Nöronal farklılaşma sürecinde perinöronal kılıf elemanlarının incelenmesi
Investigation of perineuronal net elements during the neural differentiation process
- Tez No: 409647
- Danışmanlar: DOÇ. DR. DİDEM DAYANGAÇ ERDEN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Asetilglükozaminidaz, Hyalüronik asit, Hücre farklılaşması, Nöritler, Nöronlar, Proteinler, Proteoglikanlar, Tenaskin, Acetylglucosaminidase, Hyaluronic acid, Cell differentiation, Neurites, Neurons, Proteins, Proteoglycans, Tenascin
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hücre dışı matrisin özelleşmiş bir yapısı olan perinöronal kılıf (PNK), merkezi sinir sistemindeki nöronların gövdesini ve proksimal nöritlerini çevreler. Temel elemanları hyaluronan ve proteoglikan bağlayıcı protein 1 (HAPLN1), aggrecan (ACAN) ve tenascin-R (TNR) proteinleridir. Nöritogenez hatalarının görüldüğü hastalıklarda bu genlerin ekspresyonlarının azalması ve oluşturdukları PNK yapısının bozulması, bu genlerin nörit uzama sürecinde etkili olabileceğini düşündürmüştür. Ayrıca nöritogenez sürecinde bazı hücre dışı matris elemanlarının rol oynadığı bilinmektedir. Bu çalışma ile nörona farklılaştırılan PC12 hücreleri kullanılarak nörit uzama sürecinde HAPLN1, ACAN ve TNR'nin RNA ve protein düzeyindeki ifadelerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Farklılaşma öncesi (0.gün) ve farklılaşmanın 3, 5 ve 7. günlerinde hücreler, qRT-PCR ve western blot yöntemleri kullanılarak RNA ve protein düzeyinde incelenmiştir. HAPLN1 mRNA ifadesinde farklılaşmamış duruma kıyasla 5. günde 1,7 kat (p<0,05) ve 7. günde 2,9 kat (p<0,001) artış, proteinde ise 5. günde 0,3 kat (p<0,05) ve 7. günde 0,2 (p<0,01) kat azalış saptanması HAPLN1'in nörit farklılaşma sürecinde etkili olabileceğini ve sentezden hemen sonra hücre dışına salgılanabileceğini düşündürmektedir. TNR mRNA ve protein ifadesinin farklılaşma sürecinde değişmediği saptanmıştır. ACAN mRNA düzeyinin qRT-PCR ile kantite edilemeyecek kadar bazal bir seviyede olduğu ancak protein düzeyinde 5. günde 2,7 kat (p<0,05) ve 7. günde 3,7 kat (p<0,001) artış olduğu tespit edilmiştir. Bu sonuçlar, PNK elemanları arasında en fazla posttranslasyonel modifikasyonlara uğrayan protein olan ACAN'ın farklılaşmanın daha ileriki dönemlerinde hücre dışına salgılandığını düşündürmektedir.
Özet (Çeviri)
Perineuronal nets (PNNs) which are specialized substructures of neural extracellular matrix, surround cell soma and proximal neurites of neurons. HAPLN1, tenascin-R (TNR) and aggrecan (ACAN) are major elements of it. In diseases caused by neuritogenesis defects, their expressions decrease suggesting that these elements can be related with neural differentiation. Also it is known that extracellular matrix elements have important roles in neuritogenesis. The aim of this study is to determine mRNA and protein levels of HAPLN1, TNR and ACAN in neural differentiation using neuron-like PC12 cells. qRT-PCR and western blot were performed in order to investigate mRNA and protein levels of these molecules on specific time points before and after differentiation (day 0,3,5,7). Our study demonstrated that HAPLN1 mRNA level showed 2,9 fold increase at day 7 compared to non differentiated state, whereas cellular HAPLN1 protein level showed a decrease indicating that HAPLN1 protein have an effect on neural differentiation and may be secreted immediately. TNR mRNA/protein levels remained unchanged. On the other hand, the amount of cellular ACAN protein showed 3,7 fold increase at day 7. These results suggested that, ACAN protein which have a large amount of post-translational modifications may be secreted future time points of differentiation.
Benzer Tezler
- Neurogenesis and migration of specified chemosensory neurons in the adult zebrafish olfactory epithelium
Yetişkin zebrabalığı koku epitelinde özelleşmiş kimyasal duyu sinir hücrelerinın nörojenez ve göçü
KHALID BAYRAMLI
Doktora
İngilizce
2016
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. STEFAN HERBERT FUSS
- Nöroglial farklılaşma sürecinde AKT-AMP kinaz ve MTOR aracılı asetil KOA ve ilişkili metabolit değişimlerinin belirlenmesi
Determination of AKT-AMP kinase and MTOR-mediated acetyl coa and acetyl COA related metabolite changes in neuroglial differentiation processes
RAMAZAN UĞUR BORA
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiSinir Bilimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PINAR AKAN
- Nikotin maruziyetinin fare embriyonik kök hücrelerinde nöronal farklılaşma üzerine etkisi
The effects of nicotine exposure on neural differentiation in mouse embryonic stem cells
İNAYET NUR USLU
Doktora
Türkçe
2021
Tıbbi BiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYFER PAZARBAŞI
- Wharton jölesi türevli mezenkimal kök hücrelerde AKT yolağı ve AMP kinazın nöronal farklılaşma üzerine etkileri
The effects of the AKT pathway and AMP-activated protein kinase on neuronal differentiation in Wharton's jelly-derived mesenchymal stem cells
İREM NUR GÖKBAYRAK ATAY
Doktora
Türkçe
2026
BiyokimyaDokuz Eylül ÜniversitesiSinirbilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PINAR AKAN
PROF. DR. MURAT ÖRMEN
- Role of DNA Topoisomerase IIβ in Rho GTPase dependent axon growth through neural differentiation of human mesenchmal stem cells
İnsan mezenkimal kök hücrelerinin nöral farklılaşma sürecinde Rho GTPaz bağımlı akson büyümesinde DNA Topoizomeraz IIβ'nın rolü
MERVE ZAİM