Sortilin1 (Sort1) gen ekspresyonuyla ilişkili kodlamayan (Non-coding) rs599839 polimorfizminin lipoprotein altsınıfları ile ilişkisinin koroner kalp hastalarında araştırılması
Investigation of relationship between a non-coding rs599839 variant associated with sortilin (Sort1) gene region and lipoprotein subfractions in patients with coronary artery disease
- Tez No: 490508
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HÜSEYİN AVNİ UYDU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada Sort1 gen ekspresyonunun lipoprotein altsınıfları ve KAH ile ilişkisini incelendi. Ayrıca Sort1 ile aynı lokusta yer alan ve genin ekspresyonunu etkileyen rs599839 polimorfizmi çalışıldı. Çalışma grupları; anjiyografi sonucu çeşitli düzeylerde damar tıkanıklığı tespit edilen 162 hasta ve 49 sağlıklı bireylerden oluşturulmuştur. Çalışma gruplarında lipit profilleri (TAG, TK, LDL, HDL), serum apolipoprotein (ApoA, ApoB ve ApoE) seviyeleri ve CRP değeri otoanalizörde çalışıldı. Lipoproten altsınıfları Qantimetrix lipoprint sistem kullanılarak analiz edildi. Sort1 gen ekspresyonu düzeyi ise Human Sortilin TaqMan Gene Expression Assays kullanılarak qRT-PCR metoduyla ile belirlendi. Genomik DNA tam kandan izole edildi ve rs599839 polimorfiziminin belirlenmesi için genotipleme Polimeraz Zincir Reaksiyonu-Restiriksiyon Fragment Uzunluk Polimorfizmi (PCR-RFLP) metadu ile çalışıldı. Kontrol grubuna göre KAH grubunda Sort1 gen ekspresyonu anlamlı derecede artmıştır (p<0,001). Ancak rs599839 tek nükleotiddeki polimorfizim (SNP) varyant allel grupları arasında gen ekspresyonunda fark bulunmamıştır (p>0,05). Çalışma grubunda lipoprotein altsınıfları karşılaştırıldığında; kontrol grubuna göre KAH'da aterojenik altfraksiyonlar (SdLDL-K ve SHDL) istatistiksel olarak daha yüksek bulunmuştur (p<0,01). KAH olan hastalar kontrol grubu ile kıyaslandığında, plazma aterojenik indeks (AIP) ve TG / HDL-K, Apo B / Apo AI, SdLDL / LbLDL ve düşük LDL-K / Apo B oranları bakımından anlamlı derecede yüksek değerlere sahipti (p<0,05). Sonuç olarak; Sort1 gen ekspresyonunun özellikle hem aterojenik LDL fenotipi ile hem de KAH ile lineer bir ilişki gösterdiği tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, the relationships between Sort1 gene expression and lipoprotein subclasses and CAD were investigated. In addition, the rs599839 polymorphism which is located in the same locus withSort1 gene and its effects on Sort1 gene expression was identified. The study population included 162 patients with various levels of vascular occlusion detected by the angiography result and 49 healthy subjects.Lipid profiles (TAG, TK, LDL, HDL), serum apolipoprotein (ApoA, ApoB and ApoE) levels and CRP level were measured by autoanalyzer in routine biochemistry laboratory. Lipoprotein subclasses were analyzed by the Quantimetrix lipoprinting system. The Sort1 gene expression level was determined by qRT-PCR using Human Sortilin TaqMan Gene Expression Assays. Genomic DNA was extracted from whole blood and the genotyping was performed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) to detect rs599839 polymorphism. Expression of the Sort1 gene was found significantly increased (p <0,001) in the CAD group compared to the control group. However, no significant differences (p> 0,05) were identified in Sort1 gene expression between variant allele groups of rs599839. When the lipoprotein subclasses were evaluated in the study groups; atherogenic subfractions (SdLDL-K and SHDL) were found to be statistically higher in CAD than control group (p <0,01). Patients with CAD had significantly higher levels of plasma atherogenic index (AIP), TG / HDL-C, Apo B / Apo AI, SdLDL / LbLDL and low LDL-C / Apo B levels compared to the controls (p <0,05). In conclusion, it has been found that Sort1 gene expression particularly has a linear relationship with both the atherogenic LDL phenotype and CAD.
Benzer Tezler
- Göz tutulumu olan ve olmayan behçet hastalarında serum sortilin düzeylerinin lipid metabolizması ile ilişkisi
The relationship between serum sortilin levels and lipidmetabolism in behcet's patients with and without ocular involvement
ŞEYDANUR TURGUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Romatolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP GÜLNUR ANDİCAN
- İki farklı tarım uçağının sorti zaman analizi ile iş verimliliğinin hesaplanması
The Calculation of work efficiency by time analysis using two different agricultural aircrafts
OSMAN DOĞANYİĞİT
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
ZiraatAnkara ÜniversitesiTarım Makineleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İBRAHİM ÇİLİNGİR
- Investigation of fatigue behaviour of external stores under fixed wing aircraft platforms during random vibration
Rastgele titreşim altında sabit kanatlı hava platformlarına bağlı harici yüklerin yorulma davranışlarının incelenmesi
EMRE OKUR
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Makine MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERKAN DAĞ
- Psoriasis hastalarında serum sortilin düzeyinin hastalık şiddeti ve subklinik ateroskleroz ile ilişkisi
Evaluation of the level of serum sortilin and its relationship between disease severity and subclinic atherosclerosis in psoriasis patients
GAMZE TAŞ AYGAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
DermatolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiDeri ve Zührevi Hastalıklar Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BENGÜ ÇEVİRGEN CEMİL
- Alopesi areata hastalarındaserum sortilin düzeyinin hastalık şiddeti ve subklinik ateroskleroz ile ilişkisi
Evaluation of the level of serum sortilin and its relationshipbetween disease severity and subclinic atherosclerosis in alopeciaareata patients
LEYLA MAGSUDOVA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
DermatolojiSağlık BakanlığıDeri ve Zührevi Hastalıklar Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİLİZ CANPOLAT