Corrected PRA positivity rates for hypersensitized patients in Turkish population with calculated PRA-cPRA software
Türk popülasyonundaki hipersensitize hastaların hesaplamalı PRA cPRA yazılımı ile düzeltilmiş PRA oranları
- Tez No: 470076
- Danışmanlar: PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mühendislik Bilimleri, Tıbbi Biyoloji, Genetik, Engineering Sciences, Medical Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Biyoinformatik, Böbrek nakli, Hematopoetik kök hücre transplantasyonu, Popülasyon biyolojisi, Bioinformatics, Kidney transplantation, Hematopoietic stem cell transplantation, Population biology
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Kadir Has Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Hesaplamalı Biyoloji ve Biyoinformatik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Yüksek PRA (Panel Reaktif Antikor) oranları, böbrek nakli şansını düşürebilir ve nakilden önce uzun süre beklemeye yol açabilir. cPRA (Hesaplamalı Panel Reaktif Antikor), kabul edilemez (uyumsuz) HLA (Human Lökosit Antijen) antijenleri temel alınarak yapılır. Bu antijenler, serumda dolaşan HLA antijenlerine karşı gelişen antikorlara ve bu antikorların antijenlere bağlanma riskine dayanılarak oluşturulmuş bir bilgisayar programı ile tanımlanır. Böylece popülasyonun antijen profili ve antijen frekansları ölçülebilir ve bu yöntem kullanılarak daha gerçekçi cPRA pozitiflik oranları elde edilebilir. Türkiye'de EFI (European Federation Immunogenetics) tarafından akredite edilmiş iki doku tipleme laboratuvarında 494 kan bağışçısının HLA antijenlerine dayanan bir bilgisayar programı geliştirdik. Verici örneklerinin doku tiplemesi YND (Yeni Nesil Dizileme) tabanlı olarak yapıldı. İstanbul Tıp Fakültesi'nde kadavradan organ nakli yapılmasını bekleyen 380 hastaya PRA tarama testi uygulandı. 48 aşırı duyarlı hastaya antikor profillerini belirlemek için (TAT) Tek Antijen Tanımlama testi yapıldı. Duyarlılaşmış hastaların mevcut yöntemlerle PRA pozitifliği ortalama %44,6, ancak cPRA yazılımı kullanılarak pozitifliği ortalama %86,2 bulundu. cPRA yazılımı kabul edilemez tüm antijenlere göre reddedilen vericilerin oranını göstermektedir. PRA pozitiflik oranının yerine, kabul edilemez antijenlerin listesi olarak sunulan duyarlılığa bağlı hesaplamalı cPRA pozitiflik oranı ihtiyaç duyulan gerçek bir değişimdir. Esas olarak, cPRA'nın uygulanması Türkiye'de birçok merkezi ve laboratuvarı, duyarlılığın standart bir ölçümü olarak benimsemeye teşvik edecektir. cPRA yazılımını kullanmak, kabul edilemez uyuşmazlık programı oluşturarak, özellikle aşırı duyarlı hastalar için daha iyi bağış yapma şansını artıracaktır.
Özet (Çeviri)
High rates of PRA (Panel Reactive Antibody) may decrease the chance of kidney transplant and may result in long-waiting periods before transplantation. The cPRA (Calculated Panel Reactive Antibody) is performed based on unacceptable HLA (Human Leukocyte Antigen) antigens. These antigens are identified by a computer program, which was created based on the antibodies that developed against the HLA antigens circulating in serum, and on the risk of binding of these antibodies to antigens. The antigen profile of the population and antigen frequencies can be measured, and more realistic cPRA positivity rates may be obtained using this method. We developed a computer program based on the HLA antigens of 494 blood donors in two tissue typing laboratory laboratories in Turkey accredited by EFI (European Federation of Immunogenetics). NGS (Next Generation Sequencing) based tissue typing of the donor samples were performed. PRA screening test was performed to 380 patients who were waiting for organ transplant from a cadaver in Istanbul University, Istanbul Faculty of Medicine. The SAB (Single Antigen Bead Assay) testing was performed to identify the antibody profiles on 48 hypersensitized patients. The mean of PRA positivity of the sensitized patients using the current methods were found as 44.6%, however, the rate was found as 86.2% using the cPRA software. cPRA software shows the rate of the rejected donors according to all unacceptable antigens. The need for a list of unacceptable antigens, in place of the PRA positivity rate, is a real change in the sensitization dependent calculation as in cPRA positivity rate. In principal, implementation of cPRA will encourage many centers and laboratories to adopt a standard measurement of sensitization in Turkey. It will increase the chances of finding a better donor particularly for hypersensitized patients, by the creation of an unacceptable mismatch program using cPRA software.
Benzer Tezler
- Veri̇ madenci̇li̇ği̇ tekni̇kleri̇ i̇le organ nakli̇ i̇çi̇n uygun donör oranının hesaplanması
Calculation suitable donor rate for organ transplantation with data mining techniques
HÜSNÜ ERTEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyoistatistikGazi ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURSAL ARICI
- Neoadjuvan kemoterapi alan meme kanserli hastalarda androjen reseptör ekspresyonunun tedavi yanıtla ilişkisi ve prognostik önemi
The relationship between androgen receptor expression and treatment response, as well as the prognostic significance, in breast cancer patients receiving neoadjuvant chemotherapy
ABDULLAH ÜMİT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
OnkolojiAkdeniz Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ MURAT TATLI
- Meme kanseri gelişiminde EBV, CMV, HSV ve HPV 'nin rolü: Irak'ta moleküler ve immünolojik çalışma
EBV, CMV, HSV and HPV role in breast cancer development molecular and immunological study in Iraq
MAHA AHMED HMOUD HMOUD
Doktora
Türkçe
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
PROF. DR. ABDULGHANİ ALSAMARAI
- User modeling on microblogging web sites
Mikro-blog web sitelerinde kullanıcı modelleme
ZEYNEP ZENGİN ALP
Doktora
İngilizce
2019
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞULE ÖĞÜDÜCÜ
- Bir soğutucuyu güneş enerjisi ile besleyen sistemin tasarımı
A Freezer operation by using solar energy
AZMİ DEMİREL
Yüksek Lisans
Türkçe
1991
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. R. NEJAT TUNÇAY