Clarification of apoptosis pathway in Saccharomyces cerevisiae depending on ketoconazole induced conditions
Saccharomyces cerevisiae da ketokonazol indüklü koşullara bağımlı apoptozis yolağının aydınlatılması
- Tez No: 491058
- Danışmanlar: PROF. DR. LEMAN TARHAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Biyokimya, Biyoloji, Chemistry, Biochemistry, Biology
- Anahtar Kelimeler: Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tez çalışması kapsamında, antifungal ve umut verici bir antikanser ilaç olan ketokonazolün Saccharomyces cerevisiae BY4742'deki sitotoksik ve indüklenen hücre ölümü tipleri üzerindeki etkisini belirlemek amaçlanmıştır. Ketokonazol tarafından indüklenen hücre ölüm türüne zaman ve konsantrasyona bağımlı S. cerevisiae'de hücre canlılığı, fosfatidilserin eksternelizasyonu, kromatin yoğunlaşması, DNA fragmentasyonu, mitokondriyal membran potansiyelleri incelenerek karar verilmiştir. İndüklenen apoptotik yolizleri, bilinen en etkin apoptotik genlerin silindiği mutant S. cerevisiae BY4742 hücreleri ile belirlenmiştir. Ayrıca, hücre içi reaktif oksijen türlerinde meydana gelen değişiklikler, radikal üreten enzimlerin aktiviteleri ve enzimatik ve enzimatik olmayan antioksidan sistemlerin yanı sıra lipid peroksidasyonu ve protein karbonil düzeyleri, zamana ve konsantrasyona bağımlı araştırılmıştır. Nispeten yüksek konsantrasyon ve uzun inkübasyon süresinde baskın hücre ölüm türü nekroz olarak belirlenmiştir. Ayrıca düşük konsantrasyonlarda hücre ölümü gözlenmemiştir. Bununla birlikte apoptotik koşulların optimizasyonu ile çok büyük oranda apoptotik hücre ölümü gözlenmiştir. Ketokonazol indüklü apoptoziste incelenen tüm proteinlerin etkisinin olduğu belirlenmiş olup en az etki maya kaspazdan kaynaklanmaktadır. Ketokonazol uygulamasına S. cerevisiae'nin antioksidan savunma sistemi güçlü bir şekilde cevap vermesine rağmen, hidrojen peroksit, hidroksil radikali ve total ROS düzeyleri tüm uygulamalarda kontrolün üstündedir. Bununla birlikte süperoksit anyon radikal ve nitrik oksit düzeyleri inkübasyon periyodunun sonlarında kontrolün altına düşmüştür. Ayrıca ketokonazol ile indüklenen ROS oluşumu ve antioksidan savunma sistemi arasındaki dengesizlikten kaynaklanan oksidatif stres nedeniyle, lipit peroksidasyonu ve protein karbonil seviyeleri, ketokonazol konsantrasyonuna ve inkübasyon süresine bağımlı artmıştır.
Özet (Çeviri)
In the scope of this thesis, it was aimed to clarify the effect of ketoconazole which is an antifungal and promising anticancer drug, on the viability and induced cell death types in Saccharomyces cerevisiae BY4742. Cell viability, phosphatidylserine externalisation, chromatin condensation, DNA fragmentation, mitochondrial membrane potentials were examined in S. cerevisiae to decide the cell death types triggered by ketoconazole in time- and concentration- dependent manner. The apoptotic pathways were investigated through the mutant S. cerevisiae BY4742 cells in which the known most efficient apoptotic genes deleted. Furthermore, alterations in intracellular reactive oxygen species, activities of radical producing enzymes and the response of enzymatic and non-enzymatic antioxidant systems and lipid peroxidation and protein carbonyl levels were investigated in a time and concentration dependent manner. The predominant cell death was found as necrosis at relatively higher ketoconazole concentrations and longer treatment time. In addition, there wasn't any cell death with the treatment of lower concentrations of ketoconazole. On the other hand, after optimising apoptotic conditions, apoptotic cell death occurred in a large amount of cell population. It was found that ketoconazole induced more than one apoptotic pathway in S. cerevisiae and all the investigated proteins participated in this process and the lowest efficient protein was determined as yeast caspase. After the treatment of ketoconazole, although the antioxidant system of S. cerevisiae BY4742 was induced strongly, hydrogen peroxide, hydroxyl radical and total ROS levels were over the control values in all treatments. However, the levels of superoxide anion radical and nitric oxide decreased to below the control level at the end of the investigated incubation period. Additionally, due to the oxidative stress resulting from the imbalance between the ketoconazole-induced ROS formation and the antioxidant defence system, membrane lipid peroxidation and protein carbonyl levels increased depending on ketoconazole concentration and incubation time.
Benzer Tezler
- Studying the role of an anti-apoptotic Bag-1 protein in healthy & tumor tissues in patients with breast carcinoma
Meme kanserli hastalardan alınan sağlıklı ve tümörlü dokularda anti-apoptotik Bag-1 proteinin rolünün çalışılması
EMİNE ARZU BAŞKALE
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Moleküler Tıpİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- mTOR sinyal yolağının rapamycin ile baskılanması durumunda CDK inhibitörlerinin terapotik etkilerinin LNCaP, DU145 ve PC3 prostat kanseri hücrelerinde incelenmesi
Başlık çevirisi yok
ÖZGE BERRAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Biyolojiİstanbul Kültür ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ELİF DAMLA ARISAN
- Investigation of the localization pattern and the role of anti apoptotic BAG-1 in healthy and tumor tissues from patients with breast carcinoma
Meme kanserli hastalardan alınan sağlıklı ve tümörlü dokularda anti-apoptotik BAG-1 proteininin rolü ve lokalizasyonunun incelenmesi
JALE YILDIZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Identification of the interaction partners of anti-apoptotic BAG-1M isoform in breast cancer and breast epithelial cells
Anti-apoptotik BAG-1M izoformunun etkileşim partnerlerinin meme kanseri ve meme epitel hücrelerinde tanımlanması
NİSAN DENİZCE CAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Onkolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Sağlıklı ve osteoartrit'li kondrositlerde mitohormetik adaptasyonun inflamatuar strese karşı oluşan yanıt üzerine etkisi; in-vitro çalışma
The effect of mitohormetic adaptation on the response to inflammatory stress in healthy and osteoarthritic chondrocytes; in-vitro study
EKİN KAYA ŞİMŞEK
Doktora
Türkçe
2025
Tıbbi BiyolojiBaşkent ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASİBE VERDİ