Köpek ve kedi dışkılarında genişlemiş spektrumlu beta laktamaz ve AMPC beta laktamaz üreten Escherichia coli'nin prevalansının belirlenmesi
Determination of extended spectrum beta-lactamase (ESBL) and AMPC beta-lactamase producing Escherichia coli prevalence in fecal samples of dogs and cats
- Tez No: 408307
- Danışmanlar: PROF. DR. SEYYAL AK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Beta laktamazlar, Dışkı, Escherichia coli, Kediler, Köpekler, Mikrobiyal duyarlılık testleri, Prevalans, Beta lactamases, Feces, Escherichia coli, Cats, Dogs, Microbial sensitivity tests, Prevalence
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, İstanbul ilinde sağlıklı köpek ve kedi dışkılarında, genişlemiş spektrumlu beta laktamaz (GSBL) ve/veya AmpC beta laktamaz üreten Escherichia coli'nin prevalansı ve beta laktamaz genlerinin belirlenmesi amaçlandı. 192 köpek ve 192 kedi dışkı örneği 1 mg/L sefotaksim içeren MacConkey agara ekildi. GSBL ve AmpC beta laktamaz pozitifliği tarama ve doğrulama testleri ile fenotipik olarak tespit edildi. Fenotipik olarak pozitif olduğu belirlenen izolatlarda TEM, SHV, OXA-10, PER-2, CTX-M ve alt grupları ile AmpC genlerinin (CIT, FOX, MOX, EBC, ACC, DHA) varlığı PCR ile araştırıldı. GSBL üreten E.coli prevalansı genotipik olarak köpeklerde %20,3 (n=39) ve kedilerde %8,3 (n=16); AmpC üreten E.coli prevalansı köpeklerde %3,7 (n=7) ve kedilerde %0,6 (n=1) bulundu. GSBL ve/veya AmpC beta laktamaz üreten E.coli'nin köpek izolatlarında, sırasıyla; blaCTX-M Grup 1 (n=39), blaTEM (n=21), blaCIT (n=5), blaSHV (n=2) ve blaMOX (n=1) genlerini içerdiği belirlendi. Kedi izolatlarında, sırasıyla; blaCTX-M Grup 1 (n=13), blaTEM (n=11), blaCTX-M Grup 9 (n=3) ve blaSHV (n=2) genlerini içerdiği belirlendi. Yapılan istatistiksel analiz sonucunda, GSBL ve/veya AmpC üreten E.coli'nin köpeklerde fekal kolonizasyonun önemli olduğu (p<0,001), cinsiyet ve geçmişinde antibiyotik kullanımının önemli olmadığı bulundu. Bu çalışma ile İstanbul'da sağlıklı eşlikçi hayvanlarda GSBL ve AmpC beta laktamaz üreten E.coli varlığı ilk defa ortaya kondu ve köpeğe ait bir E.coli izolatında daha önce insanlarda bildirilmiş fakat hayvanlarda dünya çapında bildirilmemiş olan blaMOX genini içerdiği ilk kez belirlenmiştir. Veteriner hekimlik alanında antibiyotik direncine ilişkin risk faktörlerinin değerlendirildiği sürvey çalışmalarına ihtiyaç olduğu, etkili kontrol önlemleri ile direnç gelişiminin sınırlandırılmasına yönelik çözüm önerilerinin geliştirilmesi gerektiği sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
The aims of this study were investigate the prevalence and genes of extended-spectrum beta lactamase (ESBL) and/or AmpC beta lactamase producing Escherichia coli from feces of healthy dogs and cats in Istanbul. Fecal samples of dogs (n=192) and cats (n=192) were collected and cultured on MacConkey agar plates containing 1 mg/L cefotaxime. ESBL and AmpC positivity were phenotypically detected by monitoring and confirmation tests. TEM, SHV, OXA-10, PER-2, CTX-M with subgroups and AmpC genes (CIT, FOX, MOX, EBC, ACC, DHA) were investigated by PCR. Prevalence of ESBL producing E.coli was demonstrated 20.3% (n=39) in dogs and 8.3% (n=16) in cats; AmpC producing E.coli 3.7% (n=7) in dogs and 0.6% (n=1) in cats. Canine isolates contained, respectively; blaCTX-M Group 1 (n=39), blaTEM (n=21), blaCIT (n=5), blaSHV (n=2) and blaMOX (n=1). Feline isolates contained, respectively; blaCTX-M Group 1 (n=13), blaTEM (n=11), blaCTX-M Group 9 (n=3) and blaSHV (n=2). Association fecal colonisation of ESBL and/or AmpC producing E.coli in dogs was found statistically significant (p<0.001). Sex and the history of antibiotic treatment were found insignificant. In this study, the presence of ESBL and AmpC producing E.coli from healthy companion animals in Istanbul was determined and one canine E.coli isolate harboured blaMOX AmpC gene, which has been previously reported in humans but not been reported in animals in worldwide for the first time. The survey studies in veterinary medicine, which evaluated risk factors related to antibiotic resistance and solutions to limit the development of resistance with effective control measures are need to be developed.
Benzer Tezler
- Kedi ve köpeklerde genişlemiş spektrumlu beta laktamaz, AMPC beta laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella pneumoniae izolatlarının prevalansı ve moleküler tiplendirmesi
The prevalence and molecular typing of extended spectrum beta lactamase and ampc beta lactamase producer escherichia coli and klebsiella pneumoniae isolates of cats and dogs
MERVE GİZEM SEZENER
Doktora
Türkçe
2022
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARZU FINDIK
- Erzurum ilindeki kedi ve köpek dışkılarında campylobacter türlerinin prevalansının araştırılması
Investigation of the prevalence of campylobacter species from cat and dog feces in Erzurum province
MUSTAFA YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiAtatürk ÜniversitesiVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET CEMAL ADIGÜZEL
- Marmara Bölgesi'nde bulunan süt işletmelerindeki inekler ve işletme çevresinde E. coli O157:H7 varlığının araştırılması
Detection of E. coli O157:H7 occurrence in dairy cattle and farm environment in the Marmara Region of Turkey
ESİN BİRDAL
- Sağlıklı görünen hayvanların dışkılarından izole edilen escherichia coli suşlarının biyokimyasal, enterotoksijenik ve verotoksijenik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of biochemical, enterotoxigenic and verotoxigenic properties of escherichia coli strains isolated from faeces of healty animals
TİMUR GÜLHAN
Doktora
Türkçe
2003
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BANUR BOYNUKARA
- Hayvansal orijinli escherichia coli izolatlarının filogruplarının belirlenmesi ve virulens genlerinin analizi
Determination of phylogroups of escherichia coli isolates of animal origin and analysis of virulence genes
EMRE KARAKAYA
Doktora
Türkçe
2021
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FUAT AYDIN