Asmada kök stres transkriptomlarının belirlenmesine yönelik mikrodizin analizleri
Comparative analysis of root drought stress transcriptomes of cabernet sauvignon and the 5BB rootstock
- Tez No: 414088
- Danışmanlar: PROF. DR. ALİ ERGÜL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Botanik, Biyoloji, Biotechnology, Botany, Biology
- Anahtar Kelimeler: Bitki kök hücreleri, Klon anaç, Kuraklık stresi, Ozmotik stres, Şaraplık üzüm, Plant root cells, Clon rootstock, Drought stress, Osmotic stress, Wine grape
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Asma (Vitis vinifera L.), kurağa kısmen yüksek tolerans göstermektedir. Filoksera (Phylloxera vastatrix radicicola) zararı, bağcılık yapılan alanlarda amerikan asma anaçlarının kullanımını zorunlu hale getirmiştir. Bununla birlikte asma kurağa yüksek tolerans göstermesine karşın, birçok anacın kurağa toleransı genellikle önemli derece düşüklük göstermektedir ve bu durum kurak alanlarda bağcılıkta kalite ve verim kaybına neden olmaktadır. 110R, 140Ru, 99R gibi bazı anaçlar, kurağa daha toleranslı bulunurken, 5BB, 5C, SO4 gibi anaçların kurak toleransı yönünden V. vinifera' ya oranla daha zayıf olduğu olduğu bildirilmektedir. Kurağa toleranslı Vitis vinifera L. çeşidi ile toleransı düşük asma anacının, kök transkriptomlarını/transkriptom ifadelerini karşılaştırmak, üzümde kurağa toleransla ilişkili moleküler temellerin anlaşılmasında önemli bulgular sağlayacaktır. Bu araştırmada, esas olarak yaprak-tane transkriptlerinden geliştirilen Affymetrix Vitis Genome Array (Gen chip) (ver. 2.0) kullanılarak, kuraklık stresine maruz bırakılan Cabernet Sauvignon (Vitis vinifera L.) çeşidi ve Kober 5BB (V. berlandieri X V. riparia) anacının kök transkriptomları karşılaştırılmış ve 5BB anacında; ifade farklılığı olan 1925 (807 ifadesi artan ve 118 azalan), CS çeşidinde 1279 (745 ifadesi artan ve 534 azalan) adet transkript belirlenmiştir. Kuraklık stresine karşı kökte indüklenen transkriptler çeşit ve anaçta karşılaştırıldığında önemli farklılıklar gözlemlenmiştir
Özet (Çeviri)
Grape (Vitis vinifera L.), shows relatively high tolerance to drought stress. Phylloxera (Phylloxera vastatrix radicicola) damage made the use of insect-resistant rootstocks necessary in many areas of grape cultivation. However, although Vitis vinifera shows relatively high tolerance to drought, the drought tolerance of most rootstocks is often quite low and this causes yield and quality loss in grapes grown in arid areas. However, some rootstock varieties, such as 110R, 140Ru, 99R, are more drought tolerant, whereas others, such as 5BB, 5C, and SO4 are less drought tolerant than V. vinifera L. Comparative analysis of root gene expression patterns of drought tolerant V. vinifera with drought sensitive rootstocks would provide useful information towards better understanding the molecular basis of drought tolerance in grapes. In this research, we comparative analyzed drought stress treatment root transcriptomes of Cabernet Sauvignon (Vitis vinifera L.) and the rootstock Kober 5BB (V. berlandieri X V. riparia) using the Affymetrix Vitis Genome array ver. 2.0 generated from leaf and berry transcripts. İn 5BB rootstock, 1279 (745 up and 534 down) transcripts were determined within the 1925 (807 up and 118 down) CS types with expression difference. When the transcripts induced in the root against drought stress were compared in type and rootstock, no significant differences could be observed.
Benzer Tezler
- Bazı asma anaçları ve sultani çekirdeksiz üzüm çeşidinde kuraklık stresine karşı gösterilen fizyolojik ve transkriptomik özelliklerin belirlenmesi
Determination of physiological and transcritomic responses in some rootstocks and sultani̇ çeki̇rdeksi̇z (Vitis vinifera L.)variety to drought stress
SEDA SUCU
Doktora
Türkçe
2016
ZiraatGaziosmanpaşa ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ADEM YAĞCI
YRD. DOÇ. DR. KUBİLAY YILDIRIM
- Rubia tinctorum l. (Kök boya) hücre süspansiyon kültürlerinde çeşitli stres faktörlerinin biyokütle miktarı ve sekonder metabolit içerikleri üzerine etkileri
Effect of different stress factors on biomass and secondary metabolite content in madder (Rubia tinctorum l.) cell suspension cultures
ELMİRA NAZIRI
- Kök ucu açık dişlerde sonlu elemanlar analizi kullanılarak farklı yönlerden gelen travmaların oluşturduğu streslerin değerlendirilmesi
Evaluation of stress caused by trauma from different directions by using finite element analysis in immature teeth
SELİN BİLGİN ÖZDEMİR
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2017
Diş HekimliğiSelçuk ÜniversitesiPedodonti Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FİRDEVS KAHVECİOĞLU
- Bazı fizyolojik stres koşulları ve eksojen poliaminlerin (spermin, spemidin, putresin) Isatis tinctoria L. bitkisinin yapraklarındaki indigo miktarı üzerine etkisinin araştırılması
The investigation of the effects of some physiological stress conditions and exogenous poliamines (spermine, spermidine, putrescine) on indigo amounts of Isatis tinctoria L. leaves
SEMRA ARIKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BotanikKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NAZAN ÇÖMLEKCİOĞLU
- Amerikan asma anaçlarında kurağa dayanımın erken belirlenmesinde In vitro bir yöntem geliştirilmesi
Development of an In vitro method for the early determination of drought resistance in American grape rootstocks
NURAY MEŞE
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERPİL TANGOLAR