Güneydoğu Anadolu bölgesinde buğdayda kök ve kök boğazı çürüklüğü etmeni Fusarium spp.'nin tespiti ve Fusarium graminearum small secreted protein genlerinin karakterizasyonu
Determination of Fusarium spp. causing root and crown rot on wheat at Southeast Anatolia and characterization of Fusarium graminearum small secreted protein genes
- Tez No: 406173
- Danışmanlar: PROF. DR. BERNA TUNALI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Buğday, Fusarium, Kök boğazı çürüklüğü, Wheat, Fusarium, Root crown rot
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma, Güneydoğu Anadolu Bölgesi'nde buğday alanlarında kök ve kök boğazı çürüklüğüne neden olan Fusarium türlerinin tespiti ve bir model organizma olan F. graminearum'a ait bir dizi fungal efektör adayı Small Secreted Protein (SSP) geninin karakterizasyonu yoluyla, fungal efektör adaylarının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Diyarbakır, Şanlıurfa, Mardin ve Adıyaman illerine ait buğday üretim alanlarından 19 farklı türe ait 143 Fusarium izolatı elde edilmiştir. Teşhisi yapılan türler içerisinde en yoğun olarak %17.4 ile F. proliferatum izole edilirken, en önemli buğday kök çürüklüğü etmenlerinden F. culmorum ve F. pseudograminearum'un izolasyon sıklığı %13 olarak bulunmuştur. F. graminearum secretome'unu oluşturan 1369 gen içerisinden tipik fungal efektör kriterlerini karşılayan 16 adet gen seçilmiş ve bu genlerin sekans analizleri yoluyla karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. Elde edilen sekans verileri üzerinden dünyanın farklı bölgelerinden 9 farklı F. graminearum, 4 adet F. culmorum, 2 adet F. pseudograminearum ve 1 adet F. venenatum izolatında bu genlerin genetik çeşitliliği, oluşan mutasyonların proteinlerin yapısına etkileri incelenmiştir. Seçilen genlerin tam genom sekansı tamamlanan diğer funguslardaki varlığı ve benzerlik durumları ortaya konulmuştur. Bu bilgilerin çalışılan türlerin ayrımında ve F. graminearum efektörlerinin belirlenmesinde kullanım olanakları tartışılmıştır.
Özet (Çeviri)
This study aimed that determination of Fusarium spp. causing root and crown rot on wheat at Southeast Anatolia and analysis of Small Secreted Proteins (SSPs) of F. graminearum, which is a model organism for plant-fungi interactions, via sequence analysis. 143 Fusarium isolates including 19 species were obtained from wheat producing areas at Diyarbakır, Şanlıurfa, Mardin and Adıyaman provinces. Although the most frequently isolated species was F. proliferatum at the rate of 17.4%, F. pseudograminearum and F. culmorum which were the most important crown rot pathogens were isolated at 13% of totally isolated Fusarium isolates. Sixteen genes reflecting typical fungal effector characteristics within 1369 F.graminearum secreted genes were selected and characterized. By using the sequence data, genetic variation, effects of occured mutation on protein structure were invastigated within 9 F. graminearum, 4 F. culmorum, 2 F. pseudograminearum and 1 F. venenatum isolate obtained from different part of the world. Presence of selected genes within the fungal species of which whole genome analysis were finished and their homology rate were clearified. Possibilities of usage of these knowledge were discussed.
Benzer Tezler
- Güneydoğu Anadolu Bölgesi yerel makarnalık buğday çeşitlerinin kök ve kardeş gelişiminin verim ve verim öğeleri üzerine etkisi
The Effect of rooting and trillering on yield and yield components of durum wheat landiaces in south east Anatolia region
ERDEM YAVUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
ZiraatDicle ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DURMUŞ ALİ ATALAY
YRD. DOÇ. DR. AYDIN ALP
- Güneydoğu Anadolu Bölgesi buğday çeşitlerinin kuraklığa dayanıklılıklarının bazı tarımsal ve fizyolojik parametreler ile belirlenmesi
Determination of drought resistance of Southeast Anatolia Region wheat cultivars with some agricultural and physiological parameters
ALİ ASLAN
- Fıstık atıklarından elde edilen biyoçarın farklı tekstüre sahip topraklarda besin elementi yıkanmasına ve bitki gelişimine etkisi
Effect of biochair obtained from pictacia wastes on nutrient washing and plant development in different textures soils
KÜBRA POLAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatSiirt ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MESUT BUDAK
DOÇ. DR. HARUN BEKTAŞ
- Güneydoğu Anadolu bölgesinde hububat hortumluböceği (Pachytychius hordei (Brull?) (Coleoptera: curculionidae)'nin yayılış alanları ve biyo-ekolojisi üzerinde araştırmalar
Investigations on the distribution and bio-ecology of pachytychius hordei (Brull?) (Coleoptera: Curculionidae) in southeast Anatolian region
ZİYA ŞİMŞEK
- Antalya'da depolanmış ürün ve materyalde zararlı böcek ve akar türleri.Yayılışları ve habitatları üzerine araştırmalar.
Başlık çevirisi yok
YILDIRIM YANAROĞLU