Geri Dön

Kronik lenfositik lösemide 13q14.3 delesyonunun sitogenetik analiz ve FISH yöntemi ile; mirna-15A ve mirna-16-1'in real time pcr ile incelenmesi

Investigation of 13q14.3 deletion by cytogenetic analysis and fish technique and mirna-15A and mirna-16-1 BY real time PCR in cll

PDF İndir

  1. Tez No: 466654
  2. Yazar: MELİKE YILMAZ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SENİHA HACİHANİFİOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Genetik, Biyoloji, Medical Biology, Genetics, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: FISH, Kromozom delesyonu, Lösemi, Lösemi-lenfositik-kronik-B hücreli, Mikro RNA, Mikroskopik analiz, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, RNA, FISH, Chromosome deletion, Leukemia, Leukemia-lymphocytic-chronic-B-Cell, Micro RNA, Microscopic analysis, Polymerase chain reaction, RNA
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Kronik Lenfositik Lösemi (KLL) klinik olarak heterojen bir hastalıktır ve rutin tanıda gözlenen sitogenetik anomaliler klinik öneme sahiptir. KLL'de en sık gözlenen sitogenetik anomali 13q14.3 delesyonudur. Bu delesyon monoallelik, biallelik ve mozaik formlarda gözlenmektedir. KLL hücrelerinin mitotik indekslerinin çok düşük olması, tanı çalışmalarında DSP30 gibi indükleyici ajanların ve FISH gibi moleküler tekniklerin kullanımını gerekli kılmıştır. 13q14.3 kromozom bölgesinden kodlanan hsa-miR-15a ve hsa-miR-16-1 miRNA'ları tümör baskılayıcı miRNA'lardır. Çalışmamızda DSP30+IL-2 ile indüklenmiş ve indüklenmemiş KLL tanılı 30 olgunun perifer kanı materyalleri kullanılmıştır. İndüklenen materyallere, 13q14.3 delesyonunun tespiti için konvansiyonel sitogenetik ve interfaz FISH (iFISH) tekniği uygulanarak sonuçların kıyaslanması ve bunun yanısıra qRT-PZR yöntemiyle tespit edilen, hsa-miR-15a/miR-16-1 ifade seviyelerinin iFISH ile saptanmış olan delesyonlarla ilişkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Elde edilen sonuçlar ışığında miRNA ifade seviyeleri ile KLL patogenezi arasında ilişki olup olmadığının belirlenmesi hedeflenmektedir. 13q14.3 delesyonu konvansiyonel sitogenetik yöntemlerle olguların %8,6'sında, iFISH ile %65,3'ünde saptanmıştır. Olguların %50'sinde mozaik form gözlenmiştir. Olgularımızda; KLL'de gözlenen add(2)(q37), t(2;7)(p11.2;q22) del(6)(q13q21), del(6)(q25), add(9)(q21), del(11)(q23), t(11;14)(q13;q32), del(13)(q11q12), del(13q)(q12q14), add(14)(q23), del(14)(q23), t(14;19)(q32;q13.1), del(15)(q23), del(17)(p12), t(18;22)(q21;q11.2), add(21)(p13), t(17;21)(q11.2;q22), anomalilerinin yanısıra, daha önce bildirildiğini saptayamadığımız t(1;13)(q32;q34), inv(2)(p25q21), del(13)(q22q32), t(14;19)(q24;q13), dup(17)(q21q23), rob(21;21)(p13;p13) gibi yapısal kromozom anomalileri de tespit edilmiştir. Mitotik indeks verileri istatistiksel olarak anlamlı bulunmuş ve DSP30+IL-2'nin mitotik indeksi 2,5 kat arttırdığı saptanmıştır. Hsa-miR-16-1 ifadesindeki azalışlar ile delesyonlar arasındaki ilişki istatistiksel olarak anlamlı bulunmuştur. Çalışmamız; FISH ve sitogenetik analizlerin birbirini tamamladığını, KLL hücrelerindeki mitotik indeksin artmasında ve kromozom anomalilerin saptanmasında DSP30+IL-2 kullanımının verimli olduğunu ve 13q14.3 kromozom bölgesinin kaybı veya olası diğer düzenleyici mekanizmalarla azalan hsa-miR-16-1'in KLL patogenezinde etkili olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) is a clinically heterogeneous disease and cytogenetics abnormalities detected in routine diagnosis are clinically valuable. The most frequent cytogenetic aberration is 13q14.3 deletion and is observed as monoallelic and biallelic types in CLL. Immunostimulatory agents as DSP30 and moleculer techniques as FISH are used in diagnosis due to very low mitotic index of CLL cells. Hsa-miR15a and hsa-miR-16-1 are tumor supressor miRNAs coded from 13q14.3 region. In this study we used peripheral blood materials of 30 CLL patients who were induced and noninduced with DSP30+IL-2. In induced materials we aimed to compare results of conventional cytogenetic and interphase FISH (iFISH) to determine 13q14.3 deletion. Also, we measured expression levels hsa-miR-15a/miR-16-1 by qRT-PCR and compared with deletions detected by iFISH. 13q14.3 deletion was detected in 8.6% of cases by conventional cytogenetic and in 65,3% by iFISH. Mozaic form was observed in 50% of cases. Besides determining common chromosome abnormalities such as add(2)(q37), t(2;7)(p11.2;q22) del(6)(q13q21), del(6)(q25), add(9)(q21), del(11)(q23), t(11;14)(q13;q32), del(13)(q11q12), del(13q)(q12q14), add(14)(q23), del(14)(q23), t(14;19)(q32;q13.1), del(15)(q23), del(17)(p12), t(18;22)(q21;q11.2), add(21)(p13), t(17;21)(q11.2;q22), we also determined t(1;13)(q32;q34), inv(2)(p25q21), del(13)(q22q32), t(14;19)(q24;q13), dup(17)(q21q23), rob(21;21)(p13;p13) which have not been reported previously. Mitotic index data was statistically significant and DSP30+IL-2 increases mitotic index by 2.5 fold. Association between decreased miR-16-1 expression and deletions was statistically significant. We suggest that cytogenetic and FISH analyses are complementary and use of DSP30+IL-2 is effective in detecting chromosomal abnormalities. Decreased expression of hsa-miR-16-1 due to loss of 13q14.3 or other regulatory mechanisms is effective in CLL pathogenesis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    377012

    Kronik lenfositik lösemi hastalarının prognozunda floresan in situ hibridizasyon (FISH) ve CLLU1 ekspresyon çalışmalarının önemi

    Impact of fluorescent in situ hyridization (FISH) aberrrations and CLLU1 expression on the prognosis of chronic lymphocytic leukemia (CLL)

    ÜMMET ABUR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    GenetikOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. METHİYE GÖNÜL OĞUR

  2. Tez No

    303243

    17P13, 11Q22.3 VE 13Q34 delesyonu olan ve olmayan Kronik Lenfositik Lösemili (KLL) hastalarda AID gen ekspresyon-mutasyon düzeyinin araştırılması

    The assessment of the activation induced cytidine deaminase (AİDgene expression in chronic lymphatic leukemia patients with and without 17P13, 11Q22.3 VE 13Q34 deletion

    METİN YUSUF GELMEZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Hematolojiİstanbul Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELİH AKTAN

  3. Tez No

    351108

    Kronik lenfositik lösemilerde görülen prognostik kromozomal anomalilerin tanımlanmasında rutin tekniklerle beraber multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) yönteminin kullanılması

    Contribution of MLPA to routine testing used to determine the prognostic chromosomal abnormalities in chronic lymphocytic leukemia

    AKİF AYAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    HematolojiPamukkale Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMRE TEPELİ

  4. Tez No

    365278

    Kronik lenfositik lösemili (KLL) hastalarda AID protein düzeyinin ve mikroRNA ilişkisinin analizi

    Investigation of AID protein expression and miRNA in chronic lymphatic leukemia (CLL)

    METİN YUSUF GELMEZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELİH AKTAN

  5. Tez No

    638353

    Kronik lenfositik lösemide tanı anında ölçülen hipogamaglobulineminin prognostik önemi ve sıklığı

    Başlık çevirisi yok

    FATİH KUŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Hematolojiİstanbul Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELİHA NALÇACI

Geri Dön