicated of gastric cancer cell line
TUBA BEKTAŞ
- Hiyalüronan modifikasyonunun mide kanseri etiyopatogenezindeki rolünün araştırılması
Başlık çevirisi yok
AHMET TURAN DURAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Genel CerrahiErciyes ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HIZIR YAKUP AKYILDIZ
- Türk toplumunda mide kanseri olgularında KLF-5 gen ekspresyon düzeyinin araştırılması
KLF-5 gene expresion in gastric cancer
BÜLENT AKSEL
Tıpta Yan Dal Uzmanlık
Türkçe
2012
OnkolojiAnkara ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ EKREM ÜNAL
- Deneysel olarak mide kanseri oluşturulan farelerde irisin hormonu ve bazı kaşektik faktörlerin ekspresyonlarının incelenmesi
Investigation of the expression of irisin and some cachectic factors of experimentally gastric cancer developed mice
DİLER US ALTAY
Doktora
Türkçe
2015
BiyokimyaKaradeniz Teknik ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EŞREF EDİP KEHA