Glioblastoma multiforme (GBM) tümör hücrelerinin ısıng modeli kullanılarak creutz cellular automaton ile simülasyonu
Simulation of glioblastoma multiforme (GBM) tumor cells using ising model on the creutz cellular automaton
- Tez No: 507485
- Danışmanlar: PROF. DR. ZİYA MERDAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tümör için yapılan bilgisayar modellemeleri, tümörün karmaşık doğası ve bilgisayarların kapasitelerinden dolayı zorluklara sahiptirler; fakat bu modeller tümör ile tümörün mikro çevresi arasındaki etkileşimini anlamak için farklı bakış açısı sağlamaktadır. Ayrıca bilgisayar modellemeleri, kanserin özelleştirilmiş tedavileri için stratejiler geliştirmektedir. Bu çalışmada bir beyin tümörü olan glioblastoma multiforme (GBM) tümör hücrelerinin iki boyutta Ising modeli kullanılarak Creutz Cellular Automaton ile simülasyonu yapılmıştır. Bu çalışmanın amacı, damarlanmanın olmadığı durumda, kanser hücreleri ile sağlıklı hücreler arasındaki etkileşimler sonucunda kanser hücrelerinin yarıçapa göre gelişimini zamanın bir fonksiyonu olarak incelemektir. CCA algoritması üzerinde kullanılan Ising model, tümör gelişimini zamanın bir fonksiyonu olarak gözlemek için konum uzayındaki lokal etkileşimleri ve kesikli zaman basamakları ile deterministik yaklaşım sağlamaktadır. Simülasyon sonuçları sabitlenmiş tümör yarıçapları için verilmiştir ve sonuçlar teorik ve klinik datalar ile uyumludur.
Özet (Çeviri)
Computational models for tumors have difficulties due to complexity of tumor nature and capacities of computational tools, however, these models provide different visions to understand interactions between tumor and its micro environment. Moreover computational models have been progressed to improve individualized treatments strategies for cancer. In this study, cells of glioblastoma multiforme (GBM) which is one of the brain tumor types are simulated by using two dimensional Ising model with Creutz cellular automata. The aim of this study is to investigate avascular cancer cells growth which is as a result of interaction between healthy cells cancer cells with respect to radius of tumor and as a function of time. Ising model on CCA algorithm provides a deterministic approach with discrete time steps and local interactions in position space to view tumor growth as a function of time. Simulation results are given for fixed tumor radius and they are compatible with theoretical and clinic data
Benzer Tezler
- Temozolomid (TMZ) dirençli ve normal Glioblastoma Multiforme (GBM) hücre hatlarında donafenib ve radyoterapi uygulamasının hücre sağkalımı açısından değerlendirilmesi
Evaluation of donafenib and radiotherapy application in temozolomide (TMZ) resistant and normal Glioblastoma Multiforme (GBM) cell lines in terms of cell survival
EMİNE YAZICI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Histoloji ve EmbriyolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GAMZE TANRIÖVER
- Farklı core-shell yapısındaki süperparamanyetik demir oksit nanoparçacıkların glioblastoma multiform (GBM) üzerindeki anti-kanser aktiviteleri
Anti-cancer activities of superparamagnetic iron oxide nanoparticles which have different core-shell structure in glioblastoma multiforme (GBM)
TARIK ÖZTUZCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiÜsküdar ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SALİH GENCER
DOÇ. DR. NURCAN DOĞAN BİNGÖLBALİ
- Investigating novel TRAIL sensitizing drugs for glioblastoma multiforme
Glioblastoma multiform'da TRAIL duyarlılığını artıran yeni ilaçların taranması
FİLİZ ŞENBABAOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyolojiKoç ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TUĞBA BAĞCI-ÖNDER
- Apoptotik hücre ölümüne dirençli glioblastome multiforme hücreleri üzerine mezenkimal kök hücre ve çeşitli inhibitörlerin etkisinin in vitro incelenmesi
Apoptoti̇k hücre ölümüne di̇rençli̇ gli̇oblastome multi̇forme hücreleri̇ üzeri̇ne mezenki̇mal kök hücre ve çeşi̇tli̇ i̇nhi̇bi̇törleri̇n etki̇si̇ni̇n i̇n vi̇tro i̇ncelenmesi̇
BAHATTİN TANRIKULU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
NöroşirürjiMarmara ÜniversitesiCerrahi Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. MUSTAFA İBRAHİM ZİYAL
- Interrogating the function of chromatin modifying enzymes in TRAIL response of GBMs
GBM'lerin TRAIL'a cevabında kromatin modifiye-edici enzimlerin fonksiyonlarının araştırılması
İBRAHİM ÇAĞRI KURT
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
OnkolojiKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TUĞBA BAĞCI ÖNDER