MCF 7 meme kanseri hücrelerindeki mikro RNA üzerinde TGF-β etkisi
TGF-β effect on microRNA in MCF 7 breast cancer cells
- Tez No: 478965
- Danışmanlar: PROF. DR. ALİ ÜNLÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Hücre dizisi, Meme neoplazmları, Mikro RNA, Neoplazmlar, RNA, Transforme edici büyüme faktörü-beta, Cell line, Breast neoplasms, Micro RNA, Neoplasms, RNA, Transforming growth factor-beta
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
TGF-β hücrenin proliferasyonu, diferansiasyonu, motilitesi, adhezyonu ve ölümü gibi birçok hücresel süreçleri düzenleme yeteneğine sahiptir. Bu fizyolojilerde oluşabilecek bozukluklar sonucunda aralarında kanser, osteoartrit, diabet gibi birçok hastalıkla da ilintili olduğu bilinmektedir. Bu çalışma, TGF-β'nın MCF7 insan meme kanseri hücresi miRNA'ları profilleri üzerine uygulamasının etkilerini incelemektedir. Çalışmamızda, MCF-7 hücreleri TGF-β'nın farklı saatlerde (2, 4, 6, 24 ve 48) ile tek dozda (16 ng/ml) muamele edildi. Daha sonra total RNA, Roche yüksek saf miRNA İzolasyon Kiti (Roche Diagnostics) kullanarak izole edildi ve hücre lizatlarından cDNA sentezlendi. Gerçek zamanlı qPCR için 84 adet miRNA ekspresyonu, BioMarkTM 96,96 Dynamic Array (Fluidigm Corporation) ile saptanmıştır. İstatistiksel analiz Biogazelle en qase Plus 2,0 yazılımı kullanılarak yapıldı. Göreceli gen ekspresyonu değerlerinin tayini 2-ΔΔCt yöntemi (numunenin normalize edilmiş Ct (eşik döngüsü ) değeri- kontrolün normalize edilmiş Ct değeri) kullanılarak gerçekleştirilmiştir. İstatistiksel analizler sonucunda, kontrol grubuna kıyasla 84 miRNA'nın 23 tanesi farklı şekilde (fold regulation <2, fold regulation>2, p<0.05) eksprese edilmiştir. Bu bulgular, MCF-7 hücrelerinin miRNA profillerine TGF-β'nın etkilerini vurgulamaktadır ve daha ileri çalışmalara yardımcı olabilir.
Özet (Çeviri)
TGF-β has the ability to reverse many cell processes such as cell proliferation, differentiation, motility, adhesion, and death. As a result of the disorders that may occur in these physiologists, it is known that they are related to many diseases such as cancer, osteoarthritis and diabetes. This study examines the effects of TGF-β on the profiles of MCF7 human breast cancer cell miRNAs. In our study, MCF-7 cells at different times of TGF-β (2, 4, 6, 24 and 48) with a single dose (16 ng/ml) were treated. Then total RNA was isolated by using Roche High Pure miRNA Isolation Kit (Roche Diagnostics) and cDNA was synthesized from cell lysates. The expressions of 84 miRNAs were determined by The BioMarkTM 96.96 Dynamic Array (Fluidigm Corporation) for real-time qPCR. Statistical analysis was performed using the Biogazelle's qbase PLUS 2.0 software. Determinations of relative gene expression values were carried out by using the 2-∆∆Ct method (normalized threshold cycle (Ct) value of sample minus normalized Ct value of control). As a result of the statistically analysis, twenty-three of 84 miRNAs have been differentially expressed compared to control group (fold regulation <2, fold regulation>2, p<0.05). Thesefindings highlight the effects of TGF-β to miRNA profiling of MCF7 cells and may be helpful for further studies.
Benzer Tezler
- Meme kanseri kök hücrelerine karşı ekstraselüler vezikül temelli yeni tedavi yaklaşımlarının geliştirilmesi
Development of new extracellular vesicle-based treatment approaches to breast cancer stem cells
ETKİN PARLAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MELAHAT BAĞIROVA
- Influence of micropatterned polymeric substrates on cancer cell behavior
Mikrodesenli polimerik sübstratların kanser hücresi davranışı üzerine etkisi
MENEKŞE ERMİŞ ŞEN
Doktora
İngilizce
2016
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VASIF NEJAT HASIRCI
DOÇ. DR. UTKAN DEMİRCİ
- Çeşitli hücre hatlarında Silimarinin epigenetik etkisinin değerlendirilmesi
Evaluation of epigenetic effect of Silymarin in various cell lines
YEŞİM KORKMAZ KASAP
Doktora
Türkçe
2019
Tıbbi BiyolojiBaşkent ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERKAN YURTCU
- MikroRNA (mir-200C ve mir-141) için meme kanseri tedavisinde kitozan temelli taşıyıcı sistemlerin geliştirilmesi
The development of chitosan-based delivery systems for miRNAs (mir-200c and mir-141) on breast cancer treatment
KÜBRA KABAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
OnkolojiMarmara ÜniversitesiFarmasötik Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA JULİDE AKBUĞA
YRD. DOÇ. DR. EMİNE ŞALVA
- Ganoderma lucidum ekstraktlarının MCF-7 meme kanseri hücre hattında miRNA profiline ve telomeraz aktivitesine etkisi
Effects of ganoderma lucidum extracts on mirna profile and telomerase activity in MCF-7 breast cancer cell line
ÖYKÜ GÖNÜL
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HANDAN AK