Mycobacterium tuberculosis suşlarının duyarlılık testinde kullanılan sensititre mycotb panel yönteminin performansının agar proporsiyon yöntemi ile karşılaştırılması
A comprasion of performance of the sensititre mycotb panel and the agar proportion method for the susceptibility testing of mycobacterium tuberculosis
- Tez No: 414878
- Danışmanlar: PROF. DR. CENGİZ ÇAVUŞOĞLU
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Agar, Mycobacterium tuberculosis, İlaç alerjisi, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Agar, Mycobacterium tuberculosis, Drug hypersensitivity, Drug resistance, Drug resistance-microbial
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
GİRİŞ VE AMAÇ:Tüberküloz, enfeksiyöz bir etkene bağlı ölüm nedenleri arasında dünyada halen ilk sıralarda yer almaktadır. Çoklu ilaca dirençli tüberküloz (ÇİD-TB) ve yaygın ilaca dirençli tüberküloz (YİD-TB) olgularındaki artış Mycobacterium tuberculosis'de ilaç duyarlılığını belirlemek için hızlı, kolay uygulanabilen ve standardize yöntemlerin geliştirilmesine ihtiyaç oluşturmuştur. İlaç duyarlılığının hızlı ve doğru bir şekilde belirlenip, hastalara uygun tedavinin planlanması tüberküloz kontrol programlarının temel hedeflerinden biridir. Bu çalışmanın amacı Sensititre MycoTB plak yöntemini doğruluk, sonuçların alınması için gerekli olan inkübasyon süresi ve kullanım kolaylığı açısından altın standart agar proporsiyon yöntemi (APY) ile karşılaştırmak ve APY'nin yerine kullanılabilecek kadar etkin bir yöntem olup olmadığını belirlemektir. GEREÇ VE YÖNTEM: Çalışmada, Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Mikobakteriyoloji Laboratuvarı kültür koleksiyonunda bulunan 36'sı farklı direnç paternlerine sahip, 64'ü tüm birinci seçenek ilaçlara duyarlı toplam 100 M.tuberculosis suşu kullanıldı. Tüm M.tuberculosis suşlarında rifampisin (RİF), izoniyazid (INH), etanbutol, streptomisin, ofloksasin, moksifloksasin, amikasin, rifabutin, para-aminosalisilik asit, etiyonamid, sikloserin ve kanamisin ilaç duyarlılıkları APY ve Sensititre MycoTB plak yöntemiyle belirlendi. APY CLSI'da tanımlandığı şekilde, Sensititre MycoTB plak yöntemi üreticinin tanımladığı şekilde yapıldı. Veri analizinde SPSS 20.0 paket programı kullanıldı. Sonuçlar %95 güven aralığında değerlendirilip, duyarlılık, özgüllük hesaplandı. p <0,05 değeri istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi. BULGULAR: Çalışmada test edilen tüm antibiyotiklerin uyum yüzdeleri % 95'le %100 arasında, özgüllükleri % 95'le %100 arasında ve duyarlılıkları %86'yla %100 arasında değişmektedir. Antibiyotiklerin uyum yüzdeleri, özgüllükleri, duyarlılıkları sırasıyla RIF için% 99; %99; %100 , INH 0.2µg/ml için%98; %97.2; %100, INH 1 µg/mliçin % 98; %97.4; % 100, STR için%99; %99; %100, ETB için %96;% 97; %89, OFL için %97;% 97; %100, MXF için %95; %95; %100, AMI için%100; %100; %100, RFB için % 97; %97; %100, PAS için %%96; %96; 100, ETH için %96; %98;% 86, CYC için %98; %98; %100, KAN için %97;% 97; %100 olarak bulunmuştur. Tüm antibiyotikler %95 güven aralığında olup, p değeri p<0.001 olarak istatiksel olarak anlamlı saptanmıştır. Çalışma sonucunda izolatların 14'ünde APY ile 16'sında ise Sensititre MycoTB plak yöntemiyle ÇİD (INH ve RİF direnci birlikte) saptanırken, izolatların hiçbirinde YİD[ÇİD ek olarak TB tedavisinde kullanılan herhangi bir florokinolona ve parenteral ikinci-basamak antitüberküloz ilaçlardan (amikasin, kanamisin ve kapreomisin) herhangi birisine direnç gelişmesi]saptanmamıştır. SONUÇ:Sonuç olarak elde ettiğimiz verilere bakarak; inkübasyon süresinin 14 gün olması, uyum %95-100, özgüllük %95-100, duyarlılık %86-100, p <0.001 saptanmasıyla Sensititre MycoTB plak yönteminin altın standart kabul edilmiş APY yerine kullanılabilecek kadar etkin bir yöntem olduğu sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
INTRODUCTION AND AIM: Tuberculosis is still one of the most common mortal enfectious disesase around the World.Due to increase of multidrug-resistant (MDR)M.tuberculosis and extensively drug-resistant (XDR) tuberculosis cases, fast, easy and standardised methods need to be developed to determine drug resistance inM.tuberculosis. Determining drug resistance rapid and correctly, and starting appropriate medication is one of the main goals of tuberculois control programmes. Aim of this study is to compare the Sensititre MycoTB plate method to the gold standard agar proportion method (APM) fort the parameters: precision, incubation time for results and simplicity. We also aimed to determine if the Sensititre MycoTB plate method is effective enough to be used instead of the APM. MATERIALS AND METHOD: 36 isolates with different resistance patterns and 64 isolates sensitive to all first line agents, a total of 100 M.tuberculosisisolatesstored in culture collection of Microbiology Department Laboratory, Ege University School of Medicine, were used. Rifampin, isoniazid, ethambutol, streptomycin, ofloxacin, moxifloxacin, amikacin, rifabutin, para-aminosalicylic acid, ethionamide, cycloserineand kanamycin drug sensitivities of all isolates were determined by the APM and the Sensitirre MycoTB plate method. As defined in APM CLSI, Sensititre MycoTB plate method was used as instructed in producers manuel. SPSS 20.0 package programme is used for data analysis. Results are assessed in %95 confidence interval and sensitivity and specificity are defined. P<0,05 accepted statistically significant. RESULTS: All antibiotics used had% agreement categorical between 95 to 100 %, specificity between 95 to 100%, sensitivity between 86 to 100 %. In order, % agreement categorical, specificity, sensitivities of drugs are; RIF %99;% 99;% 100, INH 0.2µg/ml%98; %97.2;% 100, INH 1 µg/ml%98;% 97.4;% 100, STR %99;% 99;% 100, EMB%96;% 97;% 89, OFL %97; %97;%100, MXF %95;% 95;% 100, AMI %100;%100;%100, RFB %97;% 97; %100, PAS %96;% 96;% 100, ETH %96; %98;% 86, CYC %98;% 98;% 100, KAN %97; %97; %100. All antibiotics were in %95 agreement categorical and p value was <0,001, statistically significant. MDR was detected in 14 of isolates by the APM and 16 of isolates by the Sensititre MycoTB plate method. None of the isolates had XDR[In addition to MDR resistance aganist any fluoroquinolones and at least one of the second-line injectable drugs (amikacin, kanamycin or capreomycin)] CONCLUSION: According to results, with an incubatioan period of 14 days, 95 to 100% agreement, 95 to 100 % specificity, 86 to 100 % sensitivity and p<0,001 we could state that the Sensititre Myco TB method is effective enough to be used instead of the gold standard APM.
Benzer Tezler
- Değişik coğrafik bölgelerden izole edilen antimikobakteriyel ajanlara duyarlı ve dirençli Mycobacterium tuberculosis suşlarının sodyum dodesil sulfat poliakrilamid jel elektroforezi (SDS-PAGE) ile incelenmesi
Research on Mycobacterium tuberculosis, isoladet from various geographic regions to antimycobacterial agents by using sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE)
IŞIN AKYAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1998
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEYYAL ROTA
- Van yöresinde izole edilen mycobacterıum tuberculosıs suşlarının dört farklı yöntemle antimikobakteriyel ajanlara duyarlılık tespiti.
Evaluation of four methods to determine antimicrobial susceptibility of mycobacterium tuberculosis in eastern turkey.
ELİF SANEM BAYKAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU
- Mycobacterium tuberculosis kompleks suşlarının BACTEC MGIT 960 sistemiyle primer antitüberküloz ilaçlara direncinin araştırılması
Invastigation of primary antituberculosis drug resistance using BACTEC MGIT 960 system in Mycobacterium tuberculosis complex strains
YUSUF SAĞLAM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Mikrobiyolojiİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLHAN AFŞAR
- Çukurova bölgesinde klinik örneklerden izole edilen Mycobacterium tuberculosis kompleks (MTBK)suşlarında çoklu ilaç direnci (ÇİD) ile beraber ikinci seçenek anti-tüberküloz ilaçlara da karşı gelişen yaygın ilaç direncinin (YİD) fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi
Phenotypic and genotypic investigation of multidrug resistance (MDR) as well as extensively drug resistance (XDR) developing towards second-line anti-tuberculosis drugs in mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) strains isolated from clinical samples in cukurova region
EMEL YARAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. TOĞRUL NAĞIYEV
- Mycobacterium tuberculosis izolatlarında ilaç resistansı ve mutasyonel değişimlerle ilişkisi
Determination of Rifampicin resistance in isolates of mycobacterium tuberculosis
MERAL ÇEKEM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2000
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL