Let-7C ifadesinin çeşitli meme kanser hücre hatlarında otofaji ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the effect of LET-7C expression on autophagy in breast cancer cell lines
- Tez No: 455251
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi, Hücre dizisi, Meme neoplazmları, Mikro RNA, Neoplazmlar, Otofaji, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Gene expression, Cell line, Breast neoplasms, Micro RNA, Neoplasms, Autophagy, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Otofaji, uzun ömürlü proteinlerin, hasarlı organellerin ve katlanmamış proteinlerin oluşturduğu çökeltilerin yıkımı için var olan lizozomal katabolik bir yolaktır. Otofajinin, kanser, otoimmün ve nörodejeneratif hastalıklar gibi birçok hastalıkta rol oynadığı bilinmektedir. MikroRNA'lar (miRNA), 19-25 nükleotid uzunluğunda tek zincirli kodlanmayan RNA'lardır ve gen ifadesinde transkripsiyon sonrasında görev almaktadır. miRNA'ların tümör gelişiminde, metastazında ve istilasında tümör baskılayıcı veya onkogen olarak rol aldıkları bilinmektedir. miRNA'ların ifadelerindeki düzensizlikler meme kanserinde de gözlemlenmektedir. Let-7c, çeşitli kanserlerde ifade seviyesi düşük bulunmuş ve tümör baskılayıcı olarak hareket ettiği düşünülmektedir. Bu çalışmada SKBR-3, MCF-7, CRL-2329 meme kanseri hatlarında ve CRL-4010 normal meme epitelyum hücre hattında let7c ifade seviyesi ve otofaji yolağındaki etkisi qRT-PCR, GFP-LC3, western blot teknikleri kullanılarak araştırılmıştır. Let7c ifadesi MCF-7 ve CRL2329'da normal meme epitel hücre hattına göre qRT-PCR yöntemine göre belirgin şekilde düşük bulunmuştur. Let7c ifadesinin arttırılması ile SKBR-3 ve CRL-2329'da GFP-LC3 tekniğiyle incelendiğinde otofagazom sayısında artış gözlemlenmiştir. Western blot tekniği ile ATG9A seviyesi SKBR-3 ve CRL4010'da azalış göstermiş, LC3II/LC3I oranı ise sadece CRL4010'da yüksek bulunmuştur. İleriki yapılacak çalışmalarla Let7c ve tahmini hedefi ATG9A arasındaki ilişki ve meme kanserinde let7c'nin terapötik potansiyeli çok daha iyi anlaşılacaktır.
Özet (Çeviri)
Autophagy is a lysosomal catabolic pathway of degradation of long-lived proteins, damaged organelles and unfolded protein aggregates. It has been known that autophagy plays a role in certain diseases such as cancer, autoinflammatory diseases and neurodegenerative disorders. MicroRNA(miRNA) is defined 19-25 nucleotids in length, single stranded, small non-coding RNA molecules. MiRNA's have a role post-transcriptional regulation of gene expression. MiRNAs are known to take roles in tumor development, metastasis and invasion as tumor suppressor or oncogene. The deregulation of miRNA expression has been observed in breast cancer. Let-7c acts as a tumor suppressor and has been found to be lower in many tumors. In this study, it has been investigated levels of let-7c expression in SKBR-3, MCF-7, CRL-2329 breast cancer cell line and CRL-4010 normal breast epithelial cell line and its effects on autophagy using qRT-PCR, GFP-LC3, western blotting technique in this study. It was found that levels of let-7c expression are markedly lower in MCF-7 and CRL-2329 than normal breast epithelial cell line using qRT-PCR. Over-exspression of let-7c was shown to increase autophagosom in SKBR-3 and CRL-2329 by GFP-LC3 technique. Furthermore, levels of Atg9A were significantly decreased in SKBR-3 and CRL-4010 and the ratio of LC3II/I was higher in CRL-4010. In further studies, the relationship between Let7c and its predicted target ATG9A, and the therapeutic effects of let7c might be better understood in breast cancer.
Benzer Tezler
- La selection d'un systeme de production flexible (SPF) par la programmation lineaire booleenne floue
Çok amaçlı bulanık 0-1 programlama ile esnek imalat sistemi (EİS) seçimi
ONUR KUZGUNKAYA
Yüksek Lisans
Fransızca
2000
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiGalatasaray ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. E. ERTUĞRUL KARSAK
- Yeni Cami'nin akustik açıdan performans değerlendirmesi
Evaluation of the acoustical performance of the New Mosque
EVREN YILDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiMimarlık Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVTAP YILMAZ DEMİRKALE
- Mide kanserinde polimorfik Helicobacter Pylori CagA genotiplerinde miR-200a-3p, miR-223-5p ve miR-29a-3p ekspresyon analizi
Expression Analysis of miR-200a-3p, miR-223-5p and miR-29a-3p in Polymorphic Helicobacter Pylori CagA Genotypes in Gastric Cancer
MEYREM OSUM
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
GenetikHaliç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELİHA BURCU IRMAK YAZICIOĞLU
- Elektromagnetik dalgaların rezistif yan duvarlı bir oluktan saçılımı
Electromagnetic wave scattering from a rectangular groove with resistive walls
DEMET SEVİL ARMAĞAN ŞAHİNKAYA
Doktora
Türkçe
2003
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EREN ERDOĞAN