Geri Dön

Beta talasemi majör hastalarında modifiye edici sall2 geni bağlanma motifinde mutasyon taranması

Mutation screening in binding motif of modifier sall2 gene in the beta thalassemia major patients

PDF İndir

  1. Tez No: 484715
  2. Yazar: TUĞBA KARAMAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İBRAHİM KESER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Hematoloji, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Hematology, Genetics, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Talasemi majör, HbF, Modifiye edici gen, SALL2, Fetal hemoglobin, Genler, Mutasyon, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Talasemi, Thalassemia major, HbF, Modifier gene, SALL2, Fetal hemoglobin, Genes, Mutation, Polymerase chain reaction, Thalassemia
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Tezimizin amacı; beta talasemi majör (β-TM) hastalarında kromatin remodelingini ve HbF düzeyini etkileyen modifiye edici SALL2 geni bağlanma motiflerindeki mutasyonları taramaktır. Yöntem: Projemiz, Antalya Eğitim ve Araştırma Hastanesi Adem Tolunay Talasemi ve Kan Hastalıkları Merkezi'ne başvuran, β-TM tanısı konulan, beta-globin gen mutasyonları tanımlanmış 100 hastada planlandı. HbF'i normal 10, HbF'i yüksek olan 66, toplam 76 hastada gerçekleştirildi. Periferik kandan genomik DNA izolasyonunu takiben, SALL2 geni bağlanma motifine özgün primer çiftleri kullanılarak, PZR yöntemiyle ilgili gen bölgeleri çoğaltıldı. Sanger dizileme yöntemi ile mutasyonlar tarandı. Elde edilen sonuçlar NCBI (National Center for Biotechnology Information) veritabanına göre analiz edildi. Bulgular: Çalışılan β-TM 76 hastanın 32'si erkek, 44'ü kadındı. HbF'i yüksek olan hastaların ortalama HbF düzeyleri 10.1 gr/dl idi. Üç PZR amplikonu olarak çalışılan ve HbF'i modifiye eden SALL2 geninde, D1 ve D3 domainlerde (motiflerinde) mutasyon bulunmazken, ikinci domainde (D2) rs61746515 (C>T) g.18721G>A (Gly744=) değişimi; 63(%95.46) hastada GG, 3(%4.54) hastada GA (g.18725C>G p.Gly 746Arg), tespit edildi. rs1263810 (g.18725C>G, p.Gly 746Arg) varyasyonlu toplam 66 hastada; CC, CG, GG genotipleri sırasıyla %9,09, %51,51 ve %39,39 sıklıkta bulundu. Sonuç: Çalışmamızda, Türk toplumunda ve dünyada HbF'i yüksek olan β-TM hastalarında ilk defa ve DNA dizileme ile tespit edilen SALL2 geni bağlanma motifinde rs1263810 (C>G) (Gly746Arg) varyasyonu gösterildi. Amino asit değişimine neden olan bu varyasyonun HbF'in düzenlenmesinde ve SALL2'in kromatin remodelinginde önemli olabileceğini, HbF indüksiyonunda diğer transkripsiyon faktörleri KLF1, BCL11A ile birlikte incelenmesi gerektiğini ortaya koymaktadır.

Özet (Çeviri)

Objective: The aim of our thesis is to detect mutations in the domains and the SALL2 genetic binding motifs of modifying effect on chromatin remodeling and affecting HbF levels in beta thalassemia major patients(β-TM). Method: Our project was planned with 100 patients from Antalya Education and Research Hospital Adem Tolunay Thalassemia and Blood Disease Center, diagnosed with β-TM, defined as beta-globin gene mutations. Our project was carried out in a total of 76 patients; 10 and 66 of them have normal and high HbF, respectively. Following isolation of peripheral blood genomic DNA, gene regions related to the PCR method were amplified using primer pairs specific to the SALL2 gene binding motifs. Mutations were screened by Sanger Sequencing. The results were analyzed according to the NCBI database. Results: Of 76 patients with β-TM, 32 and 44 were males and females, respectively. The mean HbF levels of the patients as found to be 10.1 gr/dl. While in the second domain(2D) (D2), rs61746515 (C>T) g.18721G>A (Gly744=) was found as GG in 63(95.46%) patients and GA 3(4.54%) patients and rs1263810 (C>G) (g.18725C>G p.Gly746Arg) variations was found that this variation, g.18725C>G, as CC, CG and GG genotypes were found in 6(9,09%), 34(51,51%) and 26(39,39%) in the 66 patients. Mutations were not found in the first(D1) and third(D3) domains in the SALL2 gene, which worked as three PCR amplicons and modified HbF. Conclusion: We concluded that rs1263810 (C>G) variant (Gly746Arg) in the SALL2 gene binding motif detected by DNA sequencing for the first time in β-TM patients with high HbF in Turkish population may be important in the regulation of HbF and chromatin remodeling of SALL2. In the studies of HbF induction, SALL2 should be examined together with other transcription factors such as KLF1 and BCL11A.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    663407

    Beta-talasemi majör hastalarında TAL1 geni ekspresyon düzeyinin belirlenmesi ve HbF ile ilişkisinin araştırılması

    Determination of TAL1 expression and its relationship with HbF level in beta-thalassemia major patients

    TUĞBA NUR UYGUÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GenetikAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM KESER

  2. Tez No

    478030

    Kemik iliği transplantasyonu yapılan beta talasemi majör tanılı hastalarda alfa gen mutasyonlarının etkisi

    The effect of alpha gene mutations on bone marrow transplantation defined with beta thalassemia major

    GİZEM ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAVAŞ KANSOY

  3. Tez No

    455097

    Beta talasemi majorlü hastalarda hbf indüksiyonu için genetik ve epigenetik çalışmalar

    Genetic and epigenetic studies for hbf induction in patients with beta thalassemia major

    YUNUS ARIKAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Tıbbi BiyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM KESER

  4. Tez No

    365407

    Beta talasemi major hastalarında oral deferasirox ve diğer demir şelasyon tedavilerinin kardiak, hepatik ve endokrin organlardaki demir birikimi üzerine etkisinin T2* MRG ile değerlendirilmesi

    The evaluation of the oral deferasirox and other iron chelation treatments of cardiac, hepatic and endocrin organs with T2* MRI in beta thallasemia major patients

    MÜNEVVER BAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞULE ÜNAL

  5. Tez No

    394228

    Beta-talasemi major hastalarında hipofizer demir birikiminin mrg ile değerlendirilmesi-sonuçların biyokimyasal parametreler ve karaciğer demir birikimi ile korrelasyonu

    Mri evaluation of pituitary iron overload in beta-thalassemia patients-correlation of the results with biochemical parameters and liver iron overload

    MUSTAFA BOZDAĞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Radyoloji ve Nükleer TıpEge Üniversitesi

    Radyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET CEM ÇALLI

Geri Dön