Geri Dön

Kan kültürlerinde üreyen candida türlerinin tanımlanmasında ve antifungal duyarlılığının araştırılmasında standart yöntemler ile yeni yöntemlerin karşılaştırılması

Comparison of conventional methods and new methods in identification and antifungal susceptibility of Candida spp. from blood cultures

PDF İndir

  1. Tez No: 435789
  2. Yazar: HAKAN ODABAŞI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ASUMAN BİRİNCİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Antifungal ajanlar, Antifungal duyarlılık testleri, Kan kültürü, Kandida, İndikatör dilüsyon teknikleri, Antifungal agents, Antifungal sensitivity tests, Blood culture, Candida, Indicator dilution techniques
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

İnvaziv Candida enfeksiyonlarının erken ve doğru tanımlanması ve antifungal duyarlılık testlerinin erken ve doğru olarak verilmesi, morbidite ve mortaliteyi azaltmak için önemli bir değere sahiptir. Kültür sonucunda üreyen Candida türlerinin tanımlanması ve antifungal duyarlılığın çalışılması 3-4 gün sürmektedir. Bu sürenin kısaltılması etkin tedavi açısında önemlidir. Bu nedenle yeni alternatif tanımlama ve antibiyotik duyarlılık testlerine ihtiyaç duyulmaktadır. Çalışmamızda invaziv kandidemi nedeni olan Candida türlerinin tanımlanmasında yeni bir sistem olan MALDI-TOF MS(Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time-Of-Flight Mass Spectrometry) ile tanımlanması ve sonuçların konvansiyonel sistemler ile karşılaştırılması, antifungal duyarlılık için yeni bir sistem olan Sensititre Yeastone (Trek Diagnostic System) antifungal duyarlılık kiti ile çalışılıp sonuçların altın standart test olan mikrodilüsyon metoduyla karşılaştırılması amaçlanmıştır. OMÜ Tıp Fak. Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarında, değişik servislerde yatan hasta kan örneklerinden izole edilen 71 Candida suşu çalışmaya alındı. Tür tayini germ tüp testi, kromojenik besiyeri ve pirinç ekstresi-Tween 80 agar kullanılarak yapıldı. Tür tayini sonucu göre; 37'si (%52,1) C. albicans, 34'ü (%47,9) non-albicans Candida (20 C. parapsilosis, 7 C. glabrata, 4 C. tropicalis, 2 C. kefyr, 1 C. lusitaniae) olarak tanımlandı. Konvansiyonel yöntem ile tanımlanmış tüm suşların Vitek MS ile de tanımlaması yapıldı ve konvansiyonel yöntemlerle %100 uyumlu bulundu. İzolatların amfoterisin B, kaspofungin, flukonazol, itrakonazol ve vorikonazol'e duyarlılıkları referans yöntem ve Sensititre YeastOne mikroplak yöntemi araştırıldı. Referans mikrodilüsyon yöntemi ile Sensititre YeastOne mikroplak yöntemi arasındaki esansiyel uyum oranları tüm Candida türleri arasında amfoterisin B'de %94,4, flukonazol %92,9, kaspofungin %100, itrakonazol %94,4 vorikonazol'de %98,6 olarak saptanmıştır. Referans mikrodilüsyon yöntemi ile Sensititre YeastOne mikroplak yöntemi arasındaki kategorik uyum oranları kaspofungin için %100, flukonazol için %97,1 vorikonazol için%100 olarak tespit ettik

Özet (Çeviri)

Early and accurate identification and antifungal susceptibility of invasive candida infections have a significant value in order to reduce morbidity and mortality. After the cultivation, identification and antifungal susceptibility of Candida species lasts for 3-4 days. It is important to shorten the time for the treatment of infections. Therefore, new alternative methods are needed for identification and antibiotic susceptibility testing. In this study, it is aimed to compare MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time-Of-Flight Mass Spectrometry) which is a new method in identification of Candida spp. and conventional methods in identication of Candida spp. from invasive infections and furthermore to compare Sensititre Yeastone (Trek Diagnostic System) a new method for testing antifungal susceptibility with microdilution method which is a gold standart for determination of antifungal susceptibility. Seventy-one Candida strains isolated from blood samples of the patients staying in different services at Ondokuz Mayıs University, Medical Faculty Hospital Medical Microbiology Laboratory were included in the study. Species identification germ tube test was made using chromogenic medium and brass extract-Tween 80 agar. According to species identification result, 37 of the species (52.1%) were identified as C. albicans and 34 of them (47.9%) were identified as non-albicans Candida (20 C. parapsilosis, 7 C. glabrata, 4 C. tropicalis, 2 C. kefyr, 1 C. lusitaniae). All conventionally identified strains were also identified with Vitek MS and they were 100% compatible with conventional methods. Sensitivity of isolates to amphotericin B, caspofungin, fluconazole, itraconazole and voriconazole was examined with reference method and Sensititre YeastOne microplate method. Essential agreement ratios between the reference microdilution method and the Sensititre YeastOne microplate method were detected as 94.4% in amphotericin B, 92.9% in fluconazole, 100% in caspofungin, 94.4% in itraconazole, and 98.6% in voriconazole among all Candida species. Categorical agreement ratios between reference microdilution method and Sensititre YeastOne mikroplate method were detected as 100% for caspofungin, 97.1% for fluconazole, and 100% for voriconazole.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    408453

    Kan kültürlerinden izole edilen candida türlerinin floresan in situ hibridizasyon yöntemiyle tanımlanması ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması

    Determination of candida species isolated from blood cultures with floresan in situ hibridization method and investigation of antifungal susceptibilty

    GONCA AYDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE NEDRET KOÇ

  2. Tez No

    310301

    Kan kültürlerinde üreyen mantarların antifungal duyarlılıkları

    Antifungal susceptibility of fungi in blood cultures

    BİRAY OFLAZOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DİLEK YEŞİM METİN

  3. Tez No

    509534

    Çocuk yoğun bakım ünitesinde yatan hastalardan alınan kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmaların ve antibiyotik duyarlıklarının değerlendirilmesi

    Evaluation of microorganisms isolated of blood cultures taken from inpatients in pediatric intensive care unit and their of antibiotic susceptibility

    HALİT IŞIK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    UZMAN AYŞE BETÜL ERGÜL

  4. Tez No

    678354

    Çocuk yanıklarında enfeksiyon etkenleri ve mortaliteye etkileri

    Infectious agents in children's burns and their effects on mortality

    SABRİ DEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Çocuk CerrahisiSağlık Bakanlığı

    Çocuk Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMRAH ŞENEL

  5. Tez No

    347925

    Kandan izole edilen kandida türleri ve antifungal duyarlılıkları

    The candida species isolated from blood and antifungal Susceptibility

    VESİLE TUBA BALABAN ERAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiCelal Bayar Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KENAN DEĞERLİ

Geri Dön