Quantitative expression analysis of the genes potentially i̇nvolved in clavulanic acid overproduction in streptomyces clavuligerus
Streptomyces clavuligerus da klavulanik asit aşırı üretiminde görevli olabilecek genlerin kantitatif gen ifadesi analizi
- Tez No: 528551
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Biyoloji, Microbiology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Streptomyces clavuligerus, sefamisin C (CC) ve güçlü bir β-laktamaz inhibitörü olan klavulanik asit (CA) gibi tıbbi açıdan önemli β-laktam antibiyotiklerin üreticisidir. Laboratuvarımızda iki ayrı Streptomyces clavuligerus suşu için (endüstriyel bir suş olan, CA aşırı üreticisi suş DEPA ve referans bir suş olan NRRL3585) için 2-DE-MALDI-MS ve GeLC-MS ile oldukça detaylı karşılaştırmalı proteomik analizler gerçekleştirilmiş ve farklı ifade edilen proteinler tanımlanarak. yüksek CA titresine karşılık gelen proteinler saptanmıştı. Bu proteinler sekonder metabolit üretimi, sekonder metabolizma regülatörleri, primer metabolizma, stres yanıtı ve fonksiyonu bilinmeyenler gibi farklı fonksiyonel kategorilere aittir. Mevcut araştırmanın amacı, bu kategoriler için seçilen, seviyesi artmış ya da azalmış 26 ayrı proteine karşılık gelen genlere ait transkriptlerin nicel düzeylerini belirlemektir.
Özet (Çeviri)
Streptomyces clavuligerus is the producer of the medically important β-lactam antibiotics, including cephamycin C (CC) and the potent β-lactamase inhibitor clavulanic acid. (CA). We have already undertaken an extensive comparative proteomic analysis by using both 2-DE-MALDI-MS and GeLC-MS approaches between an industrial CA overproducer, namely DEPA and the reference strain NRRL3585. In this context, we documented several differentially expressed (over- and under-represented) proteins accounting for high CA titers in the former strain to include both common and unique ones. In this work, a total of 26 proteins were selected among the proteins that belonged to different functional categories such as secondary metabolite production, regulators of secondary metabolism, primary metabolism, stress response and several unknowns, and subjected to gene expression analysis. Thus, the aim of the present study is to reveal quantitative levels of the transcripts representing the proteins selected among over- and under-represented ones of these categories.
Benzer Tezler
- Yaşa bağlı makula dejenerasyonu (YBMD) etyolojisinden sorumlu genlerin in silico analiz ile değerlendirilmesi ve klinik yaklaşımla doğrulanması
Evaluation of genes responsible for the etiology of age-related macular degeneration (AMD) via in silico analysis and validation through clinical approach
SALİH ERKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
Göz HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiGöz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. IŞIL KUTLUTÜRK KARAGÖZ
- Ceviz çeşitlerinin tuza tolerans durumlarının belirlenmesi ve cevizde tuz stresi ile ilgili genlerin RNA sekanslaması ile ortaya çıkarılması
Determination of salt tolerance levels of walnut cultivars and identification of genes responsible for salt stress in walnut by rnaseq analysis
MESUT ADA
- Rezeke Edilmiş Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde ERCC1 ve EGFR Ekspresyonunun Sağkalıma Etkileri
Effects of ERCC1 and EGFR Expression on Survival in Resected Non-Small Cell Lung Cancer
HÜLYA ABALI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
Göğüs HastalıklarıSağlık BakanlığıGöğüs Hastalıkları ve Tüberküloz Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEDAT ALTIN
- Verticillium dahliae dayanım genlerinin Solanum linnaeanum türünden belirlenmesi ve karakterizasyonu
Determination and characterization of Verticillium dahliae resistance genes from Solanum linnaeanum
İLKNUR KÜLAHLIOĞLU ÇEĞİL
Doktora
Türkçe
2025
ZiraatHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEBAHATTİN ÇÜRÜK
- Glioblastoma hücrelerinde mTORC1/2'nin dual hedeflenmesinin globalmetilasyon ve histon modifikasyonları üzerinde yarattığı değişikliklerin incelenmesi
Başlık çevirisi yok
BİLGESU AK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
GenetikEge ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK AKIN
PROF. DR. ASUDE DURMAZ