Karbapenem dirençli pseudomonas aerugınosa izolatlarında KPC (Klebsıella pneumonıae carbapenemase) geninin araştırılması
Investigation of KPC (Klebsiella pneumoniae carbapenemase) genes in carbapenem resistant pseudomonas aeruginosa isolates
- Tez No: 454095
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. YELİZ TANRIVERDİ ÇAYCI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Karbapenem direnci, Pseudomonas aeruginosa, KPC geni, KİM, Genler, Karbapenemler, Klebsiella pneumoniae, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Carbapenem Resistance, Pseudomonas aeruginosa, KPC gene, CIM, Genes, Carbapenems, Klebsiella pneumoniae, Drug resistance, Drug resistance-microbial
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Çalışmada, Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıp Laboratuvarları Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü Bakteriyoloji Laboratuvarına gönderilmiş klinik örneklerden izole edilen 200 Pseudomonas aeruginosa izolatı dahil edildi. Çalışmaya dahil edilen P. aeruginosa izolatlarında karbapenem direncine neden olan karbapenemaz enzimlerinden biri olan KPC enzimini üreten KPC geninin varlığının moleküler olarak ve çalışma izolatlarının karbapenem inaktivasyon metodu (KİM) karbapenemaz üretiminin tespit edilmesi planlandı. Materyal ve Metot: İzolatların tanımlanması konvansiyonel yöntemler ve Vitek-MS otomatize sistemi kullanılarak yapıldı. Antibiyotik duyarlılığı Vitek2 Compakt otomatize sistemi ile test edildi. P. aeruginosa izolatları moleküler çalışmaya kadar -20°C'de saklamaya alındı. Karbapenem dirençli izolatların kaynatma yöntemiyle DNA ekstraksiyonu yapıldı. DNA ekstraksiyonundan sonra özgün primer kullanılarak optimizasyon işlemi yapıldı. Optimizasyondan sonra Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) yöntemiyle KPC gen varlığı P. aeruginosa izolat araştırıldı. Ayrıca çalışma izolatlarının karbapenemaz üretimi fenotipik bir test olan KİM ile belirlendi. Bulgular: İzolatların en fazla olarak trakeal aspirat kültüründen (% 34,5) izole edildiği saptandı. P. aeruginosa örneklerinin en büyük bölümü dahiliye servisinden (% 36) izole edildiği belirlendi. PZR ile P. aeruginosa izolatlarının hiç birinde KPC geni belirlenemedi. Çalışma suşlarına uygulanan KİM'nun sonuçlarına göre suşların 22'si pozitif, 178'si negatif olarak saptandı. Sonuç: Bizim çalışmamızda P. aeruginosa izolatlarında KPC geni tespit edilmemiş ve KİM'na göre karbapenemaz üreten 22 pozitif izolat belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Aim: This study was included 200 Pseudomonas aeruginosa isolates, which isolated from clinical samples and sent to Bacteriology Laboratory of Medical Microbiology Department of Medical Faculty of Ondokuz Mayıs University Medical Faculty. We aimed to investigate the presence of KPC gene producing KPC enzyme, one of the carbapenemase enzymes that cause carbapenem resistance, and carbapenem inactivation method (CIM) of study isolates, in P. aeruginosa isolates which were included in the study. Material and Method: Identification of isolates was carried out using conventional methods and Vitek-MS automated system. The antibiotic susceptibility was tested with the Vitek2 Compact automated system. P. aeruginosa isolates were stored at -20 ° C until the molecular study. DNA extraction of carbapenem resistant isolates was performed by boiling method. After DNA extraction, optimization was performed using the original primers. After optimization, KPC gene was investigated by polymerase chain reaction (PCR) method. In addition, carbapenemase production of isolates was determined by the CIM a phenotypic test. Results: The isolates were identified mostly from the tracheal aspirate cultures (34.5 %). The greatest proportion of P. aeruginosa specimens were isolated from internal medicine (36 %). KPC gene was not detected in none of the P. aeruginosa isolates by PCR method. According to the results of CIM, 22 were detected positive and 178 were negative. Conclusion: In our study, KPC gene was not detected in P. aeruginosa isolates however 22 isolates were identified as carbapenamase producing according to the CIM results.
Benzer Tezler
- Karbapenem dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında VIM, IMP, NDM, KPC, OXA-48 ve GES tipi karbapenemazların moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of VIM, IMP, NDM, KPC, OXA-48 and GES carbapenemases in carbapenem resistant pseudomonas aeruginosa isolates with molecular methods
GÜLŞAH MALKOÇOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ELİF AKTAŞ
- Hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden izole edilen çoklu ilaç dirençli acinetobacter ve pseudomonas izolatlarında metallobetalaktamaz (MBL) varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of the phenotypic and genotypic methods of the metallobetalactamase presence in multidrug resistance acinetobacter and pseudomonas isolates from an intensive care unit infections in our hospital
CENNET RAĞBETLİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU
- Turgut Özal Tıp Merkezinde 2009 yılında nozokomiyal pseudomonas aeruginosa izolatlarında antibiyotik direnç, indüklenebilir beta-laktamaz ve metallo beta-laktamaz oranlarının belirlenmesi
Determination of antibiotic resistance, inducible beta-lactamase and metallo beta-lactamase rates for nosocomial pseudomonas aeruginosa isolates in Turgut Özal Medical Center within 2009 year
AHMET MANSUR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Mikrobiyolojiİnönü ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SELMA AY
- Klinik örneklerden izole edilen pseudomonas aeruginosa izolatlarında metallobetalaktamaz üretiminin araştırılması
Investigation of metallo beta lactamase production in pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples
ELİF VURAL TAŞDEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURAN DELİALİOĞLU
- Pseudomonas aeruginosa ve acinetobacter baumannii izolatlarında imipenem-edta/meropenem-edta disk yöntemi ve motifiye hodge testi ile metallo beta-laktamaz varlığının araştırılması
Investigation of metallo-beta-lactamase producing pseudomonas aeruginosa and acinetobacter baumannii isolates by imipenem-edta/meropenem-edta disk method and modified hodge test
HATİCE ÇINAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiAfyonkarahisar Sağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MERİH ŞİMŞEK