Evaluation of YB-1 transcriptional factor, DNA glycosylase hNTH1 and human topoisomerase I functions in relation to drug resistance and DNA repair mechanisms
YB-1 transkripsiyon faktörü, DNA glikozilaz hNTH1 ve insan topoizomeraz I enzimi işlevlerinin ilaç direnci ve DNA tamir mekanizması kapsamında değerlendirilmesi
- Tez No: 513766
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEKİ TOPÇU, DR. JOANNA TIMMINS
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyokimya, Biyoteknoloji, Biology, Biochemistry, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Anti-kanser tedavisine karşı kazanılan direnç yaygın ve önemli bir klinik sorundur. Fonksiyonel DNA onarım yolları, ilaç direnci için yaygın bir mekanizma sağlamaktadır, ancak aynı zamanda, hedeflenen proteinin mutasyonlarından veya ekspresyonunun azalmasından da kaynaklanabilmektedir. Çok işlevli Y-box bağlanma proteinin (YB-1) aşırı ekspresyonu veya nükleer lokalizasyonu, tümörlerde ilaç direnci için bir prognostik belirteç olarak kabul edilmektedir. YB-1'in hücrelerde birkaç etkileşim partneri vardır; bu çalışmada, YB-1 ile aktiviteleri uyarıldığı gösterilen insan DNA onarım enzimi NTH1 (hNTH1) ve insan DNA topoizomeraz I (hTopoI) ile olan etkileşimleri üzerine odaklandık. Cisplatin-dirençli tümör hücrelerinde hNTH1/YB-1 kompleks oluşumunun arttığı gösterilmiştir. İnsan TopoI, DNA süpersarmallarının hücresel regülasyonunda yer alan ve birkaç anti-kanser ajanının hedefi olan önemli bir enzimdir. YB-1, hTopoI aktivitesini ve tümör hücrelerinin hTopoI inhibitörü Campthotecin'e olan duyarlılığını artırmaktadır. Bu çalışmada YB-1/hNTH1 ve YB-1/hTopoI komplekslerini in vitro ve in vivo olarak, ilaca dirençli tümörlerin tedavisi için yeni stratejiler tanımlamak ve geliştirmek için Fluoresans Rezonans Enerji Transferi (FRET) ölçümlerini kullanarak karakterize ettik. Ayrıca, hNTH1/YB-1 kompleksinin potansiyel inhibitörlerini bulmak için iki orta ölçekli kimyasal kütüphaneyi taramak üzere orijinal bir FRET-bazlı biyosensör tasarladık ve optimize ettik. Biyosensörümüzün FRET seviyesini önemli ölçüde azaltan birkaç“hit”tespit ettik. Bu bileşiklerin bazıları için, toz bileşiklerden başlayarak bu sonuçları tekrar ürettik, doz-cevap eğrileri gerçekleştirdik ve alternatif bağlama deneyleri kullanarak hNTH1/YB-1 arayüzünün inhibitörleri olarak onayladık. Birlikte ele alındığında, sonuçlarımız YB-1'in DNA onarımı ve DNA relakse edici enzimleriyle doğrudan etkileşime girip uyardığını ve YB-1/hNTH1 arayüzünü hedef almanın, anti-kanser ilaçlarının geliştirilmesi için ilginç yeni bir stratejiyi temsil ettiğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Acquired resistance to anti-cancer therapy is common and is a major clinical issue. Functional DNA repair pathways provide a common mechanism for drug resistance, but it can also result from mutations or reduced expression of the targeted protein. The overexpression or nuclear localisation of the multifunctional Y-box binding protein (YB-1) is considered as a prognostic marker for drug resistance in tumours. YB-1 has several interaction partners in cells; in this study, we have focused on its interaction with the human DNA repair enzyme NTH1 (hNTH1) and human DNA topoisomerase I (hTopoI), two enzymes that have been shown to be stimulated by YB-1. The abundance of the hNTH1/YB-1 complex was shown to increase in cisplatin-resistant tumour cells. Human TopoI is an essential enzyme involved in cellular regulation of DNA supercoiling and is the target of several anti-cancer agents. YB-1 enhances the activity of hTopoI and its sensitivity to hTopoI inhibitor, camptothecin in tumour cells. We have characterised the YB-1/hNTH1 and YB-1/hTopoI complexes in vitro and in vivo using Fluorescence Resonance Energy Transfer (FRET) measurements to identify and develop new strategies for the treatment of drug-resistant tumours. We also designed and optimised an original FRET-based biosensor to screen two medium-sized chemical libraries in order to find potential inhibitors of the hNTH1/YB-1 complex. Several“hits”were identified that significantly reduced the FRET level of our biosensor. For some of these compounds, we have reproduced these results starting from powders, have performed dose-response curves and have validated their actions as inhibitors of the hNTH1/YB-1 interface using alternative binding assays. Taken together, our results demonstrate that YB-1 directly interacts and stimulates a DNA repair and a DNA relaxing enzyme and targeting the YB-1/hNTH1 interface represents an interesting new strategy for the development of anti-cancer drugs.
Benzer Tezler
- Obsesif Kompulsif Bozukluk" tanılı 7-18 yaş arası çocuk ve ergenlerde galectin-1, galectin-3, NGAL (Lipocalin-2) ve GDNFdüzeylerinin değerlendirilmesi
Evaluation of Galectin-1, Galectin-3, NGAL (Lipocalin-2) and GDNF levels in child and adolescent aged 7-18 years diagnosed with“Obsessive Compulsive Disorder”
MELEK BOZDOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
PsikiyatriNecmettin Erbakan ÜniversitesiÇocuk Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER FARUK AKÇA
- Epiretinal membran cerrahisi geçiren hastalarda renkli görme ve kontrast duyarlılığın değerlendirilmesi
Evaluation of color vision and contrast sensitivity in patients understanding epiretinal membrane surgery
REYHAN HAZAL KAPLAN KORUK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Göz Hastalıklarıİstanbul Medipol ÜniversitesiGöz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE ÖZPINAR
- Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Hematolojisi Bilim Dalında hemofagositik lenfohistiyositozis tanısı almış pediyatrik olguların retrospektif değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of pediatric patients diagnosed with hemophagositic lymphohistiocytosis in Ege University Faculty of Medicine Pediatric Hematology Department
LEYLA ALIYEVA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DENİZ YILMAZ KARAPINAR
- Laparoskopik kolesistektomi öncesi ultrasonografi ile intraoperatif teknik zorlukların değerlendirilmesi
Evaluation of intraoperative technical difficulties before laporoscopic cholecystectomy by using ultrasonography.
SERKAN ŞENGÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Genel CerrahiSağlık BakanlığıGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET OĞUZ HASDEMİR
- CAD-CAM teknolojisiyle hazırlanan titanyum disklerin, farklı yöntemler kullanılarak düzenlenen yüzeyinin; titanyum porselen bağlantısına etkisinin in vitro olarak değerlendirilmesi
In vitro evaluating the effect of titanium porcelain bond strength on the treatead surface of titanium discs prepared by CAD-CAM technology
İBRAHİM HALİL TEPE
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2019
Diş HekimliğiDicle ÜniversitesiProtetik Diş Tedavisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. REMZİ NİĞİZ
PROF. DR. ZELAL SEYFİOĞLU POLAT