Geri Dön

Meme kanseri dokusunda MED13 ve SRP9 gen ifade düzeylerinin araştırılması

Analysing of MED13 and SRP9 gene expression levels in breast cancer tissue

PDF İndir

  1. Tez No: 458404
  2. Yazar: SARE BURCU KAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET GÜVEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Moleküler Tıp, Medical Biology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Meme kanseri, SRP9, MED13, Adenozinin İnosine Deaminasyonu, gen ifadesi, Adenozin deaminaz, Deaminasyon, Genler, Meme neoplazmları, Neoplazmlar, Breast cancer, SRP9, MED13, Adenosine into Inosine Deamination, Adenosine deaminase, Deamination, Gene expression, Genes, Breast neoplasms, Neoplasms
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Kanser oluşum sürecinde hücresel genomda meydana gelen mutasyonlara ilave olarak, gen ifadesini düzenleyen (transkripsiyon-sonrası ve/veya translasyon-sonrası) mekanizmalardaki değişimler de karsinogenez sürecinde etkili olmaktadır. Yüksek ökaryotlarda görülen post-transkripsiyonel modifikasyonlarından biri de Adenozinin İnosine Deaminasyonu (AİD) olup, invaziv lobular meme kanseri üzerine yapılan karşılaştırmalı genome ve transkriptome çalışmaları, AİD ile ilişkili pre-mRNA modifikasyonlarında genel bir artış oldu tespit edilmiştir. Çalışmamızda, AİD modifikasyonuna maruz kalan, meme kanseri oluşumuyla ilişkilendirilmiş ve hücre içinde oldukça kritik süreçlerde görev alan, SRP9 ve MED13 mRNA ifade düzeyleri meme kanser hastalarda analiz edilmiş olup, elde edilen veriler hastalara ait klinopatolojik bulgular ile karşılaştırarak, tümör dokusu fenotipi üzerine olası etkilerini araştırmıştır. Çalışma kapsamında 49 meme kanseri hastasından alınan tümörlü ve sağlıklı meme dokularında SRP9 ve MED13 gen (mRNA) ifade düzeyleri, QRT-PCR analiz yöntemi ile saptanmıştır. SRP9 gen ifade sonuçlarımıza göre; 17 (%34,7) hastaya ait tümör dokusunda normal dokuya göre ifade düzeyinin azaldığı, 23 (%46,9) hastada arttığı ve 9 (%18,4) hastada değişmediği tespit edilmiştir. MED13 gen ifade sonuçlarımıza göre; 20 (%40,8) hastaya ait tümör dokusunda ifade düzeyinin normal dokuya göre azaldığı, 15 (%30,6) hastada arttığı ve 14 (%28,6) hastada değişmediği tespit edilmiştir. Ayrıca MED13 mRNA ifadesinde azalma ile lenf nodu metastazı olan hastalarda kapsül dışı yayılım (p=0,001) arasında anlamlı bir ilişki olduğu saptanmıştır. SRP9 gen ifadesinde artma ile ER ekspresyonu (p<0,001), PR ekspresyonu (p=0,006) ve Perinöral invazyon arasında anlamlı bir (p=0,045) ilişki olduğu saptanmıştır. Bulgular ve literatür verileri göz önüne alındığında, MED13 geninin literatürde belirtilen fonksiyonlarına ilave olarak, meme kanserinde tümör baskılayıcı gen olma potansiyeli taşıdığı, SRP9'nin ise meme kanser hücrelerinin salgı ve zar proteinlerinin ifadesini düzenleme mekanizmaları aracılığıyla, metastaz ve tedaviye direnç geliştirmesinde önemli rol oynayabileceği ifade edilebilir.

Özet (Çeviri)

It has been revealed that mutations alone that occur in cellular genome are not responsible for cancer formation, but also changes in post-transcriptional and post-translational modifications are also effective. One of post-transcriptional modification events, occuring in higher eucaryotes such as, Adenosine into Inosine Deamination (AID) analysis, comparing genome and transcriptome sequencing, revealed a generalized increase of A-to-I editing events in a case of metastatic lobular breast cancer. In our study, MED13 and SRP9 gene expression levels whose have important roles in regulating many cellular mechanisms, have been analysed in breast cancer tissue, related to A-to-I (AID) editing events and show its possible effect on tumor tissue phenotype development by investigating its relation with clinical findings related to breast cancer patients. In our study, gene expression analysis of MED13 and SRP9, in 49 normal and tumor tissiues obtained from breast cancer patients, were performed by QRT-PCR analysing method. According to our SRP9 gene expression analysis, we found decrease in expression levels of SRP9 gene in 17 (%34,7) of the patients, increase in 23 (%46,9) and there was no change in 9 (%18,4) of the patients in tumor tissue samples. According to our MED13 gene expression analysis, we found decrease in expression levels of MED13 gene in 20 (%40,8) of the patients, increase in 15 (%30,6) and there was no change in 14 (%28,6) of the patients in tumor tissue samples. When we compared these changes with clinical parameters, we found an association between the decrease of MED13 gene expression and extracapsular diffusion in patients with lymph node metastasis (p=0,001). Also, we found an association between the increase of SRP9 gene expression and ER expression (p<0,001), PR expression (p=0,006) ve perineural invasion (p=0,045). Besides its specified functions in litreature, according to our findings; MED13 gene has a potential to be a tumor suppressor gene in breast cancer. SRP9 gene may play an important role in breast cancer metastasis and treatment resistance development by affecting the regulation of secratuar and cell membrane protein expression mechanisms in breast cancer cells.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    667290

    Memenin invaziv ve in situ karsinomlarında MED1 ve MED7 ekspresyonlarının klinikopatolojik parametrelerle ilişkisinin değerlendirilmesi

    Investigating the immunohistochemical expression of MED1 and MED7 in invasive and insitu breast carcinomas, regarding clinicopathological parameters

    YASEMİN ÖZERDEM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    PatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    UZMAN ESRA UÇARYILMAZ ÖZHAMAM

  2. Tez No

    541954

    Meme kanseri dokusunda srp9 protein ekspresyonunun incelenmesi

    Analysing of srp9 protein expression level in breast cancer tissue

    GİZEM ERDOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Genel Cerrahiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET GÜVEN

  3. Tez No

    103404

    Tamoksifen kullanan postmenopozal asemptomatik meme kanseri hastalarının endometrium dokusunda telomeraz aktivitesi, endometrium patolojileri açısından izlenmesinde transvajinal ultrasonografi ve histeroskopinin yeri

    Telomerase activity in endometrium of postmenopausal women with breast cancer and diagnostic value of transvaginal US and hysteroscopy in endometrial pathologies

    MUSTAFA BÜLENT ÖZTEKİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Kadın Hastalıkları ve Doğumİstanbul Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ABDULLAH TURFANDA

  4. Tez No

    334193

    Türk toplumunda meme kanserli hastaların sağlıklı meme dokusu ve tümör dokusunda mdr-1(multi drug resistance-1) geninde cC1236T, G2677T/A veC3435T Aallellerinin sıklığının araştırılması

    Prevalence of mdr1 (multi drug resistance-1) gene C1236T, G2677T/A and C3435T Aalleles in healthy breast tissue and tumor tissue of patients with breast cancer in turkish population

    FERAH ÇAKIR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Genel CerrahiAnkara Üniversitesi

    Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SANCAR BAYAR

  5. Tez No

    611083

    Meme kanseri ve meme kanseri kök hücrelerinde bIbR1532'nin epitelyal mezenkimal transizyon üzerine moleküler etkilerinin incelenmesi

    Investigation of the effects of telomerase inhibitor ''BIBR1532'' on epithelial mesenchymal transition on breast cancer and breast cancer stem cells

    ALİCAN KUŞOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Tıbbi BiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÇIĞIR BİRAY AVCI

Geri Dön