A software-based controller for single-molecule experiments using an atomic force microscope integrated with a magnetic manipulator
Manyetik manipülatöre bağlı atomik kuvvet mikroskobuyla yapılan tek moleküllü deneyler için yazılım temelli kontrolcü
- Tez No: 409247
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. HAMDİ TORUN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği, Electrical and Electronics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tek-molekül teknikleri, karmaşık molekül yapılarının hareketlerini doğrudan gözlemlenmesini imkan kıldığından dolayı, biyomolekülleri incelenmesi için güçlü bir metod haline gelmistir. Atomik kuvvet mikroskopu, nano boyuttaki cisimlerin hareket ettirme kabiliyetinden dolayı en sık kullanılan tek-molekül kuvvet spektroskopisi tekniği olmuştur. Atomik kuvvet mikroskopunu kullanak biomoleküllerin bağ yapıları hakkında daha geniş bilgilere ulaşilabilir, Örneğin moleküller arası etkileşim, bağlardakı kuvvet seviyeleri ve kopma süreleri gibi bir çok bilgilere, AKM ile molekülleri birbirinden çekerek yada iterek ulaşabilriz. Bu calışmamızda moleküller arasındaki kuvveti sabit tutarak, iki molekül arasındaki etkileşimi anlayabilmemizi sağlayan bir yazılım tabanlı PID kontrollü LabVIEW programı geliştirilmiştir. PID kontrolü daha sonra kendi tasarladığımız manyetik ve piezo hareket ettirme sistemi ile entegre edilmiş atomik kuvvet mikroskopu ile test edilmiştir. Bu testler için Heparin ile FGF2 ve Biyotin ile Strepatavidin molekülleri arasındaki bağlar incelenmiş ve raporlanmıştir.
Özet (Çeviri)
Single-molecule methods have become powerful tools to study biomolecules because they allow direct observation of the complex molecular kinetics. Among them atomic force microscope (AFM) is one of the most popular tools due to its capability of nanomanipulations. Various information of biomolecular bonds such as force level, life time, length and their relationship can be derived by pulling molecules in different ways with AFM. In this thesis, a software based PID controller for force clamped experiment that pulls the molecules in a constant force is developed with LabVIEW. Then the controller is verified and characterized in piezo actuation mode and magnetic actuation mode using a customized AFM. Lastly, force clamped experiments with heparin-FGF2 and biotin-streptavidin are performed with the controller and the probabilities of their lifetimes are analyzed statistically.
Benzer Tezler
- Yüksek hızlı atomik kuvvet mikroskobu (YH-AKM) geliştirilmesi ve çeşitli uygulamaları
Development of high speed atomic force microscopy and its applications
ÜMİT ÇELİK
Doktora
Türkçe
2017
Mühendislik Bilimleriİstanbul Teknik ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAKAN ÖZGÜR ÖZER
- Buji ateşlemeli motorlarda çevrim atlatma yönteminin kısmi yüklerde incelenmesi
Skip cycle method investigation at part load conditions of spark ignition engines
BARIŞ DOĞRU
Doktora
Türkçe
2013
Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. OSMAN AKIN KUTLAR
- Differential flatness-based fuzzy controller design for aggressive maneuvering of quadcopters
Çok rotorlu hava araçlarının agresif manevra kontrolü için diferansiyel düzlük tabanlı bulanık kontrolör tasarımı
ÇAĞRI GÜZAY
Doktora
İngilizce
2023
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiKontrol ve Otomasyon Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUFAN KUMBASAR
- An Accurate trajectory control of a servo system using a mc 68000 based controller
Başlık çevirisi yok
ALPTEKİN DERİNKÖK
Yüksek Lisans
İngilizce
1995
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiElektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OKYAY KAYNAK