Geri Dön

Helicobacter pylori'nin virulans genlerinin araştırılması ve klaritromisin direnci ile ilişkisinin belirlenmesi

Investigation of virulance genes of Helicobacter pylory and determination of association with clarythromycin resistance

  1. Tez No: 501835
  2. Yazar: ARZU İRVEM
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FETİYE KOLAYLI
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kocaeli Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

H.pylori gastrit, gastrik ve duodenal ülser, gastrik kanser ve MALT lenfoma ile işkili önemli bir insan patojenidir. H.pylori virülans genleri ile gastrik hastalıklar arasında ilişkinin varlığı bilinmekle birlikte çeşitli coğrafik bölgelerde farklılıklar göstermektedir. Farklı coğrafik bölgelerde, H.pylori'nin klarithromisin direnci ile genetik paterninin dağılımı arasında ilişki ile ilgili sonuçlar farklılık göstermektedir. Bu çalışmada, Kocaeli bölgesindeki dispeptili hastalarda H. pylori klaritromisin direnci ve virülans genlerinin prevalansını; bu virülans genleri ile klaritromisin direnci arasındaki ilişkiyi araştırmayı amaçladık. H.pylori 16S rRNA genine spesifik primerler kullanılarak yapılan Polimeraz zincir reaksiyonunda (PCR) yetmiş sekiz hastanın (40 gastritli, 20 gastrik ülserli, 9 duodenitli, 9 normal endoskopikbulgulu) biyopsi örneğinde H. pylori pozitif olarak belirlendi. Virülans genlerinin varlığı klasik PCR yöntemi ile klaritromisin direnci ise TaqMan real time PCR yöntemi ile araştırıldı. İstatistiksel analiz için Pearson Chi-squared ve Fisher's exact test testleri kullanıldı. Kocaeli bölgesinde belirlenen H. pylori suşlarında CagA geni %70.5, VacA s1a/m2 alleli %71.8, VacA s2/m2 alleli %16.7 oranında bulundu. CagA, VacA s1/m2 genotipi dominant olmasına rağmen klinik bulgularla istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki belirlenemedi. IceA1 ve IceA2 allelleri hemen hemen eşit oranda (sırasıyla %24.4- %26.9) belirlenirken babA2 alleli %6.4 oranında belirlendi. IceA2 alleli ile klinik bulgular arasında negatif bir ilişki belirlendi(p=0.011) IceA1, BabA2 allelleri istatistiksel olarak klinikle ilişkili bulunamadı. Klaritromisin direnci %34.6 oranında bulundu. CagA pozitif suşlarda klaritromisin duyarlılığı daha sık belirlendi (p= 0.042). Sonuç olarak klaritromisin direnci ile bakteriyel genotipik patern arasında herhangi bir ilişki belirlenemedi.

Özet (Çeviri)

Helicobacter pylori is an important human pathogen associated with gastrointestinal diseases such as gastritis, gastric and duodenal ulcer, gastric cancer and MALT lemphoma. Distinct virulence factors of Helicobacter pylori have been associated with clinical outcome of the infection; however, considerable variations have been reported from different geographic areas. On the other hand, the relationship between H. pylori clarithromycin resistance and genetic pattern distribution has been differently explained from different geographic areas. In this study we aimed to determine the prevalence of cagA, vacA, iceA and babA genotypes of H. pylori in Kocaeli patients with dispeptic diseases. In addition, we evaluated the prevalence of clarythromycin resistance and determination of association between these four virulence markers and antibiotic resistance in the city of Kocaeli. Seventy eight H.pylori- positive patients (40 with gastritis, 20 with gastric ulcer, 9 with duodenitis, 9 with normally endoscopic finding) were determined with polymerase chain reaction (PCR) using primers spesifically designed 16S rRNA gene primers. The presence of CagA, VacA alleles, IceA, BabA2 genotypes were determined using classical PCR and Clarithromycin resistance was assessed specimens by TaqMan real time polymerase chain reaction (PCR). Pearson Chi-squared test and Fisher's exact test were used for statistical comparisons. CagA, VacA s1a/m2, s2/m2 genes were found in 70.5%, 71.8%, 16.7%, of isolates, respectively. The CagA, VacA s1/m2 genotype was dominant. However there was no significant association with clinical outcomes in Kocaeli patients. IceA1 and IceA2 genotypes were almost equally presente ( 24.4%- 26.9% respectively), while 6.4% were found to possess the babA2 allele. The Ice A2 allele was negatively correlated with CagA positive strains (p=0.011). There was no clinical entity associated with IceA, BabA2 alleles. Clarythromycin resistance was found 34.6 % in the City of Kocaeli. The CagA positive strains were significantly associated with Clarythromycin sensitivity (p= 0.042). Finally, we did not find any relationship between clarithromycin resistance and bacterial genotype.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    630835

    Helicobacter pylori enfeksiyonunda bakteriyel dış membran proteinlerinin incelenmesi

    Investigation of bacterial outer membrane proteins in Helicobacter pylorı infection

    DARYOUSH DAVOUDI OSKOUEI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZLEM YILMAZ

  2. Tez No

    445372

    Üst gastrointestinal sistem (GİS) karsinomalı ve kronik gastritli hasta gastrik biyopsi örneklerinden hazırlanmış parafin blok örneklerinde h.pylori prevalansı ile h. pylori cagPAI ve vacA genotiplerinin histopatolojik tanı ile korelasyonunun belirlenmesi

    Determination of h. pylori prevalence and correlation between histopathologic diagnosis and h. pylori cagpai and vaca genotypes in paraffin embedded biopsy samples prepared from patients with upper gastrointestinal (gi) carcinoma and chronic gastritis

    ALI BAHADORI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FATİH KÖKSAL

  3. Tez No

    450910

    Multiplex-PCR based screening and computational modeling of virulence factors and T cell mediated immunity in Helicobacter pylori infections for accurate clinical diagnosis

    Helicobacter pylori enfeksiyonlarının doğru klinik tanısı için virülans faktörleri ile T hücreye bağımlı bağışıklığın çoklu-PZT ile taranması ve biyoinformatik modellemesi

    SİNEM ÖKTEM OKULLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. DR. AYÇA SAYI YAZGAN

    PROF. DR. ZÜHTÜ TANIL KOCAGÖZ

  4. Tez No

    289311

    Helicobacter pylori suşlarinda genotipik farklılıkların ve ilaç direncinin saptanması

    Detection of genotypic diversities and drug resistanse in helicobacter pylori strains

    SALİHA BAKIR ÖZBEY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    MikrobiyolojiUludağ Üniversitesi

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAFİYE HELVACI

  5. Tez No

    157940

    Helicobacter pylori Antijen ve DNA'sının dışkıda, IgG antikorunun serumda saptanması, İnzaviv ve İnzaviv olmayan tanı yöntemlerinin karşılaştırılması

    Detection of Helicıbacter pylori antigen and DNA in stool specimens, IgG antibodies in sera; comparison of invasive and noinvasiye and noinvasive diagnostic methods

    NAZİME ŞEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. ÖZLEM YILMAZ

Geri Dön