Geri Dön

Gökkuşağı alabalıklarında görülen motil aeromonas (aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), yersinia ruckeri ve lactococcus garvieae bakterilerinin antimikrobiyal duyarlılıkları ve duyarlılıkta rol oynayan genlerin tespiti

Determination of antimicrobial senstivity and antimicrobial resistance genes of motile aeromonads (aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), yersinia ruckeri and lactococcus garvieae in rainbow trout

PDF İndir

  1. Tez No: 487123
  2. Yazar: MUHAMMED DUMAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SONER ALTUN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Su Ürünleri, Veteriner Hekimliği, Aquatic Products, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Aeromonas, Aeromonas hydrophila, Alabalıklar, Antienfektif ajanlar, Gökkuşağı alabalığı, Lactococcus garvieae, Sepsis, Yersinia, Yersinia ruckeri, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Aeromonas, Aeromonas hydrophila, Trouts, Anti infective agents, Rainbow trout, Lactococcus garvieae, Sepsis, Yersinia, Yersinia ruckeri, Drug resistance-microbial
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Uludağ Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Hastalıklar Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu araştırmada, farklı kökenlere sahip Motil Aeromonas spp. (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri ve Lactococcus garvieae izolatlarının moleküler karakterizasyonu, antimikrobiyal duyarlılıkları ve antimikrobiyal direnç gelişiminde rol oynayan genlerin tespiti yapılmıştır. Çalışmada hareketli Aeromonas, Y. ruckeri ve L. garvieae izolatlarının biyokimyasal özelliklerinin belirlenmesinde klasik mikrobiyolojik testler (gram boyama, hareketlilik, oksidaz, katalaz, O/F vb.) ve hızlı teşhis kitleri (API 20NE, API 32 STREPT ve API 32E) kullanılmıştır. Hareketli Aeromonas türlerinin identifikasyonu gyrB bölgesinin dizi analizi ile Y. ruckeri ve L. garvieae izolatlarının identifikasyonu ise sırasıyla YER8-YER10, pLG primerleri kullanılarak PCR analizi ile gerçekleştirilmiştir. Y. ruckeri ve L. garvieae izolatlarının genotiplendirilmesi RAPD-PCR, hareketli Aeromonas izolatlarının genetik yakınlıkları ise gyrB bölgesinin dizi analizi ile (Bionumerics 7.0 yazılımı kullanılarak) yapılmıştır. Ayrıca çalışmada kullanılan tüm izolatların sulfanomid, tetrasiklin, florfenikol ile sulfamethoksazol-trimetoprim antimikrobiyallerinde minimum inhibitör konsantrasyonları (MİK) ve bu antimikrobiyallere karşı geliştirdikleri direnç genleri (PCR ve dizi analiziyle) tespit edilmiştir. Araştırmada 6 adedi ülkemizde ilk bildirim olmak üzere toplam 13 motil Aeromonas türü, 18 farklı Y. ruckeri ve 5 farklı L. garvieae genotipi belirlenmiştir. Hareketli Aeromonas türlerinin yaygın olarak sulfanomid ve florfenikole; Y. ruckeri izolatlarının sulfanomid ve tetrasiklin'e; L. garvieae izolatlarının ise sulfonamid ve florfenikol'e direnç geliştirmiş olduğu görülmüştür. Ayrıca Aeromonas türlerinde sulI, tetA, tetE, flor; Y. ruckeri izolatlarında sulI; L. garvieae izolatlarında ise ermA ve tetS genlerinin yaygın olduğu tespit edilmiştir.

Özet (Çeviri)

“Determination of Antimicrobial senstivity and antimicrobial resistance genes of Motile Aeromonads (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae in rainbow trout”Determination of molecular characteristics, antimicrobial susceptibility and resistance genes in motile Aeromonas spp. (Aeromonas hydrophila, A. sobria, A. caviae), Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae isolates that isolated from different origin were performed in this study. The classical biochemical tests (gram stain, motility, oxidase, catalase, O/F etc.) and rapid test kits (API 20NE, API 32 STREPT ve API 32E) were used for determination of biochemical characteristics of motile Aeromonas spp., Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae isolates in our study. Identification of motile Aeromonas isolates were performed with sequence analayses of gyrB gene region, Y. ruckeri and L. garvieae isolates were identified with YER8-YER10, pLG primer pairs, respectively. Yersinia ruckeri and Lactococcus garvieae isolates were genotyped using RAPD-PCR method, and also motile Aeromonas isolates were genogrouped based on sequence of gyrB gene region (using Bionumerics 7.0 software). Beside, all isolates were investigated for susceptibility of sulfonamide, tetracycline, florfenicole and sulfamethoxazole-trimetoprime using minimum inhibitor concentration (MIC) test and antimicrobial resistance genes related to these compounds were detected using PCR and sequence analyses. There are 13 different motile Aeromonas species that were six of them firstly reported in our country, 18 Y. ruckeri and 5 different L. garvieae genotype were identified in this study. Motile Aeromonas species are commonly found in sulfanomide and florfenicole; Y. ruckeri isolates to sulfanomide and tetracycline; L. garvieae isolates were found resistance to sulphonamide and florfenicole. In addition, sulI, tetA, tetE, floR in Aeromonas species; sulI in Y. ruckeri isolates; ermA and tetS genes in L. garvieae isolates, were commonly detected resistance genes.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    195021

    Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss) sık görülen patojen mikroorganizmaların tespiti ve antibiyotik duyarlılık düzeylerinin belirlenmesi

    Detection of frequently seen pathogen microorganizms and determination of antibiotic susceptibility in rainbow trouts (oncorhynchus mykiss)

    DİLEK AKŞİT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Veteriner HekimliğiAdnan Menderes Üniversitesi

    Farmakoloji ve Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. CAVİT KUM

  2. Tez No

    390199

    Gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792) bakır sülfat pentahidrat ile oluşturulan akut ve kronik bakır toksikasyonunda patolojik incelemeler

    Pathological findings in acute and chronic copper toxicity in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum 1792) occurred by copper sulfate pentahydrate

    SEMA ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    PatolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Veterinerlik Patolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAMDİ AVCI

  3. Tez No

    592465

    Baraj gölü kültür gökkuşağı alabalıklarında (O. mykiss, W.) patojen bakterilere probiyotiklerin antagonistik etkisi

    Antagonistic effect of probiotic on pathogenic bacteria in rainbow trout (O. mykiss, W) of dam lake

    DİLEK ÖKMEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Su Ürünleri Yetiştiriciliği ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. TÜLAY AKAYLI

  4. Tez No

    236293

    Vibrio anguillarum ile enfekte edilen gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792 ) morfolojik ve immunohistokimyasal incelemeler

    Morphologic and immunohistochemical investigations in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792) experimentally infected with vibrio anguillarum

    HAMDİ AVCI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Veteriner HekimliğiAdnan Menderes Üniversitesi

    Veterinerlik Patolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. S. SERAP BİRİNCİOĞLU

  5. Tez No

    305207

    Muğla ilindeki gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss, W. 1792) ve levrek (Dicentrarchus labrax, L. 1758) işletmelerinin yapısal analizi ve görülen hastalıklar açısından değerlendirilmesi.

    Structural analysis and evaluation of diseases in some rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, W. 1792) and sea bass (Dicentrarchus labrax, L. 1758) farms in the Muğla province.

    MUSTAFA ŞEKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Su ÜrünleriMuğla Üniversitesi

    Su Ürünleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÜLŞEN ULUKÖY

Geri Dön