İnflamatuvar bağırsak hastalıklarının patogenezinde mitokondriyal DNA (MT DNA )nikotinamid adenin dinükleotid dehidrojenaz 5 (nd-5) gen dizi değişikliklerinin araştırılması
Investi̇gati̇on of mitochondrial dna ( MTDNA ) 5 ni̇coti̇nami̇de adeni̇ne di̇nucleoti̇de dehydrogenase (ND - 5) gene changes in pathogenesi̇s of inflammatory bowel di̇sease
- Tez No: 409402
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HAKAN AKIN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Gastroenteroloji, Gastroenterology
- Anahtar Kelimeler: Adenozin trifosfat, Crohn hastalığı, DNA, Genler, Kolit-ülseratif, Metabolitler, Mitokondriler, Nikotinamid, Polimorfizm-genetik, İnflamatuar bağırsak hastalıkları, Adenosine triphosphate, Crohn disease, DNA, Genes, Colitis-ulcerative, Metabolites, Mitochondria, Nicotinamide, Polymorphism-genetic, Inflammatory bowel diseases
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
İnflamatuvar Bağırsak Hastalıklarından (İBH) Ülseratif Kolit (ÜK) ve Crohn Hastalığı (CH), mukozada düşük Adenozin Trifosfat (ATP) ile karakterize bir hastalık grubudur. ATP miktarındaki bu düşüş mitokondri fonksiyon bozukluğuyla ilişkilidir. Bu yüzden İBH'ların genetik patogenezinde önemli rol oynayabilecek faktörlerden biri, diğer inflamatuvar hastalıklarda da olduğu gibi mitokondridir. Mitokondriyal enerji metabolizmasını etkileyen SLC22A5 ve UCP2 genlerine ait nükleotit varyantlarının Ülseratif Kolit mukozasında oksidatif kompleks aktivitesinin azalması ve böylece mukozal ATP seviyesinin düşüklüğü ile ilişkili olduğu ortaya çıkarılmıştır. Son yıllarda önemli bir gelişme olarak mitokondriyal DNA polimorfizmlerinin mitokondrial oksidatif fosforilasyon aktivitesini önemli ölçüde etkilediği, deneysel kolitteki inflamasyonun azalmasıyla ilişkili olduğu ve artmış mitokondriyal enerji metabolizmasının bağırsak kriptlerindeki hücresel koruyucu etkiye sahip olduğu saptanmıştır. Bu çalışmadaki amacımız ilk defa mtDNA ND5 geni dizi değişikliklerinin incelenerek İBH ile olası yatkınlık ve risk ilişkilerini araştırmaktır. Çalışmaya 99 ÜK, 101 CH olan hasta ve 89 kontrol birey alındı, kanlarından mitokondriyal DNA izole edildi. Amerikan Ulusalmerkezli Biyoteknoloji Enstitüsü (NCBİ) gen bankasında minör allel frekansı > %10 olan polimorfizmler ND5 geninde mtDNA 13466-14225 nukleotid arası olduğu saptanmış ve bu çalışmada araştırılmasına karar verildi. Tüm dizi değişikliklerinin bulunduğu bölge tespit edilip, bu bölgenin amplifikasyonu için özel primerler tasarlandı. Hedef bölgenin Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile amplifikasyonu optimize ediltikten sonra hedef bölgenin çift yönlü“Sanger”dizileme analizi yapıldı ve bölgedeki tüm dizi değişiklikleri özel bilgisayar yazılımı ile tayin edildi. MtDNA 13780 A/G polimorfizmi Crohn hastalarında anlamlı bulunmuştur ve hastalıkla ilişkili değerlendirmede istatistiksel olarak anlamlılık düzeyine ulaşmıştır (p= 0,0380; Odds ratio= 0. 1321, 95% Cİ: 0,01618 to 1.078). Diğer bir istatistiksel olarak anlamlı bulunan mt DNA 14070 A/G polimofizmidir. Bu genetik polimorfizm hem ÜK hem de CH 'da koruyucu etkiye ulaşacak istatistiksel değere sahiptir. ÜK 'de p< 0.04, CH 'da p<0.02 bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
Ulcerative colitis (UC) and Crohn's Disease constitude the Inflammatory Bowel Disease (IBD) group which are characterized by at low adenosine triphosphate (ATP) in mucous membranes. The reduction in the amount of ATP is associated with the disorder of mitochondrial function. So one of the factors that may play an important role in the pathogenesis of IBD genetics is the mitochondria, as in other inflammatory diseases. The nucleotide variants affecting mitochondrial energy metabolism in UCP 2 and SLC22A5 genes have been shown to be associated with the reduction of oxidative complex activity and with theimpairment of the mucosal ATP levels in Ulcerative Colitis mucosa. It has been shown that mitochondrial DNA polymorphisms has significant influence in mitochondrial oxidative phosphorylation activity. MtDNA polymorphisms were associated with inflammation reduction in experimental colitis and elevated mitochondrial energy metabolism which was found to have a cell protective effect of the crypts in intestine. Our aimin this study isto investigate the possible relationship between IBD and mtDNA ND5 nucleotide variations. 99 patients with Ulcerative Colitis, 101 patients with Crohn Disease and 89 control subjects were included to the study. Genomic DNA is isolated from all study subjects. Nucleotide variations between mtDNA 13466-14225 nucleotides are detected by Sanger Sequencing method. MtDNA ND5 gene 13780 A/G polymorphism was significantly associated with Crohn's disease (p = 0.0380; odds ratio = 0.1321, 95% CI: 0.01618 to 1.078). mtDNA 14070 A/G polymorphism was detected as a protective for Ulcerative Colitis and Crohn Disease (respectively,UC: p <0.04, CH: p <0.02)
Benzer Tezler
- Sıçanlarda oluşturulan deneysel kolit modelindeki hasar mekanizmasında endotelinin rolü
Başlık çevirisi yok
BAHADIR MAHMUT GÜLLÜOĞLU
- Metotreksat ile barsak epiteli hasarı oluşturulan sıçanlarda hesperidinin koruyucu etkisi
Protective effect of hesperidin on methotrexate-induced intestinal epithelial damage in rats
CAN ACIPAYAM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıÇukurova ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM BAYRAM
- İnflamatuvar bağırsak hastalıklarında sarkopeni ve klinik tablo ile ilişkisi
Sarcopenia in inflammatory bowel diseases and its relationship with the clinical course
SEMİH ÖZYURT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
GastroenterolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE NURDAN TÖZÜN
PROF. DR. NESLİAR ESER VARDARELİ
- İnflamatuar barsak hastalıklarında aktif ve remisyon dönemlerinde bakteriyel permeabilite artırıcı protein (BPI) düzeyinin araştırılması
Investigation of the level of bacterial permeability increasing protein (BPI) at active and remission phases of inflammatory bowel diseases
KEMAL EROĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
GastroenterolojiMarmara Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAKAN AKIN
- Sıçanlarda dekstran sodyum sülfat ile oluşturulan deneysel ülseratif kolit modelinde misoprostolün koruyucu etkisi
The protective effect of misoprostol on dextran sodium sulphate-induced ulcerative colitis model in rats
NİHAN KÜÇÜK
Doktora
Türkçe
2020
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET MELLİ